More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A3658 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A3658  putative bacteriophage integrase  100 
 
 		 444 aa  915    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  33.49 
 
 		 429 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3424  integrase family protein  34.43 
 
 		 437 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.728899 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  29.91 
 
 		 404 aa  184  3e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003284  integrase  29.3 
 
 		 401 aa  164  3e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  30.09 
 
 		 421 aa  159  9e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  28.71 
 
 		 412 aa  144  4e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1997  site specific recombinase  33.79 
 
 		 279 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.151252 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2002  phage integrase  39.61 
 
 		 188 aa  114  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  30.1 
 
 		 400 aa  107  4e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  0.00000971423 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  25.52 
 
 		 411 aa  93.6  7e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  27.09 
 
 		 402 aa  92.4  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  27.11 
 
 		 393 aa  90.9  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  26.25 
 
 		 388 aa  90.5  6e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  25.84 
 
 		 397 aa  89.7  8e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2069  phage integrase  28.16 
 
 		 359 aa  87.4  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  hitchhiker  0.000737798 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1136  phage integrase family protein  26.63 
 
 		 513 aa  87  7e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4029  integrase family protein  24.88 
 
 		 467 aa  85.5  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.161912  normal  0.0270341 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3986  phage integrase family site specific recombinase  33.13 
 
 		 172 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  27.91 
 
 		 367 aa  83.2  0.000000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1465  integrase family protein  32.54 
 
 		 334 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.890522 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  23.6 
 
 		 379 aa  82  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  34.1 
 
 		 275 aa  82  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3274  phage integrase family site specific recombinase  33.55 
 
 		 159 aa  81.3  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  34.67 
 
 		 251 aa  79  0.0000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3738  hypothetical protein  25.06 
 
 		 384 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0789  phage integrase family protein  26.68 
 
 		 444 aa  79  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2900  phage integrase family protein  24.94 
 
 		 432 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  31.33 
 
 		 337 aa  77.8  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  32.93 
 
 		 353 aa  77.8  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2486  hypothetical protein  24.28 
 
 		 413 aa  78.2  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3508  integrase family protein  30.54 
 
 		 443 aa  78.2  0.0000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0089  phage integrase family protein  35.4 
 
 		 400 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  24.15 
 
 		 391 aa  78.2  0.0000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0770  phage integrase family protein  29.55 
 
 		 387 aa  77.8  0.0000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.17567  normal  0.038003 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5334  integrase family protein  24.57 
 
 		 354 aa  76.6  0.0000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5317  integrase family protein  24.57 
 
 		 354 aa  76.6  0.0000000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1037  phage integrase family protein  36.13 
 
 		 372 aa  75.9  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.197081  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36120  Phage integrase  24.41 
 
 		 400 aa  76.3  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3398  phage integrase family site specific recombinase  31.72 
 
 		 407 aa  75.5  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1462  Phage integrase  32.54 
 
 		 387 aa  75.5  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  27.22 
 
 		 337 aa  74.7  0.000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2297  integrative genetic element Ppu40, integrase  29.49 
 
 		 274 aa  74.3  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.880812  normal  0.023746 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1247  putative phage related integrase  26.13 
 
 		 434 aa  74.3  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2959  phage integrase family protein  24.36 
 
 		 444 aa  74.3  0.000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0924112  normal  0.542634 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0996  phage integrase family protein  29.52 
 
 		 387 aa  73.9  0.000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000294682 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  31.25 
 
 		 477 aa  73.6  0.000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3783  integrase family protein  28.12 
 
 		 334 aa  73.6  0.000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0832  Phage integrase  28.09 
 
 		 341 aa  73.2  0.000000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1337  integrase family protein  34.06 
 
 		 392 aa  73.2  0.000000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0155558  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2093  integrase family protein  23.5 
 
 		 400 aa  73.2  0.000000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  27.08 
 
 		 414 aa  73.2  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0485  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.09 
 
 		 322 aa  72.4  0.00000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.853028 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10430  site-specific recombinase XerD  33.57 
 
 		 313 aa  71.6  0.00000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00129547  unclonable  0.000000000966981 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0535  site-specific recombinase, phage integrase family  28.62 
 
 		 413 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1864  integrase family protein  26.08 
 
 		 429 aa  71.6  0.00000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1023  tyrosine recombinase XerC subunit  26.94 
 
 		 307 aa  71.2  0.00000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.554982  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1532  phage integrase family site specific recombinase  27.93 
 
 		 369 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3005  phage integrase family site specific recombinase  27.93 
 
 		 369 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1066  hypothetical protein  23.75 
 
 		 414 aa  70.9  0.00000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3300  phage integrase family site specific recombinase  27.93 
 
 		 369 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.248425  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3070  prophage DLP12 integrase  27.93 
 
 		 369 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5304  site-specific recombinase, phage integrase family  23.96 
 
 		 322 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  28.98 
 
 		 369 aa  70.9  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1001  integrase family protein  32.9 
 
 		 333 aa  70.5  0.00000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1088  hypothetical protein  23.7 
 
 		 414 aa  70.9  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1633  Phage integrase  25.83 
 
 		 368 aa  70.9  0.00000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.576304  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1244  phage integrase family protein  23.06 
 
 		 399 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.797454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3132  phage integrase family site specific recombinase  30.06 
 
 		 222 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0880  phage integrase family protein  30.32 
 
 		 291 aa  70.1  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0027577 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1037  Phage integrase  31.13 
 
 		 338 aa  69.3  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0995  site-specific recombinase, phage integrase family  28.57 
 
 		 349 aa  69.3  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00503137  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  27.37 
 
 		 392 aa  69.7  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0631  phage integrase family site specific recombinase  29.44 
 
 		 308 aa  68.9  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.45439  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1092  phage integrase  31.08 
 
 		 276 aa  69.7  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00970061  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2622  integrase protein  23.4 
 
 		 400 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.561112  normal  0.109435 
 
 
-
 
NC_004310  BR0636  phage integrase family site specific recombinase  29.44 
 
 		 308 aa  68.9  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23640  tyrosine recombinase XerC subunit  34.48 
 
 		 310 aa  68.6  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.154193  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3678  integrase family protein  33.13 
 
 		 275 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0548  hypothetical protein  32.37 
 
 		 334 aa  68.9  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4806  phage integrase  32.95 
 
 		 291 aa  68.6  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.92941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0290  integrase  30 
 
 		 324 aa  68.9  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0955438  normal  0.658855 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0978  phage integrase family protein  32.43 
 
 		 283 aa  68.6  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2535  phage integrase  24.84 
 
 		 463 aa  68.6  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2797  phage integrase family protein  30.95 
 
 		 451 aa  68.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1639  integrase family protein  28.75 
 
 		 301 aa  68.9  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0514216  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0671  phage integrase family protein  23.88 
 
 		 401 aa  68.6  0.0000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.707055 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2647  phage integrase family protein  28.36 
 
 		 315 aa  67.8  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0366  site-specific recombinase, phage integrase family  29.27 
 
 		 387 aa  68.2  0.0000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529105  hitchhiker  0.00000000819042 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  28.06 
 
 		 379 aa  67.8  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2794  integrase family protein  30.57 
 
 		 330 aa  67.8  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  25.57 
 
 		 300 aa  67.8  0.0000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0776  phage integrase  30.3 
 
 		 334 aa  67.8  0.0000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.228831  normal  0.0322595 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  31.06 
 
 		 397 aa  67.8  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3921  phage integrase family protein  29.66 
 
 		 327 aa  67.8  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470105  hitchhiker  0.00183347 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1556  integrase family protein  33.78 
 
 		 307 aa  67.4  0.0000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.36987  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0240  tyrosine recombinase XerC subunit  28.36 
 
 		 291 aa  67.4  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.295303  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3128  integrase family protein  26.4 
 
 		 384 aa  67.4  0.0000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.169868  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2236  integrase family protein  36.59 
 
 		 340 aa  67.4  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0483412  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1236  phage integrase  22.59 
 
 		 399 aa  67  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.449507  normal  0.10874 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>