More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_3114 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_3114  phage integrase family protein  100 
 
 		 284 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2612  phage integrase family protein  97.12 
 
 		 443 aa  555  1e-157  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2964  phage integrase  29.84 
 
 		 387 aa  100  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0919  integrase family protein  27.8 
 
 		 448 aa  99.8  4e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.295922  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1016  integrase family protein  26.15 
 
 		 412 aa  95.1  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  27.96 
 
 		 413 aa  90.9  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2093  integrase family protein  26.52 
 
 		 400 aa  89  9e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0395  phage integrase family protein  27.78 
 
 		 396 aa  87.8  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.436905  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0234  phage integrase family protein  29.96 
 
 		 416 aa  82.4  0.000000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0927  phage integrase family protein  29 
 
 		 425 aa  82  0.000000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000881827 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40500  Phage integrase  27.27 
 
 		 401 aa  80.1  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4029  integrase family protein  26.04 
 
 		 467 aa  80.1  0.00000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.0270341 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3823  phage-related integrase  25.78 
 
 		 403 aa  79.7  0.00000000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3396  integrase family protein  25.2 
 
 		 414 aa  79  0.00000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0306  site-specific recombinase, phage integrase family  25.29 
 
 		 410 aa  78.6  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.644103 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0064  integrative genetic element Gsu32, integrase  26.38 
 
 		 439 aa  77.8  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3095  integrase family protein  25.86 
 
 		 392 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000033184 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  25.18 
 
 		 393 aa  75.9  0.0000000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  28.52 
 
 		 413 aa  75.5  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3266  site-specific recombinase, phage integrase family  25.42 
 
 		 367 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.220935  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2136  phage integrase family protein  27.11 
 
 		 389 aa  73.6  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0404563  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1101  site-specific recombinase phage integrase family protein  28.41 
 
 		 399 aa  72.8  0.000000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000786057  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0805  integrase family protein  27.45 
 
 		 433 aa  72  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00339873 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0064  Phage integrase  26.53 
 
 		 420 aa  71.6  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1997  integrase family protein  25.38 
 
 		 400 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.726133 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3738  hypothetical protein  26.26 
 
 		 384 aa  71.6  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  24.19 
 
 		 394 aa  71.2  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2211  phage integrase  24.91 
 
 		 423 aa  70.9  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.684899  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4153  phage integrase family site specific recombinase  24.05 
 
 		 397 aa  70.1  0.00000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.448481  normal  0.0214927 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  24.91 
 
 		 400 aa  70.1  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  0.00000971423 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1046  integrase family protein  24.49 
 
 		 410 aa  70.1  0.00000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000192278  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2977  integrase family protein  22.34 
 
 		 429 aa  69.7  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3091  phage integrase family protein  26.85 
 
 		 384 aa  69.7  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  26.14 
 
 		 397 aa  69.3  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0072  hypothetical protein  26.33 
 
 		 406 aa  68.9  0.00000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  24.19 
 
 		 402 aa  68.9  0.00000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3997  integrase family protein  26.37 
 
 		 419 aa  68.2  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0444  integrase family protein  27.81 
 
 		 461 aa  68.6  0.0000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.737271 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1721  phage integrase  23.35 
 
 		 413 aa  68.2  0.0000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.749059  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6722  integrase family protein  26.79 
 
 		 413 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  26.1 
 
 		 388 aa  67.8  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3281  integrase family protein  22.22 
 
 		 387 aa  68.2  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1088  hypothetical protein  23.93 
 
 		 414 aa  67.8  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1290  prophage CP4-like integrase  24 
 
 		 404 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3540  phage integrase family site specific recombinase  27.13 
 
 		 411 aa  67.4  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000292707  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3372  integrase family protein  24.14 
 
 		 601 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0809  phage integrase family site specific recombinase  25.69 
 
 		 419 aa  67.4  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1844  phage integrase family protein  25.35 
 
 		 426 aa  67.4  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5344  site-specific recombinase, phage integrase family  24.64 
 
 		 402 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.803856  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1066  hypothetical protein  23.93 
 
 		 414 aa  67  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4051  phage integrase family site specific recombinase  26.85 
 
 		 419 aa  67  0.0000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.102635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3353  phage integrase family protein  23.57 
 
 		 393 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4157  integrase family protein  24.38 
 
 		 432 aa  66.2  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.225884  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1277  putative phage integrase  23.74 
 
 		 454 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.207014 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1632  phage integrase  25.39 
 
 		 413 aa  66.6  0.0000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.986406  hitchhiker  0.00880856 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3935  site-specific recombinase, phage integrase family  25.74 
 
 		 420 aa  66.6  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.191126  decreased coverage  0.00000299734 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0108  integrase family protein  22.8 
 
 		 389 aa  66.2  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1100  site-specific recombinase, phage integrase family  22.96 
 
 		 395 aa  66.2  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2106  integrase  26.32 
 
 		 272 aa  66.2  0.0000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1761  integrase family protein  26.29 
 
 		 361 aa  66.2  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2900  phage integrase family protein  24.25 
 
 		 432 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3676  integrase family protein  26.85 
 
 		 421 aa  65.9  0.0000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.329272  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2751  integrase family protein  25.09 
 
 		 415 aa  65.9  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.606598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3867  phage integrase  27.27 
 
 		 400 aa  65.5  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2535  phage integrase  25.57 
 
 		 463 aa  65.1  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0374  site-specific recombinase, phage integrase family  24.29 
 
 		 396 aa  64.7  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.324346  normal  0.794104 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4070  site-specific recombinase, phage integrase family  25.45 
 
 		 439 aa  64.3  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  26.97 
 
 		 411 aa  64.7  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3149  integrase family protein  23.28 
 
 		 402 aa  64.7  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3806  phage integrase  24.03 
 
 		 451 aa  64.7  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0304559  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2959  phage integrase family protein  25.66 
 
 		 444 aa  63.9  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0924112  normal  0.542634 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2924  integrase family protein  22.26 
 
 		 390 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0979  site-specific recombinase, phage integrase family protein  24.71 
 
 		 420 aa  63.9  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000444866  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0308  integrase or site-specific recombinase  25.35 
 
 		 414 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0112  phage integrase family site specific recombinase  25.35 
 
 		 409 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.246788  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2389  integrase  23.97 
 
 		 415 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.557961  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1227  integrase family protein  24.56 
 
 		 424 aa  63.5  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149921  normal  0.536296 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3306  Phage integrase  26.21 
 
 		 450 aa  63.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.889733  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  24.28 
 
 		 402 aa  63.5  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0097  phage integrase family site specific recombinase  25.35 
 
 		 409 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.89883  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3617  phage integrase family protein  22.62 
 
 		 390 aa  63.2  0.000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  24.3 
 
 		 379 aa  63.2  0.000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0637  phage integrase family protein  23.53 
 
 		 411 aa  63.2  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102856 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3377  site-specific recombinase, phage integrase family protein  25.62 
 
 		 394 aa  62.8  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2014  phage integrase  23.08 
 
 		 416 aa  62.8  0.000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15350  putative integrase  23.75 
 
 		 400 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  0.0000000000000770896  unclonable  1.43377e-21 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2917  phage integrase family site specific recombinase  23.05 
 
 		 415 aa  62.8  0.000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.121366  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2828  integrase family protein  23.02 
 
 		 396 aa  62.4  0.000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0824  site-specific recombinase, phage integrase family  24.81 
 
 		 392 aa  62.8  0.000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.966036  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3112  site-specific recombinase, phage integrase family protein  25.62 
 
 		 394 aa  62.8  0.000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0338398 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0217  phage-related integrase  25.75 
 
 		 413 aa  62.4  0.000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.838235  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4738  integrase  25.62 
 
 		 396 aa  62.4  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.657187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5032  integrase  22.34 
 
 		 417 aa  62.4  0.000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3410  integrase family protein  23.77 
 
 		 401 aa  62.4  0.000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.134022  hitchhiker  0.000868318 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2496  phage integrase family protein  26.15 
 
 		 408 aa  62.4  0.000000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0214559 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3121  phage integrase family protein  22.73 
 
 		 449 aa  62.4  0.000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3273  phage integrase family protein  24.71 
 
 		 401 aa  62.4  0.000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0956673  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0362  phage integrase family site specific recombinase  23.08 
 
 		 402 aa  62  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.613827  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0928  phage integrase family site specific recombinase  23.61 
 
 		 438 aa  62  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0249275  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3232  phage integrase family site specific recombinase  24.63 
 
 		 409 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>