More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_03935 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_03935  integrase  100 
 
 		 406 aa  837    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.439206  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5531  integrase family protein  41.16 
 
 		 461 aa  202  7e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000725821  normal  0.462507 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1462  Tn5520-like integrase (transfer factor)  31.46 
 
 		 402 aa  181  2e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.174557  normal  0.0965208 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1729  hypothetical protein  27.49 
 
 		 404 aa  151  2e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000763037 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5173  integrase family protein  29.66 
 
 		 411 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.54702 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6168  integrase family protein  26.6 
 
 		 411 aa  134  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1953  integrase family protein  26.62 
 
 		 405 aa  114  3e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.247559  normal  0.500213 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3099  integrase family protein  26.68 
 
 		 441 aa  112  1.0000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.979662 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00445  tyrosine type site-specific recombinase  24.75 
 
 		 405 aa  92.4  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.459489  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1768  hypothetical protein  25.37 
 
 		 433 aa  81.3  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00932927 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  29.17 
 
 		 284 aa  79.7  0.00000000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0819  integrase  23.11 
 
 		 409 aa  79.3  0.0000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1454  integrase  23.11 
 
 		 409 aa  79.3  0.0000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1173  phage integrase family site specific recombinase  26.37 
 
 		 354 aa  76.6  0.0000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0145  integrase family protein  22.12 
 
 		 411 aa  73.9  0.000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.468231  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5219  integrase family protein  25.12 
 
 		 406 aa  72  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.759008  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.41 
 
 		 299 aa  71.2  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4262  integrase family protein  24.69 
 
 		 379 aa  68.9  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1344  integrase family protein  24.73 
 
 		 292 aa  68.9  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000678444  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4202  integrase family protein  26.87 
 
 		 406 aa  68.2  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4524  Phage integrase  24 
 
 		 310 aa  67  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  30.67 
 
 		 302 aa  67  0.0000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.24 
 
 		 298 aa  66.6  0.0000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.91 
 
 		 296 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.91 
 
 		 296 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11843  putative transposase  22.61 
 
 		 416 aa  65.1  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.383494  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.87 
 
 		 296 aa  64.7  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3470  phage integrase family protein  25.55 
 
 		 302 aa  64.7  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.229271  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  26.7 
 
 		 297 aa  63.9  0.000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  32.48 
 
 		 294 aa  64.3  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0952  integrase family protein  23.6 
 
 		 412 aa  63.5  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.571908  normal  0.0199815 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.57 
 
 		 296 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.57 
 
 		 296 aa  63.2  0.000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  25 
 
 		 320 aa  62.4  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.66 
 
 		 296 aa  61.6  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.66 
 
 		 296 aa  61.6  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.66 
 
 		 296 aa  61.6  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  41.67 
 
 		 295 aa  61.6  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.66 
 
 		 296 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3592  phage integrase family protein  25.28 
 
 		 419 aa  61.6  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1682  integron integrase  39.77 
 
 		 319 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0358  integrase family protein  27.46 
 
 		 287 aa  61.2  0.00000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.66 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2348  phage integrase family protein  29.12 
 
 		 301 aa  61.2  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1533  phage integrase family protein  22.34 
 
 		 304 aa  61.2  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.372982  normal  0.858007 
 
 
-
 
NC_008696  Tpen_1891  phage integrase family protein  25.54 
 
 		 278 aa  61.2  0.00000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  24.81 
 
 		 282 aa  60.8  0.00000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.26 
 
 		 296 aa  60.8  0.00000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1823  integrase family protein  27.62 
 
 		 253 aa  60.5  0.00000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.987007  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0074  site-specific tyrosine recombinase XerC  22 
 
 		 307 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1720  integron integrase  38.64 
 
 		 319 aa  60.1  0.00000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.945826  normal  0.140223 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3360  integron integrase  38.64 
 
 		 319 aa  60.1  0.00000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  43.59 
 
 		 296 aa  60.1  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2037  phage integrase family site specific recombinase  37.5 
 
 		 319 aa  60.1  0.00000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0068  phage integrase  28.11 
 
 		 302 aa  60.1  0.00000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4345  phage integrase family protein  27.14 
 
 		 435 aa  59.7  0.00000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1521  tyrosine recombinase XerD  21.9 
 
 		 346 aa  59.7  0.00000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.531713  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  44.44 
 
 		 296 aa  59.3  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2132  integron integrase  37.5 
 
 		 319 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000290373 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1347  tyrosine recombinase XerD  24.59 
 
 		 306 aa  59.3  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.816733  normal  0.74121 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04122  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.71 
 
 		 305 aa  59.3  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2714  integron integrase  38.1 
 
 		 332 aa  58.5  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5342  integrase/recombinase  40.26 
 
 		 337 aa  58.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3700  integrase family protein  27.97 
 
 		 295 aa  58.9  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0067  integrase/recombinase  40.26 
 
 		 337 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.325485 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1185  tyrosine recombinase XerD  21.71 
 
 		 315 aa  58.2  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0531401  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2633  phage integrase family protein  27.96 
 
 		 419 aa  58.9  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0143  integrase IntI1 for transposon Tn21  40.26 
 
 		 337 aa  58.5  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0341  phage integrase family site specific recombinase  26.51 
 
 		 311 aa  58.9  0.0000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0039  integrase/recombinase  40.26 
 
 		 159 aa  58.9  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.333737 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  27.96 
 
 		 307 aa  58.5  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3366  integron integrase  38.1 
 
 		 332 aa  58.5  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.341619 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0120  integrase/recombinase  40.26 
 
 		 337 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.400978 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3204  integron integrase  24.28 
 
 		 322 aa  58.5  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0977  integron integrase  35.71 
 
 		 329 aa  58.5  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1732  integrase/recombinase XerD  24.46 
 
 		 308 aa  57.8  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1751  tyrosine recombinase XerD  43.59 
 
 		 294 aa  57.8  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2344  phage integrase  23.88 
 
 		 322 aa  58.2  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0456613  normal  0.219342 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3665  integrase family protein  22.31 
 
 		 313 aa  58.2  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.211751 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2117  tyrosine recombinase XerD  23.91 
 
 		 298 aa  58.2  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815623  normal  0.0464222 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  23.83 
 
 		 295 aa  57.8  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10100  site-specific recombinase XerD  21.17 
 
 		 332 aa  58.2  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3433  phage integrase family protein  20.88 
 
 		 345 aa  58.2  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  23.53 
 
 		 307 aa  57.8  0.0000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1473  tyrosine recombinase XerD  43.06 
 
 		 296 aa  57.4  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202075  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09590  tyrosine recombinase XerD  22.76 
 
 		 302 aa  57.4  0.0000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0503565 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  26.63 
 
 		 302 aa  57.4  0.0000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0938  site-specific recombinase IntI4  36.9 
 
 		 320 aa  57.4  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000827497  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03738  putative integrase  48.28 
 
 		 322 aa  57  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3474  site-specific tyrosine recombinase XerC  22.65 
 
 		 296 aa  57  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.486058 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0381  tyrosine recombinase XerD  28.57 
 
 		 303 aa  57  0.0000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1432  tyrosine recombinase XerD  26.06 
 
 		 321 aa  57.4  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0895087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02003  integrase  48.21 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  27.03 
 
 		 302 aa  57  0.0000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1600  phage integrase family protein  23.64 
 
 		 404 aa  57  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  26.09 
 
 		 302 aa  56.6  0.0000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7619  integrase family protein  22.39 
 
 		 292 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.192826  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7462  integrase family protein  22.39 
 
 		 292 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6605  integrase family protein  22.39 
 
 		 292 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1971  tyrosine recombinase XerD subunit  37.5 
 
 		 309 aa  56.6  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000860406  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>