More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_1533 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008340  Mlg_1533  phage integrase family protein  100 
 
 		 304 aa  626  1e-178  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.372982  normal  0.858007 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0789  phage integrase family protein  74.05 
 
 		 444 aa  451  1.0000000000000001e-126  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003284  integrase  28.16 
 
 		 401 aa  96.3  6e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  29.29 
 
 		 404 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  24.64 
 
 		 421 aa  80.9  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  31.25 
 
 		 412 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  26.32 
 
 		 429 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2069  phage integrase  32.97 
 
 		 359 aa  72  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  hitchhiker  0.000737798 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2359  integrase family protein  31.06 
 
 		 398 aa  70.5  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.522134  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3783  integrase family protein  31.91 
 
 		 334 aa  69.7  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  34.42 
 
 		 367 aa  68.9  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  33.16 
 
 		 477 aa  68.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0636  integrase family protein  30.72 
 
 		 397 aa  65.1  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00117125  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2661  phage integrase  31.31 
 
 		 347 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0679447  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0446  phage integrase family protein  31.31 
 
 		 347 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.286621  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2809  integrase family protein  30.12 
 
 		 338 aa  63.5  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0399  phage integrase family protein  26.63 
 
 		 337 aa  62.8  0.000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3128  integrase family protein  28.92 
 
 		 384 aa  62  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.169868  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0179  hypothetical protein  28.83 
 
 		 401 aa  61.2  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  31.94 
 
 		 275 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3995  phage integrase family protein  30.77 
 
 		 415 aa  61.6  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000158235  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03935  integrase  22.34 
 
 		 406 aa  61.2  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.439206  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0301  integrase  25 
 
 		 398 aa  60.8  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  26.42 
 
 		 414 aa  60.1  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3274  phage integrase family site specific recombinase  31.01 
 
 		 159 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0209  phage integrase family protein  28.85 
 
 		 379 aa  60.1  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14150  site-specific recombinase XerD  24.07 
 
 		 451 aa  60.5  0.00000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0290  integrase  27.75 
 
 		 324 aa  59.7  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0955438  normal  0.658855 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2499  phage integrase family protein  31.41 
 
 		 381 aa  60.1  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.005662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1239  integrase family protein  21.72 
 
 		 390 aa  60.1  0.00000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.120865  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0194  hypothetical protein  29.27 
 
 		 402 aa  59.7  0.00000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1337  integrase family protein  29.59 
 
 		 392 aa  59.7  0.00000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0155558  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1366  integrase family protein  25.97 
 
 		 447 aa  59.7  0.00000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.571831 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0600  prophage DLP12 integrase  27.78 
 
 		 387 aa  59.7  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000371504 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2564  phage integrase family protein  29.65 
 
 		 417 aa  59.7  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.326638  hitchhiker  0.000921348 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3980  phage integrase family protein  32.37 
 
 		 365 aa  58.9  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.356268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0770  phage integrase family protein  28.9 
 
 		 387 aa  58.9  0.00000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.17567  normal  0.038003 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0639  integrase family protein  31.71 
 
 		 374 aa  58.5  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.988788  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3318  integrase family protein  23.33 
 
 		 423 aa  58.9  0.0000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000001885  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0603  prophage DLP12 integrase  27.22 
 
 		 387 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.591827  normal  0.109932 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00486  predicted integrase  28.19 
 
 		 387 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3424  integrase family protein  25.57 
 
 		 437 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.728899 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5531  integrase family protein  23.98 
 
 		 461 aa  57.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000725821  normal  0.462507 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00491  hypothetical protein  28.19 
 
 		 387 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7273  integrase family protein  29.45 
 
 		 380 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.488643  normal  0.163849 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0923  integrase family protein  27.38 
 
 		 363 aa  57.8  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1554  putative integrase/recombinase protein  26.38 
 
 		 354 aa  57.4  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3658  putative bacteriophage integrase  27.12 
 
 		 444 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1751  tyrosine recombinase XerD  22.07 
 
 		 294 aa  57  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0366  site-specific recombinase, phage integrase family  26.16 
 
 		 387 aa  57.4  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529105  hitchhiker  0.00000000819042 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0995  site-specific recombinase, phage integrase family  28.57 
 
 		 349 aa  57.4  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00503137  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0860  integrase family protein  27.39 
 
 		 370 aa  56.2  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0858  phage integrase  27.27 
 
 		 289 aa  56.2  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3493  integrase  29.41 
 
 		 571 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2157  phage integrase  28.4 
 
 		 363 aa  56.2  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0421336  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6923  integrase family protein  28.85 
 
 		 430 aa  55.8  0.0000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0996  phage integrase family protein  26.99 
 
 		 387 aa  55.8  0.0000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000294682 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7637  integrase family protein  39.19 
 
 		 425 aa  55.8  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26510  site-specific recombinase XerD  23.67 
 
 		 443 aa  55.8  0.0000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.938683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  27.91 
 
 		 376 aa  55.5  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1633  phage integrase  27.95 
 
 		 362 aa  55.1  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0114  phage integrase  28.04 
 
 		 431 aa  55.5  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.646267 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  28.75 
 
 		 300 aa  55.8  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  29.68 
 
 		 379 aa  55.5  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  27.54 
 
 		 378 aa  55.5  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0535  site-specific recombinase, phage integrase family  30.05 
 
 		 413 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3398  phage integrase family site specific recombinase  30.63 
 
 		 407 aa  54.7  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  25.97 
 
 		 383 aa  54.7  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  29.87 
 
 		 251 aa  53.9  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1208  phage integrase  28.57 
 
 		 476 aa  53.9  0.000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0524  integrase family protein  26.32 
 
 		 407 aa  53.9  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.236803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1966  phage integrase family protein  25.89 
 
 		 403 aa  54.3  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00610288  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  23.29 
 
 		 391 aa  53.1  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1633  Phage integrase  22.39 
 
 		 368 aa  53.1  0.000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.576304  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  25.53 
 
 		 379 aa  53.5  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4084  integrase family protein  27.16 
 
 		 356 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1958  integrase family protein  27.01 
 
 		 431 aa  53.1  0.000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00797743  normal  0.0944215 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2002  phage integrase  30.95 
 
 		 188 aa  53.1  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1271  integrase family protein  29.55 
 
 		 331 aa  53.1  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.828065  normal  0.193617 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1556  site-specific recombinase, phage integrase family  29.55 
 
 		 331 aa  53.1  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  27.68 
 
 		 397 aa  52.8  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4806  phage integrase  27.33 
 
 		 291 aa  52.8  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.92941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3201  integrase family protein  30.3 
 
 		 351 aa  52.8  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.689071 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1026  integrase family protein  24.84 
 
 		 283 aa  52.4  0.000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000319361  normal  0.791294 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3869  integrase family protein  26.9 
 
 		 381 aa  52.4  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0819  integrase  26.58 
 
 		 409 aa  52  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1454  integrase  26.58 
 
 		 409 aa  52  0.00001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  27.85 
 
 		 353 aa  51.6  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2854  integrase family protein  30.25 
 
 		 351 aa  52.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.820272 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3986  phage integrase family site specific recombinase  30.19 
 
 		 172 aa  52  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2121  integrase family protein  30.06 
 
 		 405 aa  52  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3091  phage integrase family protein  30.06 
 
 		 384 aa  52  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2739  integrase/recombinase XerD  29.2 
 
 		 321 aa  52  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0548  hypothetical protein  25.14 
 
 		 334 aa  51.6  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0022  shufflon-specific DNA recombinase  30.34 
 
 		 375 aa  51.6  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1037  Phage integrase  25.59 
 
 		 338 aa  51.6  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0805  site-specific recombinase/integrase  28.3 
 
 		 396 aa  51.2  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0116297  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0800  Phage integrase  26.34 
 
 		 369 aa  51.2  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.64955  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4502  integrase family protein  27.22 
 
 		 290 aa  51.6  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1704  integrase family protein  27.12 
 
 		 391 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.01743  normal  0.0235893 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>