More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3752 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3752  phage integrase family protein  100 
 
 		 422 aa  857    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.538338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2401  phage integrase  80.99 
 
 		 242 aa  398  1e-109  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.340015  normal  0.0277032 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0620  integrase family protein  37.9 
 
 		 452 aa  256  8e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1864  integrase family protein  41.34 
 
 		 429 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0154  phage integrase family protein  36.67 
 
 		 451 aa  251  1e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.543339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4157  integrase family protein  38.57 
 
 		 432 aa  251  1e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.225884  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2770  integrase family protein  36.82 
 
 		 452 aa  248  2e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.251515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3806  phage integrase  36.73 
 
 		 451 aa  246  4.9999999999999997e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0304559  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7820  putative phage integrase  36.89 
 
 		 451 aa  245  9e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4340  phage integrase family protein  37.29 
 
 		 420 aa  219  7.999999999999999e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.185587  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2535  phage integrase  33.41 
 
 		 463 aa  210  4e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2399  hypothetical protein  78.99 
 
 		 137 aa  202  9.999999999999999e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.229698  normal  0.0250128 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3853  integrase family protein  31.32 
 
 		 500 aa  172  1e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  32.12 
 
 		 393 aa  171  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0255  phage integrase  31.73 
 
 		 430 aa  167  4e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  31.57 
 
 		 397 aa  163  6e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3091  phage integrase family protein  32.5 
 
 		 384 aa  161  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  31.31 
 
 		 411 aa  160  4e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3738  hypothetical protein  30.61 
 
 		 384 aa  151  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4029  integrase family protein  26.63 
 
 		 467 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.0270341 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1584  phage integrase family protein  27.23 
 
 		 376 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4399  integrase family protein  27.23 
 
 		 376 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.685705  normal  0.0426652 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  26.51 
 
 		 388 aa  114  4.0000000000000004e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2959  phage integrase family protein  26.88 
 
 		 444 aa  114  4.0000000000000004e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0924112  normal  0.542634 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1247  putative phage related integrase  26.68 
 
 		 434 aa  113  6e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1244  phage integrase family protein  27.25 
 
 		 399 aa  113  6e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.797454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1236  phage integrase  26.82 
 
 		 399 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.449507  normal  0.10874 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4137  phage integrase family protein  26 
 
 		 400 aa  111  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.031573  normal  0.207643 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0044  phage integrase family site specific recombinase  26.99 
 
 		 376 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.374231  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1182  putative phage integrase  26 
 
 		 400 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.383522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1679  phage-related integrase  27.57 
 
 		 410 aa  110  3e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  27.53 
 
 		 402 aa  111  3e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36120  Phage integrase  26.97 
 
 		 400 aa  109  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2622  integrase protein  26.9 
 
 		 400 aa  108  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.561112  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3747  integrase  25.58 
 
 		 399 aa  108  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3721  phage integrase family protein  26.99 
 
 		 376 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2625  phage integrase family protein  24.69 
 
 		 400 aa  104  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.046264 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1227  integrase family protein  26.67 
 
 		 424 aa  103  7e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149921  normal  0.536296 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0671  phage integrase family protein  25.45 
 
 		 401 aa  103  8e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.707055 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31280  putative integrase  24.94 
 
 		 401 aa  102  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000488668  unclonable  4.84268e-22 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1865  integrase family protein  24.94 
 
 		 401 aa  101  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.94549  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  26.96 
 
 		 400 aa  99.4  1e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  0.00000971423 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3045  phage integrase  26.28 
 
 		 415 aa  97.8  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.172973 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2745  integrase family protein  26.28 
 
 		 415 aa  97.8  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.99512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2601  integrase family protein  26.28 
 
 		 399 aa  97.8  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.533125 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  24.12 
 
 		 379 aa  96.7  7e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3540  integrase family protein  25.77 
 
 		 399 aa  96.3  9e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2240  Phage integrase  26.49 
 
 		 406 aa  94.7  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1583  phage integrase family protein  26.18 
 
 		 451 aa  93.6  6e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1016  integrase family protein  26.33 
 
 		 412 aa  93.2  7e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2964  phage integrase  26.4 
 
 		 387 aa  91.7  2e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4398  integrase family protein  25.69 
 
 		 451 aa  90.9  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0364227  hitchhiker  0.00879025 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3720  phage integrase family protein  25.94 
 
 		 451 aa  90.5  5e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0045  phage integrase family site specific recombinase  25.69 
 
 		 456 aa  87.4  4e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.869382  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3498  integrase family protein  24.34 
 
 		 486 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0306  phage integrase  26.14 
 
 		 417 aa  85.5  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0497  integrase family protein  26.26 
 
 		 412 aa  84  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3724  putative integrase protein  43.2 
 
 		 143 aa  84  0.000000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3493  integrase family protein  23.61 
 
 		 409 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.247982  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0805  integrase family protein  23.75 
 
 		 433 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00339873 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3396  integrase family protein  27.69 
 
 		 414 aa  80.5  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  26.32 
 
 		 413 aa  80.5  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1272  phage integrase family protein  24.37 
 
 		 425 aa  80.1  0.00000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000707551  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0807  integrase protein  36.14 
 
 		 181 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2136  phage integrase family protein  27.13 
 
 		 389 aa  78.2  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0404563  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3683  phage integrase family protein  26.35 
 
 		 444 aa  77.4  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1170  phage integrase family protein  27.31 
 
 		 412 aa  76.6  0.0000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00333929  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0805  site-specific recombinase/integrase  27.41 
 
 		 396 aa  75.9  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0116297  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2900  phage integrase  24.31 
 
 		 391 aa  76.3  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211341  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0919  integrase family protein  24.39 
 
 		 448 aa  73.6  0.000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.295922  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  24.38 
 
 		 413 aa  73.2  0.000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1844  phage integrase family protein  23.47 
 
 		 426 aa  71.6  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2460  integrase family protein  25.13 
 
 		 415 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2612  phage integrase family protein  23.19 
 
 		 443 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1370  phage integrase  21.05 
 
 		 423 aa  68.9  0.0000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000628694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0810  site-specific recombinase/integrase  26.63 
 
 		 482 aa  69.3  0.0000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0879139  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6722  integrase family protein  25.25 
 
 		 413 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0065  hypothetical protein  25.29 
 
 		 417 aa  67  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  23.93 
 
 		 412 aa  66.6  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1066  hypothetical protein  23 
 
 		 414 aa  66.2  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1088  hypothetical protein  23.25 
 
 		 414 aa  65.1  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2675  hypothetical protein  23.86 
 
 		 443 aa  65.5  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0366  integrase family protein  24.51 
 
 		 439 aa  64.7  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.134449 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3540  phage integrase family protein  21.79 
 
 		 420 aa  62.4  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.216413  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3121  phage integrase family protein  23.08 
 
 		 449 aa  62.8  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  26.41 
 
 		 397 aa  62.8  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2499  phage integrase family protein  25.82 
 
 		 381 aa  62  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.005662  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0072  hypothetical protein  21.89 
 
 		 406 aa  61.6  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1371  phage integrase family protein  22.78 
 
 		 453 aa  61.2  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  25.37 
 
 		 421 aa  60.5  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0064  integrative genetic element Gsu32, integrase  22.73 
 
 		 439 aa  60.1  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3114  phage integrase family protein  23.25 
 
 		 284 aa  59.7  0.00000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  25.85 
 
 		 404 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  41.67 
 
 		 295 aa  59.3  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3082  phage integrase family protein  22.99 
 
 		 437 aa  58.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0292  phage integrase family protein  24.5 
 
 		 440 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0939  integrase family protein  22.03 
 
 		 357 aa  58.2  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0828563 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3805  integrase family protein  24.81 
 
 		 450 aa  57.8  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3867  phage integrase  25.97 
 
 		 400 aa  57.4  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3340  phage integrase family protein  25.36 
 
 		 452 aa  57.4  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.58116  normal  0.0453376 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>