More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3783 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3783  integrase family protein  100 
 
 		 334 aa  673    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2809  integrase family protein  61.85 
 
 		 338 aa  424  1e-117  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2794  integrase family protein  45.76 
 
 		 330 aa  261  1e-68  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3971  integrase family protein  42.25 
 
 		 340 aa  233  5e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0495  integrase family protein  38.86 
 
 		 328 aa  218  8.999999999999998e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.701129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3654  Phage integrase  39.13 
 
 		 340 aa  215  8e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000207497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0438  hypothetical protein  38.18 
 
 		 337 aa  213  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0969  integrase family protein  37.82 
 
 		 348 aa  211  1e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.23183  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1554  putative integrase/recombinase protein  38.84 
 
 		 354 aa  211  2e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1722  hypothetical protein  39.31 
 
 		 339 aa  209  4e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.178853  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3921  phage integrase family protein  38.18 
 
 		 327 aa  209  6e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.470105  hitchhiker  0.00183347 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3949  site-specific recombinase, phage integrase family  37.69 
 
 		 347 aa  208  8e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0244166  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0401  phage integrase family protein  37.98 
 
 		 332 aa  205  8e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1522  phage integrase family site specific recombinase  40.46 
 
 		 339 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0535  site-specific recombinase, phage integrase family  39.22 
 
 		 413 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1679  phage integrase family site specific recombinase  43.61 
 
 		 356 aa  196  5.000000000000001e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.229259  normal  0.0687632 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2661  phage integrase  38.29 
 
 		 347 aa  196  7e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0679447  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0446  phage integrase family protein  38.29 
 
 		 347 aa  196  7e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.286621  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2854  integrase family protein  38.31 
 
 		 351 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0022  shufflon-specific DNA recombinase  40.22 
 
 		 375 aa  192  5e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3201  integrase family protein  38.4 
 
 		 351 aa  192  7e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.689071 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0108  shufflon-specific DNA recombinase  40 
 
 		 395 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1808  phage integrase family site specific recombinase  38.44 
 
 		 352 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.595703  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0847  integrase family protein  37.19 
 
 		 374 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.136673  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0807  phage integrase family protein  38.11 
 
 		 323 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1571  site-specific integrase/recombinase  33.84 
 
 		 381 aa  181  2e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0639  integrase family protein  38.6 
 
 		 374 aa  181  2e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.988788  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3039  phage integrase  37.62 
 
 		 339 aa  181  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3048  integrase family protein  37.54 
 
 		 374 aa  181  2e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0242  integrase family protein  34.93 
 
 		 373 aa  180  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2847  phage integrase  40.7 
 
 		 366 aa  179  8e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3132  phage integrase family site specific recombinase  43.44 
 
 		 222 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7273  integrase family protein  37.18 
 
 		 380 aa  171  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.488643  normal  0.163849 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04371  hypothetical protein  34.88 
 
 		 321 aa  169  6e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03811  site-specific recombinase XerD  34.77 
 
 		 327 aa  161  2e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1655  integrase/recombinase protein  33.82 
 
 		 334 aa  161  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2659  integrase family protein  33.68 
 
 		 531 aa  142  7e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1220  integrase  34.89 
 
 		 286 aa  137  2e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3493  integrase  34.55 
 
 		 571 aa  133  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7113  integrase family protein  29.11 
 
 		 347 aa  130  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00596865 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1421  phage integrase family protein  33.43 
 
 		 351 aa  130  4.0000000000000003e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1794  integrase family protein  30.88 
 
 		 343 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0543031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3178  phage integrase family protein  29.38 
 
 		 339 aa  125  7e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0368902  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1049  integrase family protein  31.88 
 
 		 380 aa  125  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  29.65 
 
 		 353 aa  122  6e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2121  integrase family protein  31.78 
 
 		 405 aa  120  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01212  site-specific recombinase, resolvase family protein  27.6 
 
 		 336 aa  120  3e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2030  phage integrase family protein  31.61 
 
 		 365 aa  119  7e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.755048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0382  putative site-specific integrase/recombinase  36.5 
 
 		 204 aa  119  7.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1152  integrase family protein  29.38 
 
 		 365 aa  116  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.379304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4490  phage integrase family protein  26.61 
 
 		 365 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6537  normal  0.0343494 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3125  Phage integrase  30 
 
 		 364 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5550  phage integrase family protein  26.3 
 
 		 365 aa  114  3e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0354  phage integrase family site specific recombinase  28.24 
 
 		 355 aa  113  4.0000000000000004e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03598  site-specific recombinase, phage integrase family protein  26.14 
 
 		 380 aa  112  9e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.951563  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0397  shufflon-specific DNA recombinase  26.14 
 
 		 353 aa  112  1.0000000000000001e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.759416  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2042  integrase family protein  29.06 
 
 		 350 aa  110  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0960893  normal  0.874493 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2069  phage integrase  32.66 
 
 		 359 aa  108  9.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  hitchhiker  0.000737798 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  32.22 
 
 		 251 aa  103  3e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0805  phage integrase family protein  25.94 
 
 		 354 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.431807 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0773  phage integrase family protein  25.94 
 
 		 354 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0798  integrase family protein  25.94 
 
 		 354 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000196141 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3586  phage integrase family protein  25.55 
 
 		 355 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  29.17 
 
 		 337 aa  101  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1807  integrase family protein  29.89 
 
 		 278 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.73649  hitchhiker  0.0000891918 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1622  phage integrase family protein  27.54 
 
 		 361 aa  99.8  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.487409  normal  0.202066 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0745  phage integrase family protein  25.14 
 
 		 357 aa  99.8  6e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.107824 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5334  integrase family protein  28.78 
 
 		 354 aa  99.4  8e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5317  integrase family protein  28.78 
 
 		 354 aa  99.4  8e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1711  integrase family protein  29.1 
 
 		 380 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.213299  hitchhiker  0.00000987295 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0398  shufflon-specific DNA recombinase  26.65 
 
 		 356 aa  98.2  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2234  integrase family protein  29.14 
 
 		 341 aa  97.8  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.533752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1667  phage integrase family protein  28.12 
 
 		 372 aa  97.8  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0471  integrase family protein  28.02 
 
 		 398 aa  97.8  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.116709  hitchhiker  0.000616461 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3233  phage integrase  26.25 
 
 		 356 aa  97.4  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003284  integrase  34.27 
 
 		 401 aa  97.1  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2576  integrase family protein  31.73 
 
 		 338 aa  94.4  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.478177  hitchhiker  0.000378812 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2610  integrase family protein  31.73 
 
 		 338 aa  94.4  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0241311  unclonable  5.16639e-16 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  30.31 
 
 		 429 aa  94.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  35.81 
 
 		 404 aa  93.2  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3091  phage integrase family protein  31.05 
 
 		 384 aa  93.2  6e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  26.03 
 
 		 367 aa  92.4  9e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3455  putative integrase/recombinase  26.35 
 
 		 362 aa  90.9  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.375642  normal  0.439237 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  23.57 
 
 		 337 aa  90.5  4e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0366  site-specific recombinase, phage integrase family  28.82 
 
 		 387 aa  89.4  9e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529105  hitchhiker  0.00000000819042 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2363  phage integrase family site specific recombinase  29.3 
 
 		 368 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  26.14 
 
 		 379 aa  87.8  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0272  phage integrase family site specific recombinase  31.56 
 
 		 386 aa  87.4  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3980  phage integrase family protein  32.37 
 
 		 365 aa  86.7  5e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.356268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3193  integrase family protein  27.14 
 
 		 365 aa  86.7  5e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.175664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  28.32 
 
 		 397 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04481  hypothetical protein  41.57 
 
 		 93 aa  85.1  0.000000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  27.27 
 
 		 412 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0290  integrase  27.51 
 
 		 324 aa  83.2  0.000000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0955438  normal  0.658855 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0548  hypothetical protein  35.07 
 
 		 334 aa  82  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3738  hypothetical protein  27.96 
 
 		 384 aa  82  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  29.51 
 
 		 402 aa  82.4  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  33.81 
 
 		 393 aa  79.7  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  27.45 
 
 		 363 aa  79.7  0.00000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  29.27 
 
 		 379 aa  79.3  0.00000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>