More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2136 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2136  phage integrase family protein  100 
 
 		 389 aa  803    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0404563  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2240  Phage integrase  30.35 
 
 		 406 aa  145  8.000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1679  phage-related integrase  31.27 
 
 		 410 aa  144  2e-33  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3498  integrase family protein  28.9 
 
 		 486 aa  144  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0065  hypothetical protein  27.36 
 
 		 417 aa  143  5e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1227  integrase family protein  29.15 
 
 		 424 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149921  normal  0.536296 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1085  hypothetical protein  28.23 
 
 		 413 aa  130  6e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2964  phage integrase  28.57 
 
 		 387 aa  118  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3493  integrase family protein  29.13 
 
 		 409 aa  116  6e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.247982  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0919  integrase family protein  30.13 
 
 		 448 aa  116  6e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.295922  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1370  phage integrase  25.94 
 
 		 423 aa  109  7.000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000628694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1272  phage integrase family protein  25.48 
 
 		 425 aa  109  7.000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000707551  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  28.45 
 
 		 393 aa  105  2e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  27.34 
 
 		 400 aa  102  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  0.00000971423 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3323  integrase family protein  24.71 
 
 		 441 aa  99  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  27.42 
 
 		 411 aa  97.8  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1016  integrase family protein  25.61 
 
 		 412 aa  97.8  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3091  phage integrase family protein  26.23 
 
 		 384 aa  97.1  5e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0845  phage integrase  24.94 
 
 		 457 aa  96.7  6e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1326  phage integrase family protein  24.94 
 
 		 457 aa  96.7  6e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.558955  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2535  phage integrase  26.54 
 
 		 463 aa  94.7  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0094  Phage integrase  24.55 
 
 		 449 aa  93.6  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000297047  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7820  putative phage integrase  25.91 
 
 		 451 aa  93.6  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  27.57 
 
 		 397 aa  93.2  8e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2770  integrase family protein  25.58 
 
 		 452 aa  90.1  6e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.251515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2612  phage integrase family protein  25.6 
 
 		 443 aa  89.4  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3806  phage integrase  24.16 
 
 		 451 aa  89.4  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0304559  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3747  integrase  25.81 
 
 		 399 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  26.98 
 
 		 402 aa  88.2  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0614  integrase family protein  24.72 
 
 		 476 aa  88.2  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2622  integrase protein  26.61 
 
 		 400 aa  84.3  0.000000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.561112  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3340  phage integrase family protein  31.25 
 
 		 452 aa  84.3  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.58116  normal  0.0453376 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1236  phage integrase  25.95 
 
 		 399 aa  84.3  0.000000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.449507  normal  0.10874 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0620  integrase family protein  25 
 
 		 452 aa  83.6  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0686  integrase family protein  24.29 
 
 		 472 aa  83.6  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0671  phage integrase family protein  26.2 
 
 		 401 aa  82.8  0.000000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.707055 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36120  Phage integrase  25.48 
 
 		 400 aa  82.8  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  25.63 
 
 		 388 aa  82.4  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0805  site-specific recombinase/integrase  25.49 
 
 		 396 aa  81.6  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0116297  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0810  site-specific recombinase/integrase  25.77 
 
 		 482 aa  81.6  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0879139  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1182  putative phage integrase  24.11 
 
 		 400 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.383522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4137  phage integrase family protein  24.11 
 
 		 400 aa  82  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.031573  normal  0.207643 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3738  hypothetical protein  24.86 
 
 		 384 aa  81.3  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1526  phage integrase  28.57 
 
 		 440 aa  80.9  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0292  phage integrase family protein  23.2 
 
 		 440 aa  80.5  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2601  integrase family protein  25.41 
 
 		 399 aa  80.1  0.00000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.533125 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3540  integrase family protein  25.41 
 
 		 399 aa  80.1  0.00000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2745  integrase family protein  25.41 
 
 		 415 aa  79.7  0.00000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.99512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3045  phage integrase  25.41 
 
 		 415 aa  79.7  0.00000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.172973 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2956  integrase family protein  25.06 
 
 		 487 aa  78.2  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1864  integrase family protein  23.43 
 
 		 429 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0497  integrase family protein  24.86 
 
 		 412 aa  78.2  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1844  phage integrase family protein  24.66 
 
 		 426 aa  75.5  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2463  phage integrase family protein  26.26 
 
 		 414 aa  75.9  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.384114  normal  0.0605266 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4029  integrase family protein  23.94 
 
 		 467 aa  75.1  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.0270341 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2892  phage integrase family protein  26.45 
 
 		 423 aa  74.3  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.196545 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2717  Phage integrase  23.97 
 
 		 479 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0154  phage integrase family protein  23.5 
 
 		 451 aa  73.6  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.543339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3114  phage integrase family protein  27.11 
 
 		 284 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3028  putative phage integrase family protein  25.89 
 
 		 486 aa  73.6  0.000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02509  Fels-2 prophage protein  26.69 
 
 		 409 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.291445  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  24.08 
 
 		 413 aa  72.4  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02473  hypothetical protein  26.69 
 
 		 409 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.36664  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2905  phage integrase family protein  26.69 
 
 		 436 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1244  phage integrase family protein  24.93 
 
 		 399 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.797454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2959  phage integrase family protein  26.14 
 
 		 444 aa  71.2  0.00000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0924112  normal  0.542634 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2217  integrase family protein  26.68 
 
 		 418 aa  70.9  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.664863  normal  0.427624 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0596  integrase family protein  25.3 
 
 		 515 aa  70.5  0.00000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.687796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  29.41 
 
 		 413 aa  70.9  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3752  phage integrase family protein  26.36 
 
 		 422 aa  70.1  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.538338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2359  integrase family protein  25.44 
 
 		 398 aa  69.7  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.522134  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4340  phage integrase family protein  23.83 
 
 		 420 aa  68.9  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.185587  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4157  integrase family protein  25.06 
 
 		 432 aa  68.9  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.225884  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  24.23 
 
 		 412 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2900  phage integrase  22.5 
 
 		 391 aa  67  0.0000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0496  phage integrase  27.96 
 
 		 418 aa  67  0.0000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3805  integrase family protein  27.51 
 
 		 450 aa  66.6  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3461  integrase family protein  27.17 
 
 		 435 aa  66.2  0.0000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.538189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0606  hypothetical protein  24.92 
 
 		 505 aa  66.6  0.0000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0175699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0402  hypothetical protein  24.92 
 
 		 505 aa  66.6  0.0000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.124303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3995  phage integrase family protein  30.41 
 
 		 415 aa  66.2  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000158235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2093  integrase family protein  25 
 
 		 400 aa  65.9  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3853  integrase family protein  30.88 
 
 		 500 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2952  phage integrase family protein  25.39 
 
 		 397 aa  64.3  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  3.20289e-17 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2777  phage integrase family protein  23.56 
 
 		 414 aa  64.7  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.179227 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0474  integrase family protein  24.86 
 
 		 442 aa  63.9  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0255  phage integrase  26.23 
 
 		 430 aa  63.9  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0317  phage integrase  25.59 
 
 		 404 aa  63.9  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1337  integrase family protein  25.87 
 
 		 392 aa  63.5  0.000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0155558  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2526  Phage integrase  23.49 
 
 		 481 aa  63.5  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000237436  normal  0.0434699 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0395  phage integrase family protein  22.22 
 
 		 396 aa  63.5  0.000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.436905  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4605  phage integrase family protein  23.32 
 
 		 418 aa  63.5  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.801465  normal  0.0167588 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1237  integrase family protein  25.13 
 
 		 401 aa  63.2  0.000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.184026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0357  integrase family protein  26.21 
 
 		 389 aa  62.8  0.000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1905  hypothetical protein  29.66 
 
 		 366 aa  61.6  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.397006  hitchhiker  0.00000424663 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1063  integrase family protein  27.61 
 
 		 398 aa  62  0.00000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2460  integrase family protein  26.43 
 
 		 415 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0644  integrase family protein  26.13 
 
 		 406 aa  60.8  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2499  phage integrase family protein  28.71 
 
 		 381 aa  60.5  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.005662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0775  phage integrase family protein  26.28 
 
 		 286 aa  60.5  0.00000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0341069  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>