56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3869 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3869  integrase family protein  100 
 
 		 381 aa  763    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3311  phage integrase  45.64 
 
 		 404 aa  335  5e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3365  phage integrase  45.27 
 
 		 412 aa  322  6e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3803  integrase family protein  38.13 
 
 		 368 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2413  phage integrase  35.92 
 
 		 400 aa  215  8e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.786857  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4124  integrase family protein  35.43 
 
 		 385 aa  207  3e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2257  phage integrase family protein  37.95 
 
 		 363 aa  197  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.0034941  normal  0.642714 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5804  integrase family protein  33.49 
 
 		 417 aa  184  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.991993  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0203  phage integrase family protein  32.77 
 
 		 353 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.205321  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1905  integrase family protein  27.59 
 
 		 440 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.583274 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0776  phage integrase  26.67 
 
 		 334 aa  87  5e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.228831  normal  0.0322595 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0477  hypothetical protein  36.18 
 
 		 241 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.15798 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0473  integrase family protein  30.49 
 
 		 377 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1721  phage integrase family protein  27.21 
 
 		 332 aa  77.4  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.108351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3805  integrase  27.94 
 
 		 332 aa  77.8  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.239705  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1170  integrase family protein  29.27 
 
 		 368 aa  74.3  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.453741  normal  0.429636 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2501  integrase family protein  24.22 
 
 		 348 aa  66.6  0.0000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.137002  normal  0.0538174 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  31.29 
 
 		 404 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0604  hypothetical protein  50.94 
 
 		 456 aa  64.3  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1893  phage-related integrase  27.53 
 
 		 179 aa  58.9  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2440  tyrosine recombinase XerD  29.79 
 
 		 332 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.691328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3274  phage integrase family site specific recombinase  29.27 
 
 		 159 aa  54.3  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0209  phage integrase family protein  33.8 
 
 		 379 aa  53.9  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1492  phage integrase family protein  30.23 
 
 		 134 aa  53.5  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.278019 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003284  integrase  23.85 
 
 		 401 aa  53.1  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1533  phage integrase family protein  26.9 
 
 		 304 aa  52.4  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.372982  normal  0.858007 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3986  phage integrase family site specific recombinase  28.48 
 
 		 172 aa  52.4  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  24.77 
 
 		 367 aa  52  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  28.92 
 
 		 429 aa  51.2  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  26.83 
 
 		 388 aa  50.8  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2794  integrase family protein  25.9 
 
 		 330 aa  50.4  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3047  phage integrase  25.96 
 
 		 381 aa  50.1  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.182322  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0926  phage integrase family protein  25.96 
 
 		 381 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0447  phage integrase  25.96 
 
 		 381 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2735  tyrosine recombinase XerD  28.94 
 
 		 328 aa  47  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.206607 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2512  tyrosine recombinase XerD  28.94 
 
 		 328 aa  47  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.234856 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1674  tyrosine recombinase XerD  36.26 
 
 		 297 aa  45.8  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0517708  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2002  phage integrase  26.09 
 
 		 188 aa  45.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0764365 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  37.14 
 
 		 295 aa  44.7  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6131  integrase family protein  25.52 
 
 		 305 aa  44.7  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2882  phage integrase  34.62 
 
 		 341 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.948794  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3066  phage integrase  34.62 
 
 		 341 aa  44.3  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15230  site-specific tyrosine recombinase XerD  45.28 
 
 		 316 aa  44.7  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0614301  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1622  tyrosine recombinase XerD  27.06 
 
 		 310 aa  44.7  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2622  integrase family protein  36.76 
 
 		 335 aa  44.3  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.647869  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  26.38 
 
 		 412 aa  44.3  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4008  phage-related integrase  26.9 
 
 		 398 aa  44.3  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1037  Phage integrase  27.13 
 
 		 338 aa  43.9  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  22.19 
 
 		 353 aa  43.5  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2436  tyrosine recombinase XerD  32.53 
 
 		 305 aa  43.5  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.578966 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  34.94 
 
 		 282 aa  43.5  0.007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1136  phage integrase family protein  22.75 
 
 		 513 aa  43.1  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3132  phage integrase family site specific recombinase  27.04 
 
 		 222 aa  42.7  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1554  putative integrase/recombinase protein  28.57 
 
 		 354 aa  43.1  0.009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  19.85 
 
 		 379 aa  42.7  0.01  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0590  tyrosine recombinase XerD  35.44 
 
 		 306 aa  42.7  0.01  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>