156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_3805 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3805  integrase family protein  100 
 
 		 450 aa  899    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1526  phage integrase  60 
 
 		 440 aa  506  9.999999999999999e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3340  phage integrase family protein  51.75 
 
 		 452 aa  382  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.58116  normal  0.0453376 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0845  phage integrase  42.89 
 
 		 457 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1326  phage integrase family protein  42.89 
 
 		 457 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.558955  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0686  integrase family protein  41.65 
 
 		 472 aa  314  1.9999999999999998e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3461  integrase family protein  42.35 
 
 		 435 aa  299  7e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.538189  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0094  Phage integrase  39.37 
 
 		 449 aa  296  7e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000297047  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3323  integrase family protein  39.5 
 
 		 441 aa  295  1e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2717  Phage integrase  39.13 
 
 		 479 aa  295  1e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0065  hypothetical protein  27.85 
 
 		 417 aa  133  7.999999999999999e-30  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1085  hypothetical protein  26.2 
 
 		 413 aa  129  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2240  Phage integrase  29.56 
 
 		 406 aa  124  3e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1227  integrase family protein  27.69 
 
 		 424 aa  102  2e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149921  normal  0.536296 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1016  integrase family protein  23.98 
 
 		 412 aa  91.3  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1679  phage-related integrase  24.29 
 
 		 410 aa  89.7  9e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2136  phage integrase family protein  22.73 
 
 		 389 aa  77.8  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0404563  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3498  integrase family protein  23.24 
 
 		 486 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2964  phage integrase  25 
 
 		 387 aa  75.9  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0919  integrase family protein  23.81 
 
 		 448 aa  70.5  0.00000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.295922  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  31.79 
 
 		 402 aa  70.5  0.00000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1170  phage integrase family protein  25.7 
 
 		 412 aa  69.3  0.0000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00333929  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3806  phage integrase  24.34 
 
 		 451 aa  68.6  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0304559  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3738  hypothetical protein  24.81 
 
 		 384 aa  68.6  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2770  integrase family protein  24.44 
 
 		 452 aa  67.4  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.251515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3493  integrase family protein  24.11 
 
 		 409 aa  65.9  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.247982  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  24.11 
 
 		 400 aa  65.1  0.000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  0.00000971423 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  30.28 
 
 		 367 aa  65.5  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0395  phage integrase family protein  22.19 
 
 		 396 aa  64.7  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.436905  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4340  phage integrase family protein  26.97 
 
 		 420 aa  63.9  0.000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.185587  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0922  Phage integrase  24.38 
 
 		 403 aa  62.8  0.00000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.12188  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2093  integrase family protein  29.32 
 
 		 400 aa  62.8  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3091  phage integrase family protein  30 
 
 		 384 aa  62.4  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  29.03 
 
 		 397 aa  62.8  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  27.27 
 
 		 393 aa  62  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1247  putative phage related integrase  32.26 
 
 		 434 aa  62.4  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0154  phage integrase family protein  24.4 
 
 		 451 aa  62  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.543339  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2622  integrase protein  23.21 
 
 		 400 aa  60.5  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.561112  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0255  phage integrase  29.23 
 
 		 430 aa  60.1  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1337  integrase family protein  25.86 
 
 		 392 aa  58.5  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0155558  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1236  phage integrase  22.4 
 
 		 399 aa  58.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.449507  normal  0.10874 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2535  phage integrase  23.1 
 
 		 463 aa  58.9  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3721  phage integrase family protein  22.56 
 
 		 376 aa  58.5  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  24.58 
 
 		 411 aa  57.8  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2668  phage integrase family site specific recombinase  24.36 
 
 		 411 aa  58.2  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2359  integrase family protein  27.45 
 
 		 398 aa  56.6  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.522134  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3582  integrase  22.4 
 
 		 397 aa  55.8  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000010448 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3396  integrase family protein  24.39 
 
 		 414 aa  56.2  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1584  phage integrase family protein  22.31 
 
 		 376 aa  56.6  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3980  phage integrase family protein  27.78 
 
 		 365 aa  56.6  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.356268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0357  integrase family protein  24.7 
 
 		 389 aa  55.8  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1864  integrase family protein  28.36 
 
 		 429 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0438  hypothetical protein  31.45 
 
 		 337 aa  55.1  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4399  integrase family protein  22.06 
 
 		 376 aa  54.7  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.685705  normal  0.0426652 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0044  phage integrase family site specific recombinase  21.8 
 
 		 376 aa  54.7  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.374231  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0620  integrase family protein  23.87 
 
 		 452 aa  54.7  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1997  integrase family protein  24.35 
 
 		 400 aa  54.3  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.726133 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2900  phage integrase family protein  23.04 
 
 		 432 aa  53.5  0.000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3747  integrase  22.89 
 
 		 399 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1309  integrase family protein  21.29 
 
 		 385 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00894189  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  31.01 
 
 		 353 aa  52.4  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  32.56 
 
 		 251 aa  52.4  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0671  phage integrase family protein  23.02 
 
 		 401 aa  52  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.707055 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  24.62 
 
 		 413 aa  52.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1272  phage integrase family protein  21.16 
 
 		 425 aa  52  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000707551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  31.06 
 
 		 404 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1283  phage integrase family protein  27.21 
 
 		 304 aa  51.6  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000135681  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1639  integrase family protein  25.35 
 
 		 301 aa  50.8  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0514216  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0089  phage integrase family protein  26.56 
 
 		 400 aa  51.2  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0306  phage integrase  23.64 
 
 		 417 aa  50.8  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0401  phage integrase family protein  33.1 
 
 		 332 aa  50.8  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0548  hypothetical protein  30.3 
 
 		 334 aa  50.8  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3986  phage integrase family site specific recombinase  29.53 
 
 		 172 aa  50.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3995  phage integrase family protein  27.12 
 
 		 415 aa  50.4  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000158235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3493  integrase  35.29 
 
 		 571 aa  50.4  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2770  integrase family protein  39.53 
 
 		 434 aa  50.4  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00484712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2959  phage integrase family protein  23.49 
 
 		 444 aa  50.1  0.00008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0924112  normal  0.542634 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04371  hypothetical protein  25.11 
 
 		 321 aa  50.1  0.00009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36120  Phage integrase  23.48 
 
 		 400 aa  49.3  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4157  integrase family protein  25.56 
 
 		 432 aa  49.7  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.225884  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2956  integrase family protein  27.37 
 
 		 487 aa  49.3  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2375  tyrosine recombinase XerD  28.33 
 
 		 324 aa  49.3  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.973456  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2460  integrase family protein  28.85 
 
 		 415 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  22.19 
 
 		 413 aa  48.5  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2809  integrase family protein  32.09 
 
 		 338 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3045  phage integrase  23.65 
 
 		 415 aa  48.5  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.172973 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3853  integrase family protein  30.5 
 
 		 500 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1646  integrase family protein  31.86 
 
 		 330 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2745  integrase family protein  23.65 
 
 		 415 aa  48.5  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.99512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2612  phage integrase family protein  24.7 
 
 		 443 aa  48.5  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  27.93 
 
 		 300 aa  48.5  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7820  putative phage integrase  23.86 
 
 		 451 aa  48.9  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3752  phage integrase family protein  28.47 
 
 		 422 aa  48.9  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.538338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1637  integrase  27.63 
 
 		 174 aa  48.9  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3540  integrase family protein  23.65 
 
 		 399 aa  48.9  0.0002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2601  integrase family protein  23.65 
 
 		 399 aa  48.5  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.533125 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3879  integrase family protein  33.62 
 
 		 349 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1111  phage integrase family protein  25.73 
 
 		 329 aa  48.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.30334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  29.33 
 
 		 295 aa  48.1  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3737  hypothetical protein  40.48 
 
 		 150 aa  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>