20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_3295 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_3295  hypothetical protein  100 
 
 
255 aa  522  1e-147  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.435139 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0596  integrase family protein  50.26 
 
 
515 aa  189  4e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.687796  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0474  integrase family protein  47.94 
 
 
442 aa  188  7e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0606  hypothetical protein  50.81 
 
 
505 aa  174  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0175699  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0402  hypothetical protein  50.81 
 
 
505 aa  174  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.124303  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0569  hypothetical protein  49.46 
 
 
114 aa  87.4  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1085  hypothetical protein  31.96 
 
 
413 aa  68.9  0.00000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1272  phage integrase family protein  29.02 
 
 
425 aa  68.9  0.00000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000707551  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1227  integrase family protein  32.75 
 
 
424 aa  67.4  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149921  normal  0.536296 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0065  hypothetical protein  29.52 
 
 
417 aa  59.7  0.00000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2529  phage integrase  25.68 
 
 
375 aa  55.5  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.153189  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2240  Phage integrase  31.35 
 
 
406 aa  53.9  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0807  integrase protein  28.07 
 
 
181 aa  53.5  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2959  phage integrase family protein  26.32 
 
 
444 aa  53.1  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0924112  normal  0.542634 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3493  integrase family protein  27.32 
 
 
409 aa  50.8  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.247982  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4029  integrase family protein  29.13 
 
 
467 aa  49.7  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.0270341 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0614  integrase family protein  29.65 
 
 
476 aa  47.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3752  phage integrase family protein  38.37 
 
 
422 aa  46.2  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.538338  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  36.26 
 
 
411 aa  44.3  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1679  phage-related integrase  29.69 
 
 
410 aa  44.7  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>