More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_1244 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2622  integrase protein  78.7 
 
 		 400 aa  674    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.561112  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3540  integrase family protein  81.41 
 
 		 399 aa  667    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4137  phage integrase family protein  83.16 
 
 		 400 aa  686    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.031573  normal  0.207643 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3747  integrase  76.94 
 
 		 399 aa  654    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0341835  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1182  putative phage integrase  83.16 
 
 		 400 aa  686    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.383522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1236  phage integrase  76.63 
 
 		 399 aa  650    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.449507  normal  0.10874 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3045  phage integrase  80.9 
 
 		 415 aa  664    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.172973 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2601  integrase family protein  81.16 
 
 		 399 aa  667    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.533125 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0671  phage integrase family protein  78.64 
 
 		 401 aa  653    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.707055 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2745  integrase family protein  80.9 
 
 		 415 aa  664    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.99512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0497  integrase family protein  80.9 
 
 		 412 aa  657    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36120  Phage integrase  78.32 
 
 		 400 aa  655    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1244  phage integrase family protein  100 
 
 		 399 aa  825    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.797454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1865  integrase family protein  69.21 
 
 		 401 aa  537  1e-151  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.94549  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2625  phage integrase family protein  69.23 
 
 		 400 aa  534  1e-151  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.046264 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31280  putative integrase  69.21 
 
 		 401 aa  537  1e-151  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000488668  unclonable  4.84268e-22 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4029  integrase family protein  64.36 
 
 		 467 aa  520  1e-146  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.0270341 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2959  phage integrase family protein  61.56 
 
 		 444 aa  512  1e-144  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0924112  normal  0.542634 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  39.85 
 
 		 411 aa  269  5.9999999999999995e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0807  integrase protein  65.75 
 
 		 181 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  38.56 
 
 		 397 aa  241  1e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3724  putative integrase protein  86.99 
 
 		 143 aa  222  7e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3738  hypothetical protein  37.37 
 
 		 384 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3091  phage integrase family protein  38.14 
 
 		 384 aa  221  1.9999999999999999e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  36.12 
 
 		 393 aa  218  1e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  30.38 
 
 		 388 aa  171  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3806  phage integrase  28.27 
 
 		 451 aa  139  7e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0304559  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1864  integrase family protein  29.46 
 
 		 429 aa  138  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1247  putative phage related integrase  27.12 
 
 		 434 aa  133  5e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2535  phage integrase  26.28 
 
 		 463 aa  131  3e-29  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4399  integrase family protein  26.11 
 
 		 376 aa  124  4e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.685705  normal  0.0426652 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0044  phage integrase family site specific recombinase  26.11 
 
 		 376 aa  123  5e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.374231  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  28.32 
 
 		 400 aa  123  6e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  0.00000971423 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4157  integrase family protein  27.98 
 
 		 432 aa  122  8e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.225884  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2770  integrase family protein  27.04 
 
 		 452 aa  122  9.999999999999999e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.251515  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3721  phage integrase family protein  26.11 
 
 		 376 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1584  phage integrase family protein  26.11 
 
 		 376 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0620  integrase family protein  25.94 
 
 		 452 aa  121  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  26.6 
 
 		 379 aa  119  9.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7820  putative phage integrase  26.65 
 
 		 451 aa  119  9.999999999999999e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  26.26 
 
 		 402 aa  113  6e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0255  phage integrase  25.85 
 
 		 430 aa  110  6e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3752  phage integrase family protein  27.25 
 
 		 422 aa  109  9.000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.538338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0154  phage integrase family protein  25.12 
 
 		 451 aa  108  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.543339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2964  phage integrase  26.22 
 
 		 387 aa  104  2e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.187641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4340  phage integrase family protein  27.75 
 
 		 420 aa  102  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.185587  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0045  phage integrase family site specific recombinase  26.96 
 
 		 456 aa  100  5e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.869382  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1583  phage integrase family protein  26.97 
 
 		 451 aa  100  5e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3720  phage integrase family protein  26.72 
 
 		 451 aa  99.8  7e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4398  integrase family protein  26.7 
 
 		 451 aa  99.4  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0364227  hitchhiker  0.00879025 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  23.54 
 
 		 412 aa  93.2  7e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1237  integrase family protein  27.32 
 
 		 401 aa  91.3  3e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.184026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  25.89 
 
 		 404 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0357  integrase family protein  25.31 
 
 		 389 aa  90.5  5e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1844  phage integrase family protein  26.82 
 
 		 426 aa  89  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3853  integrase family protein  24.08 
 
 		 500 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1016  integrase family protein  25.06 
 
 		 412 aa  88.2  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  25 
 
 		 397 aa  87.4  4e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0366  integrase family protein  33.33 
 
 		 439 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.134449 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2751  integrase family protein  25.54 
 
 		 415 aa  84.3  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.606598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0805  site-specific recombinase/integrase  24.38 
 
 		 396 aa  84.3  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0116297  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  26.14 
 
 		 413 aa  82  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2399  hypothetical protein  43.93 
 
 		 137 aa  82  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.229698  normal  0.0250128 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0064  integrative genetic element Gsu32, integrase  26.22 
 
 		 439 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1229  integrase family protein  24.24 
 
 		 402 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.308607  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0065  hypothetical protein  26.17 
 
 		 417 aa  81.3  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0805  integrase family protein  28.89 
 
 		 433 aa  80.5  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00339873 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2489  putative integrase protein  23.36 
 
 		 417 aa  80.1  0.00000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1085  hypothetical protein  26.63 
 
 		 413 aa  78.6  0.0000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0637  phage integrase family protein  27.27 
 
 		 411 aa  78.2  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102856 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2499  phage integrase family protein  29.48 
 
 		 381 aa  77.8  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.005662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  26.23 
 
 		 337 aa  77.4  0.0000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1761  integrase family protein  28.47 
 
 		 361 aa  77  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0393  integrase family protein  27.85 
 
 		 403 aa  76.3  0.0000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000451154 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3121  phage integrase family protein  29.24 
 
 		 449 aa  76.3  0.0000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0810  site-specific recombinase/integrase  24.13 
 
 		 482 aa  75.9  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0879139  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2612  phage integrase family protein  23.39 
 
 		 443 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3701  integrase family protein  25.6 
 
 		 392 aa  75.5  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1679  phage integrase family site specific recombinase  30.25 
 
 		 356 aa  74.7  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.229259  normal  0.0687632 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1679  phage-related integrase  27.27 
 
 		 410 aa  74.3  0.000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0299  phage integrase family site specific recombinase  25.62 
 
 		 394 aa  72.4  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000127187 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0919  integrase family protein  26.75 
 
 		 448 aa  72.4  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.295922  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  26.01 
 
 		 367 aa  72.4  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2136  phage integrase family protein  24.93 
 
 		 389 aa  71.6  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0404563  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  23.24 
 
 		 429 aa  72  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3980  phage integrase family protein  25.25 
 
 		 365 aa  72  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.356268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003284  integrase  22.3 
 
 		 401 aa  71.2  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3396  integrase family protein  27.39 
 
 		 414 aa  71.2  0.00000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0927  phage integrase family protein  26.76 
 
 		 425 aa  70.9  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000881827 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1227  integrase family protein  26.85 
 
 		 424 aa  70.5  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149921  normal  0.536296 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3658  putative bacteriophage integrase  23.06 
 
 		 444 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1554  putative integrase/recombinase protein  26.4 
 
 		 354 aa  70.1  0.00000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2240  Phage integrase  25.54 
 
 		 406 aa  70.1  0.00000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3779  phage integrase family protein  24.55 
 
 		 404 aa  69.7  0.00000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.794944 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0112  phage integrase family protein  24.94 
 
 		 413 aa  69.3  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.525516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0329  site-specific recombinase, phage integrase family protein  24.79 
 
 		 402 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.0019463  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3048  integrase family protein  26.24 
 
 		 374 aa  68.2  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0072  hypothetical protein  25.58 
 
 		 406 aa  68.9  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3132  phage integrase family site specific recombinase  27.19 
 
 		 222 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2300  phage integrase family protein  24.76 
 
 		 403 aa  68.9  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>