238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1931 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1931  phage integrase family protein  100 
 
 		 218 aa  440  1e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0950556  normal  0.136892 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7037  hypothetical protein  53.3 
 
 		 387 aa  218  6e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.87328 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  32.32 
 
 		 379 aa  85.1  6e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  31.82 
 
 		 414 aa  80.1  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  26.41 
 
 		 400 aa  76.3  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  35.29 
 
 		 377 aa  75.5  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1144  phage integrase  34.36 
 
 		 422 aa  74.3  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.132159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  32.21 
 
 		 363 aa  73.6  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2219  phage integrase  30.73 
 
 		 378 aa  73.2  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1407  integrase family protein  28.7 
 
 		 374 aa  72.4  0.000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0609363  normal  0.0878514 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3461  phage integrase  28.19 
 
 		 381 aa  72  0.000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2026  integrase family protein  27.57 
 
 		 392 aa  71.6  0.000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3548  phage integrase family protein  31.41 
 
 		 209 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.339654  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1179  integrase family protein  26.19 
 
 		 387 aa  70.9  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.208584 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  26.85 
 
 		 392 aa  70.9  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  29.63 
 
 		 477 aa  70.1  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3468  integrase family protein  27.75 
 
 		 381 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.459563  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  29.25 
 
 		 325 aa  70.1  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5395  integrase family protein  32.85 
 
 		 402 aa  69.7  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  32.12 
 
 		 371 aa  69.3  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1143  integrase family protein  34.76 
 
 		 412 aa  65.9  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000465357  unclonable  7.38755e-19 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5323  integrase family protein  32.38 
 
 		 422 aa  66.2  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0388032 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  28.21 
 
 		 305 aa  65.5  0.0000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  31.31 
 
 		 379 aa  65.5  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  31.31 
 
 		 379 aa  65.5  0.0000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  29.25 
 
 		 431 aa  65.1  0.0000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  28.57 
 
 		 416 aa  65.1  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  24.89 
 
 		 391 aa  63.9  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  26.13 
 
 		 383 aa  63.2  0.000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  28.06 
 
 		 370 aa  62.8  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1592  phage integrase  28.5 
 
 		 377 aa  60.1  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2018  integrase family protein  31.25 
 
 		 452 aa  59.7  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0301  integrase  25.54 
 
 		 398 aa  57.4  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0512  phage integrase  28.9 
 
 		 506 aa  57.4  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000591844  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  26.63 
 
 		 370 aa  57.4  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2783  phage integrase family protein  28.43 
 
 		 367 aa  57  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00148084  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1386  integrase family protein  28.57 
 
 		 344 aa  56.2  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.114707  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  23.94 
 
 		 369 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1639  integrase family protein  25.29 
 
 		 301 aa  56.2  0.0000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0514216  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2314  phage integrase family protein  30.05 
 
 		 392 aa  55.8  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0243817  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23910  site-specific recombinase XerD  31.19 
 
 		 402 aa  56.2  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.075478  normal  0.15395 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  28.85 
 
 		 412 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  28.12 
 
 		 390 aa  55.8  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4036  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  26.49 
 
 		 376 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000192232  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0253  integrase family protein  29.88 
 
 		 435 aa  55.5  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000373788  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0686  phage integrase family protein  29.28 
 
 		 397 aa  54.7  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0848514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2356  phage integrase family protein  29.44 
 
 		 392 aa  54.7  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000232607  hitchhiker  0.000274891 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3986  phage integrase family site specific recombinase  30.19 
 
 		 172 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2897  phage integrase family protein  26.29 
 
 		 386 aa  54.7  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1336  integrase family protein  28.49 
 
 		 391 aa  53.9  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3274  phage integrase family site specific recombinase  28.85 
 
 		 159 aa  53.5  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  27.51 
 
 		 385 aa  53.5  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  22.28 
 
 		 369 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  27.87 
 
 		 300 aa  53.5  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09660  site-specific recombinase, integrase family  30 
 
 		 396 aa  53.5  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.458441  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  30.05 
 
 		 357 aa  53.1  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  28.95 
 
 		 429 aa  52.4  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  24.32 
 
 		 376 aa  52.4  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3318  integrase family protein  25.45 
 
 		 423 aa  52.4  0.000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000001885  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2777  integrase family protein  27.62 
 
 		 387 aa  52  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.684948  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1118  integrase family protein  28.96 
 
 		 384 aa  52.4  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.868732  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1324  Phage integrase  27.44 
 
 		 411 aa  52  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000225151  hitchhiker  0.00877617 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1239  integrase family protein  25 
 
 		 390 aa  52  0.000007  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.120865  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1366  integrase family protein  31.48 
 
 		 447 aa  51.6  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.571831 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4157  integrase family protein  33.89 
 
 		 432 aa  52  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.225884  normal  0.636127 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  31.79 
 
 		 376 aa  51.6  0.000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  27.56 
 
 		 404 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2851  integrase family protein  25.99 
 
 		 391 aa  51.2  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0726  phage integrase family protein  29.19 
 
 		 401 aa  51.2  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000125813  decreased coverage  0.0000000856927 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  32.97 
 
 		 397 aa  50.8  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0820  integrase family protein  24.27 
 
 		 378 aa  51.2  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  30.73 
 
 		 365 aa  50.4  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0288  integrase family protein  24.26 
 
 		 403 aa  50.4  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2134  integrase family protein  28.57 
 
 		 407 aa  50.8  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.565858  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0524  integrase family protein  29.31 
 
 		 407 aa  50.4  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.236803  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2497  integrase family protein  28.12 
 
 		 384 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.355652 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0789  phage integrase family protein  28.21 
 
 		 444 aa  50.1  0.00002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0572  integrase  26.42 
 
 		 372 aa  50.4  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000288735  normal  0.557029 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0634  integrase  26.42 
 
 		 372 aa  50.4  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000314832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2948  phage integrase family protein  25.43 
 
 		 380 aa  50.8  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.245943 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  23 
 
 		 373 aa  50.4  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3794  integrase family protein  32.74 
 
 		 445 aa  50.4  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0397442 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0493  phage integrase family protein  24.02 
 
 		 383 aa  50.4  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000132895  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3743  integrase family protein  32.74 
 
 		 445 aa  50.4  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2465  putative pore-forming cytotoxin integrase  27.66 
 
 		 381 aa  50.1  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.472408  normal  0.135007 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  25.98 
 
 		 409 aa  49.7  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  27.46 
 
 		 386 aa  49.3  0.00004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  28.73 
 
 		 332 aa  49.3  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0144  tyrosine recombinase XerD  33.85 
 
 		 305 aa  49.3  0.00004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1294  integrase family protein  38.36 
 
 		 393 aa  49.3  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1679  integrase  25.79 
 
 		 372 aa  49.7  0.00004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  21.81 
 
 		 369 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1569  integrase family protein  28.11 
 
 		 422 aa  48.9  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3836  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  25.27 
 
 		 376 aa  49.3  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4134  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  25.27 
 
 		 376 aa  49.3  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.62629  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  23.79 
 
 		 389 aa  48.9  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0607  integrase  25.6 
 
 		 374 aa  48.9  0.00005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0846  phage integrase family protein  25.64 
 
 		 368 aa  49.3  0.00005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  25.14 
 
 		 337 aa  49.3  0.00005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1533  phage integrase family protein  27.06 
 
 		 304 aa  48.9  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.372982  normal  0.858007 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>