249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_1492 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_1492  phage integrase family protein  100 
 
 		 134 aa  271  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.278019 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0776  phage integrase  65.41 
 
 		 334 aa  189  1e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.228831  normal  0.0322595 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3805  integrase  55.97 
 
 		 332 aa  141  3e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.239705  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1721  phage integrase family protein  55.97 
 
 		 332 aa  140  7e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.108351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3986  phage integrase family site specific recombinase  33.6 
 
 		 172 aa  67  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3274  phage integrase family site specific recombinase  31.62 
 
 		 159 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3803  integrase family protein  36.92 
 
 		 368 aa  65.5  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4124  integrase family protein  39.42 
 
 		 385 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2501  integrase family protein  32.28 
 
 		 348 aa  61.6  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.137002  normal  0.0538174 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2923  phage integrase  33.58 
 
 		 379 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2967  phage integrase family protein  33.58 
 
 		 379 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.132884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7637  integrase family protein  35.45 
 
 		 425 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1849  integrase family protein  34.72 
 
 		 413 aa  57.4  0.00000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3311  phage integrase  33.59 
 
 		 404 aa  57.4  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  43.28 
 
 		 377 aa  57.4  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  27.87 
 
 		 367 aa  57  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3365  phage integrase  30.47 
 
 		 412 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1927  phage integrase  30.99 
 
 		 379 aa  53.9  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0252061  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2236  integrase family protein  28.85 
 
 		 340 aa  53.9  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0483412  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3869  integrase family protein  30.23 
 
 		 381 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2252  phage integrase  30.6 
 
 		 305 aa  52.8  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.442177  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2297  integrative genetic element Ppu40, integrase  29.89 
 
 		 274 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.880812  normal  0.023746 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0860  integrase family protein  35.14 
 
 		 370 aa  52.4  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  28.46 
 
 		 388 aa  52.4  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3520  integrase family protein  35.21 
 
 		 365 aa  52.4  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3903  phage integrase family site specific recombinase  29.25 
 
 		 99 aa  52.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.823274  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  35.62 
 
 		 435 aa  51.6  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0959  Phage integrase  38.98 
 
 		 392 aa  51.6  0.000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
 
NC_013165  Shel_15860  site-specific recombinase XerD  30.12 
 
 		 398 aa  51.6  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0008266  hitchhiker  0.0000733221 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0222  integrase family protein  36.84 
 
 		 343 aa  52  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.948796  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0926  integrase family protein  37.5 
 
 		 438 aa  51.6  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  30.84 
 
 		 477 aa  51.6  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0995  site-specific recombinase, phage integrase family  34.57 
 
 		 349 aa  51.6  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00503137  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1299  phage integrase family site specific recombinase  38.71 
 
 		 98 aa  51.6  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1966  phage integrase family protein  40 
 
 		 403 aa  51.6  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00610288  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0829  integrase  32.1 
 
 		 388 aa  50.8  0.000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.141939  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0770  phage integrase family protein  30.71 
 
 		 387 aa  51.2  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.17567  normal  0.038003 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3091  phage integrase family protein  29.17 
 
 		 384 aa  50.8  0.000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4726  integrase family protein  29.32 
 
 		 404 aa  50.8  0.000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.981437  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08320  site-specific recombinase XerD  31.65 
 
 		 460 aa  50.4  0.000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.113738 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2777  integrase family protein  26.89 
 
 		 387 aa  49.7  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.684948  normal  0.708845 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4828  phage integrase  35.87 
 
 		 433 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.281268  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3662  integrase family protein  36.84 
 
 		 389 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000552191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  28.71 
 
 		 393 aa  50.1  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0600  prophage DLP12 integrase  31.03 
 
 		 387 aa  49.7  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000371504 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2020  LigA  40 
 
 		 397 aa  48.9  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.389387  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  28.93 
 
 		 429 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3390  phage integrase  34.51 
 
 		 380 aa  49.3  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0603  prophage DLP12 integrase  29.89 
 
 		 387 aa  49.3  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.591827  normal  0.109932 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3318  integrase family protein  28.69 
 
 		 423 aa  49.3  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.00000001885  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0447  phage integrase  33.33 
 
 		 381 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0926  phage integrase family protein  33.33 
 
 		 381 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14150  site-specific recombinase XerD  36.67 
 
 		 451 aa  49.3  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3047  phage integrase  34.57 
 
 		 381 aa  49.3  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.182322  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26510  site-specific recombinase XerD  28.75 
 
 		 443 aa  48.9  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.938683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0993  phage integrase family protein  27.62 
 
 		 121 aa  48.1  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  29.17 
 
 		 412 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0046  Phage integrase  34.92 
 
 		 251 aa  48.5  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.380307  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1187  integrase family protein  25.64 
 
 		 370 aa  48.5  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.474728  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6364  integrase family protein  33.93 
 
 		 398 aa  48.5  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3738  hypothetical protein  28.33 
 
 		 384 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0290  integrase  29.89 
 
 		 324 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0955438  normal  0.658855 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  27.97 
 
 		 397 aa  48.1  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  26.17 
 
 		 404 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03598  site-specific recombinase, phage integrase family protein  30.3 
 
 		 380 aa  47.8  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.951563  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1190  integrase family protein  39.66 
 
 		 463 aa  47.8  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0366  site-specific recombinase, phage integrase family  32.18 
 
 		 387 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529105  hitchhiker  0.00000000819042 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  32.35 
 
 		 378 aa  47.4  0.00006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0473  integrase family protein  31.3 
 
 		 377 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0354  phage integrase family site specific recombinase  29.36 
 
 		 355 aa  47.4  0.00007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1985  phage integrase family protein  41.82 
 
 		 469 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.630467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3007  integrase family protein  42.11 
 
 		 436 aa  47.4  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5550  phage integrase family protein  25.51 
 
 		 365 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5293  integrase family protein  29.41 
 
 		 399 aa  47.4  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4490  phage integrase family protein  25.51 
 
 		 365 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6537  normal  0.0343494 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0121  integrase family protein  33.33 
 
 		 422 aa  47  0.00008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.534504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  29.33 
 
 		 337 aa  47  0.00009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00486  predicted integrase  31.03 
 
 		 387 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0996  phage integrase family protein  28.74 
 
 		 387 aa  47  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000294682 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3066  phage integrase  32.41 
 
 		 341 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  26.87 
 
 		 390 aa  46.2  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5577  phage integrase  43.86 
 
 		 344 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0745  phage integrase family protein  28.18 
 
 		 357 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.107824 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2882  phage integrase  34.94 
 
 		 341 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.948794  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0563  phage integrase family protein  38 
 
 		 361 aa  46.2  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5980  phage integrase family protein  43.86 
 
 		 364 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.409193 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1704  phage integrase family protein  43.86 
 
 		 364 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.91638 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5043  integrase family protein  32.81 
 
 		 160 aa  46.2  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00491  hypothetical protein  31.03 
 
 		 387 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  25.98 
 
 		 421 aa  45.8  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06590  site-specific recombinase, integrase family  38.46 
 
 		 312 aa  45.8  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0527476  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1839  integrase family protein  36.36 
 
 		 310 aa  46.2  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2069  phage integrase  26.85 
 
 		 359 aa  46.2  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  hitchhiker  0.000737798 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1893  phage-related integrase  25.44 
 
 		 179 aa  45.8  0.0002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1724  phage integrase family protein  28.57 
 
 		 378 aa  45.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  28.99 
 
 		 369 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20700  site-specific recombinase, integrase family  38.46 
 
 		 395 aa  45.8  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3398  phage integrase family site specific recombinase  28.33 
 
 		 407 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  27.97 
 
 		 411 aa  45.1  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23910  site-specific recombinase XerD  31.31 
 
 		 402 aa  45.1  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.075478  normal  0.15395 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>