More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_2612 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_2612  phage integrase family protein  100 
 
 
443 aa  908    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3114  phage integrase family protein  97.12 
 
 
284 aa  555  1e-157  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2964  phage integrase  30.31 
 
 
387 aa  153  5e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1016  integrase family protein  27.16 
 
 
412 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0919  integrase family protein  27.63 
 
 
448 aa  136  9e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.295922  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  26.8 
 
 
393 aa  116  6.9999999999999995e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  27.03 
 
 
402 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  28.89 
 
 
397 aa  113  5e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0234  phage integrase family protein  29.41 
 
 
416 aa  112  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  26.6 
 
 
388 aa  111  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40500  Phage integrase  27.27 
 
 
401 aa  111  3e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2093  integrase family protein  25.81 
 
 
400 aa  110  6e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  29.38 
 
 
413 aa  109  9.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3738  hypothetical protein  27.74 
 
 
384 aa  107  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  25.6 
 
 
400 aa  107  5e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  0.00000971423 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0395  phage integrase family protein  26.59 
 
 
396 aa  107  5e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.436905  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3091  phage integrase family protein  27.91 
 
 
384 aa  106  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  29.21 
 
 
411 aa  105  2e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3396  integrase family protein  24.58 
 
 
414 aa  103  9e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194125  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3823  phage-related integrase  25.92 
 
 
403 aa  99.8  8e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1101  site-specific recombinase phage integrase family protein  26.67 
 
 
399 aa  99.4  1e-19  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000786057  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1721  phage integrase  25.66 
 
 
413 aa  99  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.749059  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0306  site-specific recombinase, phage integrase family  25.76 
 
 
410 aa  99  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.644103 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3887  integrase family protein  23.48 
 
 
404 aa  97.1  6e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5344  site-specific recombinase, phage integrase family  25.38 
 
 
402 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1046  integrase family protein  25.13 
 
 
410 aa  95.1  2e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000192278  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3095  integrase family protein  27.1 
 
 
392 aa  95.1  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000033184 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3353  phage integrase family protein  24.43 
 
 
393 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0927  phage integrase family protein  27.84 
 
 
425 aa  94  5e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000881827 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  24.38 
 
 
394 aa  94  5e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4153  phage integrase family site specific recombinase  23.41 
 
 
397 aa  93.6  7e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.448481  normal  0.0214927 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1290  prophage CP4-like integrase  25.72 
 
 
404 aa  93.2  8e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3281  integrase family protein  23.06 
 
 
387 aa  92.8  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2977  integrase family protein  23.84 
 
 
429 aa  92.4  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1997  integrase family protein  27.27 
 
 
400 aa  92  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.726133 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3266  site-specific recombinase, phage integrase family  25.07 
 
 
367 aa  91.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220935  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  24.02 
 
 
402 aa  91.3  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2365  Phage integrase  24.92 
 
 
404 aa  91.7  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2535  phage integrase  25.81 
 
 
463 aa  91.3  3e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2875  phage integrase family protein  26.03 
 
 
422 aa  91.3  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.698524  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2751  integrase family protein  25.63 
 
 
415 aa  90.9  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.606598  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0374  site-specific recombinase, phage integrase family  24.35 
 
 
396 aa  90.9  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324346  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1839  phage integrase family protein  24.94 
 
 
414 aa  90.9  4e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2428  phage integrase family protein  27.32 
 
 
398 aa  90.9  5e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0129894  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0925  integrase family protein  24.26 
 
 
404 aa  90.5  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0884  phage integrase family site specific recombinase  24.26 
 
 
404 aa  90.5  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2917  phage integrase family site specific recombinase  25.53 
 
 
415 aa  90.1  6e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.121366  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3853  phage integrase family site specific recombinase  24.26 
 
 
404 aa  90.1  7e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0234676 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1761  integrase family protein  27.5 
 
 
361 aa  89.4  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3149  integrase family protein  24.01 
 
 
402 aa  89  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4029  integrase family protein  23.66 
 
 
467 aa  89  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.0270341 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1357  phage family integrase  23.86 
 
 
411 aa  89.4  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.183355  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1632  phage integrase  27.68 
 
 
413 aa  89  1e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.986406  hitchhiker  0.00880856 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2136  phage integrase family protein  25.6 
 
 
389 aa  89.4  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0404563  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  26.19 
 
 
379 aa  88.6  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1100  site-specific recombinase, phage integrase family  24.01 
 
 
395 aa  89  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0805  integrase family protein  26.19 
 
 
433 aa  88.6  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00339873 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0997  integrase family protein  26.22 
 
 
410 aa  88.2  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2463  phage integrase family protein  26.97 
 
 
414 aa  88.6  2e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.384114  normal  0.0605266 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1354  phage integrase  24.92 
 
 
404 aa  88.2  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.226935  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0637  phage integrase family protein  25.19 
 
 
411 aa  87.8  3e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.102856 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2021  phage integrase family protein  23.12 
 
 
418 aa  87.8  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.713949  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2953  phage integrase family protein  25.06 
 
 
408 aa  88.2  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.887066  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1584  phage integrase family protein  24.87 
 
 
376 aa  87.4  4e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6722  integrase family protein  26.57 
 
 
413 aa  87.4  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0072  hypothetical protein  27.59 
 
 
406 aa  87.4  5e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1631  integrase family protein  26.35 
 
 
409 aa  87  5e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1262  integrase family protein  24.81 
 
 
418 aa  87.4  5e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.528936  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1254  integrase family protein  23.75 
 
 
406 aa  87  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3385  site-specific recombinase, phage integrase family  23.59 
 
 
391 aa  87  6e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.059991  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2638  integrase  24.07 
 
 
409 aa  86.7  8e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  decreased coverage  9.23997e-16 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3721  phage integrase family protein  25.58 
 
 
376 aa  86.7  8e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0044  phage integrase family site specific recombinase  25.52 
 
 
376 aa  86.3  9e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.374231  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0065  hypothetical protein  23.21 
 
 
417 aa  86.3  9e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2489  putative integrase protein  24.23 
 
 
417 aa  85.9  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0757  integrase family protein  23.35 
 
 
419 aa  86.3  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.731198  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0217  phage-related integrase  26.26 
 
 
413 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.838235  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3867  phage integrase  26.46 
 
 
400 aa  86.3  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0061  integrase family protein  22.22 
 
 
396 aa  85.1  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1610  integrase family protein  23.75 
 
 
394 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0939795  normal  0.722179 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4399  integrase family protein  25.32 
 
 
376 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.685705  normal  0.0426652 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1188  phage integrase family protein  26.33 
 
 
419 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2828  integrase family protein  22.57 
 
 
396 aa  84.7  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2924  integrase family protein  24.41 
 
 
390 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0444  integrase family protein  27.72 
 
 
461 aa  84.3  0.000000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.737271 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0108  integrase family protein  23.59 
 
 
389 aa  84.3  0.000000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4470  putative phage integrase  25 
 
 
399 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.052147 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2421  phage integrase family protein  25.15 
 
 
404 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.359769  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0053  integrase family protein  23.59 
 
 
391 aa  84  0.000000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.613927 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3617  phage integrase family protein  23.69 
 
 
390 aa  84  0.000000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0681  integrase family protein  23.71 
 
 
401 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3306  Phage integrase  26.87 
 
 
450 aa  83.6  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.889733  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2830  phage integrase  23 
 
 
412 aa  83.6  0.000000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.209333  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5032  integrase  24.13 
 
 
417 aa  84  0.000000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03516  Int  24.56 
 
 
394 aa  83.6  0.000000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.465426  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0666  integrase  24.63 
 
 
395 aa  83.6  0.000000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.214947  hitchhiker  0.000000824162 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03468  hypothetical protein  24.56 
 
 
394 aa  83.6  0.000000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.457385  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  27.44 
 
 
413 aa  83.2  0.000000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2870  integrase family protein  24.18 
 
 
404 aa  83.2  0.000000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2777  phage integrase family protein  25.76 
 
 
414 aa  83.2  0.000000000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.179227 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>