197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_0789 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_0789  phage integrase family protein  100 
 
 		 444 aa  910    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1533  phage integrase family protein  74.05 
 
 		 304 aa  451  1e-125  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.372982  normal  0.858007 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003284  integrase  28.19 
 
 		 401 aa  119  9.999999999999999e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  29.44 
 
 		 404 aa  113  6e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  27.6 
 
 		 429 aa  108  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  28.78 
 
 		 412 aa  105  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  25.4 
 
 		 421 aa  99  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3658  putative bacteriophage integrase  26.68 
 
 		 444 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3424  integrase family protein  23.39 
 
 		 437 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.728899 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3783  integrase family protein  29.76 
 
 		 334 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1997  site specific recombinase  28.29 
 
 		 279 aa  67.8  0.0000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.151252 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  32.39 
 
 		 397 aa  67.4  0.0000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2359  integrase family protein  30.63 
 
 		 398 aa  63.2  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.522134  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6923  integrase family protein  29.81 
 
 		 430 aa  63.2  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  33.33 
 
 		 367 aa  62.4  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  26.6 
 
 		 477 aa  61.2  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2809  integrase family protein  30.86 
 
 		 338 aa  61.2  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  23.85 
 
 		 397 aa  60.1  0.00000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  24.83 
 
 		 376 aa  59.3  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3318  integrase family protein  21.07 
 
 		 423 aa  59.7  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000001885  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1633  Phage integrase  22.68 
 
 		 368 aa  58.9  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.576304  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0447  phage integrase family site specific recombinase  23.19 
 
 		 307 aa  58.5  0.0000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2157  phage integrase  29.56 
 
 		 363 aa  58.5  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0421336  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  29.34 
 
 		 363 aa  58.5  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26510  site-specific recombinase XerD  24.19 
 
 		 443 aa  58.9  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.938683  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1554  putative integrase/recombinase protein  25.5 
 
 		 354 aa  58.2  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0209  phage integrase family protein  24.07 
 
 		 379 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2451  putative integrase/recombinase  25.41 
 
 		 382 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.133057  normal  0.202092 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2499  phage integrase family protein  29.14 
 
 		 381 aa  57.4  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.005662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3995  phage integrase family protein  28.93 
 
 		 415 aa  57  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000158235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0745  phage integrase family protein  24.73 
 
 		 357 aa  56.2  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.107824 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3098  integrase family protein  27.49 
 
 		 428 aa  55.1  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1704  integrase family protein  24.32 
 
 		 391 aa  55.5  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.01743  normal  0.0235893 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3047  phage integrase  26.42 
 
 		 381 aa  55.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.182322  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3493  integrase  30.57 
 
 		 571 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2782  phage integrase family protein  28.95 
 
 		 356 aa  54.7  0.000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.507501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  24.2 
 
 		 275 aa  54.3  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  22.55 
 
 		 379 aa  54.3  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3398  phage integrase family site specific recombinase  31.25 
 
 		 407 aa  53.5  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1633  phage integrase  28.3 
 
 		 362 aa  53.1  0.000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4084  integrase family protein  27.61 
 
 		 356 aa  53.1  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1337  integrase family protein  26.14 
 
 		 392 aa  52.8  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0155558  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0447  phage integrase  27.17 
 
 		 381 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5531  integrase family protein  24.43 
 
 		 461 aa  52.8  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000725821  normal  0.462507 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1932  integrase/recombinase, phage associated  21.79 
 
 		 379 aa  52.4  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.706433  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0926  phage integrase family protein  27.17 
 
 		 381 aa  52.8  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  26.37 
 
 		 337 aa  53.1  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1239  integrase family protein  25.95 
 
 		 390 aa  52.8  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.120865  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2564  phage integrase family protein  28.17 
 
 		 417 aa  52.4  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.326638  hitchhiker  0.000921348 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14150  site-specific recombinase XerD  24.07 
 
 		 451 aa  52.4  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1136  phage integrase family protein  23.32 
 
 		 513 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  28.15 
 
 		 300 aa  51.6  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3980  phage integrase family protein  30.57 
 
 		 365 aa  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.356268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2661  phage integrase  26.37 
 
 		 347 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0679447  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0446  phage integrase family protein  26.37 
 
 		 347 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.286621  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7637  integrase family protein  37.04 
 
 		 425 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  29.21 
 
 		 416 aa  51.2  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1966  phage integrase family protein  27.72 
 
 		 403 aa  51.2  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00610288  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2497  integrase family protein  28.21 
 
 		 384 aa  51.2  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.355652 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1751  tyrosine recombinase XerD  22.05 
 
 		 294 aa  50.8  0.00005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0776  phage integrase  23.49 
 
 		 334 aa  50.4  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.228831  normal  0.0322595 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0548  hypothetical protein  25.45 
 
 		 334 aa  50.8  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  27.63 
 
 		 397 aa  50.4  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  26.45 
 
 		 435 aa  50.1  0.00008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  26.38 
 
 		 431 aa  50.1  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1421  phage integrase family protein  27.84 
 
 		 351 aa  50.1  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1931  phage integrase family protein  28.21 
 
 		 218 aa  50.1  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0950556  normal  0.136892 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0524  integrase family protein  26.16 
 
 		 407 aa  50.1  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.236803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0290  integrase  29.22 
 
 		 324 aa  50.1  0.00009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0955438  normal  0.658855 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1037  phage integrase family protein  37.93 
 
 		 372 aa  50.1  0.00009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.197081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0860  integrase family protein  28.14 
 
 		 370 aa  49.7  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0959  Phage integrase  25.64 
 
 		 392 aa  49.3  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
 
NC_007651  BTH_I3274  phage integrase family site specific recombinase  31.61 
 
 		 159 aa  49.7  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0301  integrase  22.86 
 
 		 398 aa  49.3  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0639  integrase family protein  26.32 
 
 		 374 aa  49.7  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.988788  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2739  integrase/recombinase XerD  31.58 
 
 		 321 aa  49.3  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6370  integrase family protein  29.61 
 
 		 438 aa  48.5  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  25.43 
 
 		 365 aa  48.5  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  24.43 
 
 		 414 aa  48.9  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1208  phage integrase  28.12 
 
 		 476 aa  49.3  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1457  tyrosine recombinase XerD  30.47 
 
 		 292 aa  48.5  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0432704  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  24.19 
 
 		 383 aa  48.9  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0089  phage integrase family protein  27.41 
 
 		 400 aa  48.9  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4000  phage integrase family protein  24.16 
 
 		 389 aa  48.5  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00310  site-specific recombinase, phage integrase family protein  25.71 
 
 		 429 aa  48.9  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0526  phage integrase family protein  33.77 
 
 		 189 aa  48.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0707528  normal  0.625905 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2069  phage integrase family protein  28.57 
 
 		 419 aa  48.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0530977  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0563  phage integrase family protein  29.17 
 
 		 361 aa  48.5  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3853  integrase family protein  30.94 
 
 		 500 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3048  integrase family protein  24.49 
 
 		 374 aa  47.8  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0697  integrase family protein  25.97 
 
 		 387 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0600  prophage DLP12 integrase  27.56 
 
 		 387 aa  47.8  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000371504 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3474  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.1 
 
 		 296 aa  47.8  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.486058 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  28.99 
 
 		 391 aa  47.8  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0893  tyrosine recombinase XerD  30.53 
 
 		 304 aa  47.8  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0105661 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5550  phage integrase family protein  23.46 
 
 		 365 aa  47.4  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1556  site-specific recombinase, phage integrase family  27.14 
 
 		 331 aa  47.4  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  24.34 
 
 		 381 aa  47.4  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4262  integrase family protein  23.74 
 
 		 379 aa  47.4  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03598  site-specific recombinase, phage integrase family protein  26.02 
 
 		 380 aa  47.4  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.951563  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>