104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_0473 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_0473  integrase family protein  100 
 
 		 377 aa  777    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1170  integrase family protein  39.66 
 
 		 368 aa  249  7e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.453741  normal  0.429636 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4008  phage-related integrase  28.69 
 
 		 398 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0776  phage integrase  29.74 
 
 		 334 aa  106  7e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.228831  normal  0.0322595 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1893  phage-related integrase  35.67 
 
 		 179 aa  90.1  6e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3869  integrase family protein  30.49 
 
 		 381 aa  79.3  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3803  integrase family protein  25.94 
 
 		 368 aa  77.4  0.0000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2501  integrase family protein  24.78 
 
 		 348 aa  76.6  0.0000000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.137002  normal  0.0538174 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  24.31 
 
 		 400 aa  73.6  0.000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3805  integrase  34.08 
 
 		 332 aa  72  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.239705  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0203  phage integrase family protein  25.82 
 
 		 353 aa  70.5  0.00000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.205321  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2692  phage integrase  27.07 
 
 		 404 aa  70.1  0.00000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.344187  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1721  phage integrase family protein  32.02 
 
 		 332 aa  70.1  0.00000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.108351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2157  phage integrase  29.2 
 
 		 363 aa  67.8  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0421336  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  22.3 
 
 		 337 aa  65.1  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4502  integrase family protein  27.49 
 
 		 290 aa  65.5  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1037  Phage integrase  26.54 
 
 		 338 aa  63.9  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2782  phage integrase family protein  29.93 
 
 		 356 aa  63.9  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.507501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1633  phage integrase  29.65 
 
 		 362 aa  63.5  0.000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2257  phage integrase family protein  28.76 
 
 		 363 aa  63.5  0.000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.0034941  normal  0.642714 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3986  phage integrase family site specific recombinase  30.46 
 
 		 172 aa  62  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1487  phage integrase family protein  29.33 
 
 		 342 aa  61.2  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.115706  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3365  phage integrase  25.2 
 
 		 412 aa  60.1  0.00000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0222  integrase family protein  24.92 
 
 		 343 aa  60.1  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.948796  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1143  integrase family protein  29 
 
 		 412 aa  59.7  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000465357  unclonable  7.38755e-19 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1173  phage integrase family site specific recombinase  26.75 
 
 		 354 aa  59.7  0.00000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1392  putative phage related integrase  24.42 
 
 		 474 aa  58.2  0.0000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.107994  normal  0.0869057 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  23.04 
 
 		 379 aa  57.4  0.0000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2851  integrase family protein  24.39 
 
 		 391 aa  57.4  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0747  integrase family protein  22.14 
 
 		 325 aa  57.4  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.194299  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3311  phage integrase  29.71 
 
 		 404 aa  57  0.0000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3274  phage integrase family site specific recombinase  29.11 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2413  phage integrase  30.47 
 
 		 400 aa  56.6  0.0000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.786857  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0832  Phage integrase  24.43 
 
 		 341 aa  55.1  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  25.93 
 
 		 414 aa  54.7  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1796  Phage integrase  22.56 
 
 		 390 aa  54.3  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2069  phage integrase family protein  25.68 
 
 		 419 aa  54.3  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0530977  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1633  Phage integrase  21.26 
 
 		 368 aa  54.3  0.000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.576304  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2267  phage integrase  25.1 
 
 		 392 aa  54.3  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000397895  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2134  integrase family protein  25.81 
 
 		 407 aa  53.9  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.565858  normal  0.985536 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0262  integrase family protein  26.83 
 
 		 291 aa  53.5  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0995  site-specific recombinase, phage integrase family  28.5 
 
 		 349 aa  53.1  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00503137  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0253  integrase family protein  25.93 
 
 		 435 aa  53.1  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000373788  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2314  phage integrase family protein  25.5 
 
 		 392 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0243817  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2897  phage integrase family protein  27.13 
 
 		 386 aa  52.4  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1299  ATP synthase C chain (Lipid-binding protein)(dicyclohexylcarbodiimide-binding protein)  26.67 
 
 		 276 aa  52.4  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.138166  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2348  phage integrase family protein  25.6 
 
 		 301 aa  52  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2978  integrase family protein  27.31 
 
 		 377 aa  51.6  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.230554  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5804  integrase family protein  27.27 
 
 		 417 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.991993  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2356  phage integrase family protein  26.61 
 
 		 392 aa  51.2  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000232607  hitchhiker  0.000274891 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4124  integrase family protein  24.22 
 
 		 385 aa  51.6  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3398  phage integrase family site specific recombinase  25.15 
 
 		 407 aa  50.4  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2312  hypothetical protein  23.46 
 
 		 364 aa  50.1  0.00006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0371  phage integrase  27.66 
 
 		 471 aa  49.7  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000794278  normal  0.310006 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  23.94 
 
 		 383 aa  49.3  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1208  phage integrase  25.47 
 
 		 476 aa  48.5  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1249  integrase family protein  21.43 
 
 		 388 aa  48.5  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.447999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  26.77 
 
 		 391 aa  48.1  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4806  phage integrase  26.4 
 
 		 291 aa  47.8  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.92941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  21.27 
 
 		 367 aa  47.8  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00486  predicted integrase  24.54 
 
 		 387 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1492  phage integrase family protein  31.3 
 
 		 134 aa  47.4  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.278019 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2668  phage integrase family site specific recombinase  24.3 
 
 		 411 aa  47.4  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00491  hypothetical protein  24.54 
 
 		 387 aa  47.4  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0476  integrase family protein  25.16 
 
 		 371 aa  47.4  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2455  phage integrase  23.16 
 
 		 370 aa  47  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0686  phage integrase family protein  24.18 
 
 		 397 aa  47.4  0.0005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0848514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  23.44 
 
 		 477 aa  47  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  23.75 
 
 		 385 aa  47.4  0.0005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1638  phage-related integrase  43.14 
 
 		 129 aa  47  0.0006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1581  hypothetical protein  43.14 
 
 		 109 aa  46.6  0.0007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0915867  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6957  integrase family protein  24.89 
 
 		 292 aa  46.6  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0831  integrase family protein  26.94 
 
 		 378 aa  46.6  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1474  phage integrase family site specific recombinase  24.28 
 
 		 386 aa  46.6  0.0008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0051357  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0845  phage integrase  33.65 
 
 		 457 aa  46.6  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1326  phage integrase family protein  33.65 
 
 		 457 aa  46.6  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.558955  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2236  integrase family protein  22.81 
 
 		 340 aa  46.2  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0483412  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3026  hypothetical protein  26.62 
 
 		 403 aa  45.4  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.85184  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3658  putative bacteriophage integrase  28.41 
 
 		 444 aa  46.2  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3592  phage integrase family protein  23.36 
 
 		 419 aa  45.8  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003284  integrase  21.11 
 
 		 401 aa  45.8  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  25.57 
 
 		 275 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0822  putative phage integrase  25.56 
 
 		 291 aa  45.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.341397 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0726  phage integrase family protein  25.13 
 
 		 401 aa  45.4  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000125813  decreased coverage  0.0000000856927 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1647  phage integrase family protein  27.04 
 
 		 322 aa  45.1  0.002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0765801  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3980  phage integrase family protein  26.2 
 
 		 365 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.356268  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1600  phage integrase family protein  25.84 
 
 		 404 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0600  prophage DLP12 integrase  25.12 
 
 		 387 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000371504 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0272  phage integrase family site specific recombinase  33.33 
 
 		 386 aa  44.3  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6923  integrase family protein  32 
 
 		 430 aa  44.3  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1324  Phage integrase  27.84 
 
 		 411 aa  44.3  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000225151  hitchhiker  0.00877617 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3128  integrase family protein  24.48 
 
 		 384 aa  43.9  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.169868  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0290  integrase  24.14 
 
 		 324 aa  44.3  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0955438  normal  0.658855 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2794  integrase family protein  29.11 
 
 		 330 aa  43.9  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0829  integrase  25.82 
 
 		 388 aa  43.5  0.005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.141939  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4388  integrase family protein  22.74 
 
 		 399 aa  43.9  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.754595  normal  0.599822 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0710  Integrase protein  28.17 
 
 		 343 aa  43.9  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2633  phage integrase family protein  23.56 
 
 		 419 aa  43.5  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2093  integrase family protein  25.31 
 
 		 400 aa  43.5  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  24.9 
 
 		 369 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>