More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0240 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0240  tyrosine recombinase XerC subunit  100 
 
 		 291 aa  590  1e-168  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.295303  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0653  integrase family protein  49.46 
 
 		 282 aa  265  5e-70  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.319783  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0279  phage integrase family protein  49.29 
 
 		 282 aa  257  1e-67  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.033075  hitchhiker  0.000013626 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0762  phage integrase family protein  47.86 
 
 		 287 aa  255  5e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0949  phage integrase family protein  45.86 
 
 		 275 aa  239  5e-62  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.427827  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0574  integrase family protein  43.45 
 
 		 295 aa  238  1e-61  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1297  phage integrase family protein  43.1 
 
 		 295 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0880  phage integrase family protein  45.6 
 
 		 291 aa  224  1e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0027577 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5117  tyrosine recombinase XerD  29.33 
 
 		 327 aa  108  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.843466 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1971  tyrosine recombinase XerD subunit  28.22 
 
 		 309 aa  105  6e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000860406  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  38.12 
 
 		 299 aa  105  7e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  38.12 
 
 		 299 aa  105  7e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1556  integrase family protein  30 
 
 		 307 aa  105  8e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.36987  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0537  tyrosine recombinase XerD subunit  29.82 
 
 		 302 aa  104  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0795  phage integrase family protein  27.11 
 
 		 283 aa  105  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  27.18 
 
 		 295 aa  105  1e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  38.56 
 
 		 299 aa  104  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  38.56 
 
 		 299 aa  104  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  38.56 
 
 		 299 aa  104  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  38.56 
 
 		 299 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  38.56 
 
 		 299 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1185  tyrosine recombinase XerD  26.86 
 
 		 310 aa  104  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497096  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  36.53 
 
 		 301 aa  104  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2383  tyrosine recombinase XerD  28.42 
 
 		 295 aa  103  3e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0626  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.49 
 
 		 315 aa  103  4e-21  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  37.04 
 
 		 299 aa  103  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3458  tyrosine recombinase XerD  27.49 
 
 		 303 aa  101  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2022  tyrosine recombinase XerD subunit  27.74 
 
 		 309 aa  102  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  31.71 
 
 		 302 aa  101  1e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0124  phage integrase family protein  33.04 
 
 		 298 aa  101  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.776243  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  37.5 
 
 		 299 aa  100  3e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1383  integrase family protein  30.92 
 
 		 307 aa  100  4e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1689  integrase family protein  30.74 
 
 		 292 aa  99.8  5e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0836065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0455  phage integrase family protein  32.8 
 
 		 349 aa  99.4  7e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3589  phage integrase family protein  32.8 
 
 		 349 aa  99.4  7e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0127182 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5497  phage integrase family protein  32.8 
 
 		 349 aa  99.4  7e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.052501 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1878  tyrosine recombinase XerD  27.05 
 
 		 292 aa  99  9e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0359  tyrosine recombinase XerD  28.7 
 
 		 290 aa  98.2  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00723526 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0023  integrase family protein  28.78 
 
 		 291 aa  98.6  1e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1178  tyrosine recombinase XerC subunit  28.57 
 
 		 300 aa  98.2  1e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2175  tyrosine recombinase XerD  31.72 
 
 		 299 aa  98.2  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  29.78 
 
 		 282 aa  97.8  2e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2483  site-specific tyrosine recombinase XerC  36.36 
 
 		 299 aa  97.4  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000855714  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4524  Phage integrase  29.04 
 
 		 310 aa  97.4  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3191  tyrosine recombinase XerD subunit  25.42 
 
 		 300 aa  97.8  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0903  tyrosine recombinase XerD  29.2 
 
 		 303 aa  98.2  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0988  tyrosine recombinase XerD  29.2 
 
 		 303 aa  98.2  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.252447  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0818  tyrosine recombinase XerC  29.37 
 
 		 296 aa  97.1  3e-19  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.368613  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0750  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.72 
 
 		 311 aa  97.1  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  28.89 
 
 		 294 aa  97.1  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2692  tyrosine recombinase XerD  29.6 
 
 		 295 aa  97.1  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.457784  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0159  integrase family protein  31.39 
 
 		 295 aa  96.7  4e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2332  tyrosine recombinase XerD  27.05 
 
 		 292 aa  96.7  4e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1990  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.82 
 
 		 300 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2036  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.82 
 
 		 300 aa  96.7  4e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0541579  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  28 
 
 		 302 aa  95.9  7e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  30.32 
 
 		 295 aa  95.9  8e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1970  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.82 
 
 		 300 aa  95.9  8e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.397741 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  30.29 
 
 		 296 aa  95.5  8e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0184  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.99 
 
 		 303 aa  95.5  9e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.72736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1313  tyrosine recombinase XerD  28.44 
 
 		 309 aa  95.5  9e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0523  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.46 
 
 		 315 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.221654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2378  tyrosine recombinase XerD  27.78 
 
 		 296 aa  95.1  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2346  tyrosine recombinase XerC  30.22 
 
 		 302 aa  95.1  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1457  tyrosine recombinase XerD  30.59 
 
 		 292 aa  95.1  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0432704  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1142  tyrosine recombinase XerD  27.46 
 
 		 295 aa  94.7  1e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1113  phage integrase family protein  27.46 
 
 		 364 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0671879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1716  tyrosine recombinase XerD  27.53 
 
 		 303 aa  95.1  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.500655  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  27.11 
 
 		 302 aa  94.4  2e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  29.11 
 
 		 305 aa  94.7  2e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.31 
 
 		 300 aa  94.7  2e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5470  tyrosine recombinase XerD  28.8 
 
 		 316 aa  94.4  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.602612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3738  tyrosine recombinase XerD subunit  27.05 
 
 		 328 aa  94.4  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2329  tyrosine recombinase XerD  27.38 
 
 		 277 aa  94.4  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00235896  normal  0.0350779 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1283  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.46 
 
 		 297 aa  94.4  2e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0788  phage integrase family protein  27.36 
 
 		 293 aa  94  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2607  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.43 
 
 		 322 aa  94.7  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2504  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.39 
 
 		 329 aa  93.6  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11988  putative tyrosine recombinase  30.8 
 
 		 298 aa  94  3e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0911  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.39 
 
 		 333 aa  94  3e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  29.31 
 
 		 296 aa  94  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0142  integrase family protein  35.37 
 
 		 292 aa  94  3e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0118  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.39 
 
 		 333 aa  94  3e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.412982  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0914  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.39 
 
 		 333 aa  94  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.1246  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1432  tyrosine recombinase XerD  28.26 
 
 		 321 aa  94  3e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0895087  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0369  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.97 
 
 		 305 aa  93.2  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1067  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.39 
 
 		 305 aa  93.2  4e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47730  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.63 
 
 		 299 aa  93.6  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0435757  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0543  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.04 
 
 		 303 aa  93.6  4e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0207  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.04 
 
 		 303 aa  93.6  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.279091  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0669  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.97 
 
 		 305 aa  93.2  4e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4009  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.04 
 
 		 303 aa  93.6  4e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0726  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.43 
 
 		 333 aa  92.8  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.218987  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2105  tyrosine recombinase XerD  27.27 
 
 		 297 aa  93.2  5e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.179497  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2797  tyrosine recombinase XerD  30.22 
 
 		 298 aa  93.2  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal  0.205647 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3212  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.97 
 
 		 311 aa  93.2  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  27.56 
 
 		 302 aa  92.8  6e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2654  tyrosine recombinase XerD  28.51 
 
 		 306 aa  92.8  6e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5294  integrase family protein  33.52 
 
 		 268 aa  92.8  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2478  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.31 
 
 		 322 aa  92.4  7e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0183983 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>