115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_0203 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009667  Oant_0203  phage integrase family protein  100 
 
 		 353 aa  727    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.205321  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5804  integrase family protein  39.08 
 
 		 417 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.991993  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3803  integrase family protein  38.01 
 
 		 368 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3311  phage integrase  40 
 
 		 404 aa  224  2e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4124  integrase family protein  37.43 
 
 		 385 aa  217  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3365  phage integrase  38.23 
 
 		 412 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3869  integrase family protein  32.77 
 
 		 381 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2257  phage integrase family protein  35.52 
 
 		 363 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.0034941  normal  0.642714 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2413  phage integrase  30.59 
 
 		 400 aa  151  1e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.786857  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1905  integrase family protein  27.98 
 
 		 440 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.583274 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2501  integrase family protein  26.6 
 
 		 348 aa  95.5  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.137002  normal  0.0538174 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0477  hypothetical protein  36.57 
 
 		 241 aa  84  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.15798 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1170  integrase family protein  26.83 
 
 		 368 aa  77.8  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.453741  normal  0.429636 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3805  integrase  28.9 
 
 		 332 aa  74.7  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.239705  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0776  phage integrase  28.19 
 
 		 334 aa  74.3  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.228831  normal  0.0322595 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1721  phage integrase family protein  28.57 
 
 		 332 aa  73.9  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.108351  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0473  integrase family protein  25.82 
 
 		 377 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0995  site-specific recombinase, phage integrase family  25.37 
 
 		 349 aa  62  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00503137  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1463  site-specific recombinase, phage integrase family  26.75 
 
 		 385 aa  60.8  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000119227  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1037  Phage integrase  22.88 
 
 		 338 aa  60.5  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0832  Phage integrase  26.37 
 
 		 341 aa  59.7  0.00000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4851  integrase family protein  26.83 
 
 		 294 aa  59.7  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1037  phage integrase family protein  26.69 
 
 		 372 aa  58.5  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.197081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0272  phage integrase family site specific recombinase  25.62 
 
 		 386 aa  58.5  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  25.44 
 
 		 284 aa  58.5  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1062  integrase family protein  27.59 
 
 		 391 aa  56.2  0.0000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.489924  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0012  integrase family protein  30.45 
 
 		 383 aa  55.5  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000168789  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0883  phage integrase family site specific recombinase  30.34 
 
 		 435 aa  55.1  0.000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0113166  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1487  phage integrase  26.36 
 
 		 376 aa  53.5  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.16076  normal  0.536181 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  29.41 
 
 		 295 aa  53.5  0.000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1633  Phage integrase  22.05 
 
 		 368 aa  53.1  0.000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.576304  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2692  phage integrase  25.34 
 
 		 404 aa  52  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.344187  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0996  phage integrase family protein  25.1 
 
 		 387 aa  52  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000294682 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  25.85 
 
 		 381 aa  52  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  29.46 
 
 		 294 aa  51.6  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3128  integrase family protein  28.12 
 
 		 384 aa  52  0.00002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.169868  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0335  phage integrase family protein  33.12 
 
 		 356 aa  51.2  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.224886 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1092  phage integrase  23.59 
 
 		 276 aa  51.2  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00970061  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2540  integrase family protein  23.96 
 
 		 373 aa  51.2  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000519986  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0603  prophage DLP12 integrase  23.48 
 
 		 387 aa  50.4  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.591827  normal  0.109932 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0770  phage integrase family protein  24.9 
 
 		 387 aa  50.1  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.17567  normal  0.038003 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2297  integrative genetic element Ppu40, integrase  25.19 
 
 		 274 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.880812  normal  0.023746 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0604  hypothetical protein  43.64 
 
 		 456 aa  49.3  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2344  phage integrase  28.37 
 
 		 322 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0456613  normal  0.219342 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0292  phage integrase family protein  32.93 
 
 		 354 aa  48.9  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6131  integrase family protein  26.74 
 
 		 305 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0600  prophage DLP12 integrase  23.69 
 
 		 387 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000371504 
 
 
-
 
NC_004310  BR0636  phage integrase family site specific recombinase  23.61 
 
 		 308 aa  48.1  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4524  Phage integrase  33.33 
 
 		 310 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0772  phage integrase  39.19 
 
 		 304 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0631  phage integrase family site specific recombinase  23.61 
 
 		 308 aa  48.1  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.45439  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0366  site-specific recombinase, phage integrase family  25.11 
 
 		 387 aa  48.5  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529105  hitchhiker  0.00000000819042 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  29.61 
 
 		 477 aa  47.8  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1533  phage integrase family protein  26.11 
 
 		 304 aa  47.4  0.0004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.372982  normal  0.858007 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1465  integrase family protein  27.52 
 
 		 334 aa  47.4  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.890522 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  27.85 
 
 		 332 aa  47  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3986  phage integrase family site specific recombinase  25.86 
 
 		 172 aa  47  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2647  phage integrase family protein  23.18 
 
 		 315 aa  47  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  26.41 
 
 		 388 aa  47  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  27.75 
 
 		 400 aa  46.6  0.0006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  0.00000971423 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  26.11 
 
 		 320 aa  46.6  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6626  putative prophage integrase  23.24 
 
 		 386 aa  46.6  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.351385 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4388  integrase family protein  24.69 
 
 		 399 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.754595  normal  0.599822 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0435  integrase family protein  38.6 
 
 		 299 aa  45.4  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6370  integrase family protein  24.6 
 
 		 438 aa  45.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1208  phage integrase  27.41 
 
 		 476 aa  45.8  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0926  phage integrase family site specific recombinase  24.32 
 
 		 354 aa  46.2  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000719898  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  25.79 
 
 		 379 aa  45.4  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3505  phage integrase family protein  27.04 
 
 		 330 aa  46.2  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.431904  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1893  phage-related integrase  42.11 
 
 		 179 aa  46.2  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3550  integrase family protein  29.67 
 
 		 324 aa  45.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.74971  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0290  integrase  23.14 
 
 		 324 aa  45.8  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0955438  normal  0.658855 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2589  DNA integration/recombination/invertion protein  27.16 
 
 		 369 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5359  integrase family protein  27.59 
 
 		 204 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.13733 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00486  predicted integrase  25.68 
 
 		 387 aa  45.1  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2069  phage integrase  26.16 
 
 		 359 aa  45.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  hitchhiker  0.000737798 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  27.27 
 
 		 393 aa  45.1  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0669  phage integrase family protein  35.38 
 
 		 343 aa  45.1  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2794  integrase family protein  26.04 
 
 		 330 aa  45.1  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011733  PCC7424_5613  hypothetical protein  24.19 
 
 		 273 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011734  PCC7424_5625  integrase family protein  24.19 
 
 		 273 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00491  hypothetical protein  25.68 
 
 		 387 aa  45.1  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0861  integrase/recombinase XerC  28.48 
 
 		 304 aa  44.3  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  23 
 
 		 296 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2861  phage integrase family protein  35.59 
 
 		 153 aa  44.3  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328637 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1412  integrase family protein  37.29 
 
 		 323 aa  44.3  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.157207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0989  integrase family protein  23 
 
 		 355 aa  44.3  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000138199  hitchhiker  0.00000000000000368709 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2249  putative transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 325 aa  44.7  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  23 
 
 		 296 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0567  integrase family protein  21.98 
 
 		 391 aa  44.7  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.563798  hitchhiker  0.00485057 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  31.88 
 
 		 302 aa  43.9  0.004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0357  integrase family protein  26.27 
 
 		 389 aa  44.3  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0817  tyrosine recombinase XerD  34.85 
 
 		 305 aa  43.9  0.004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.763193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2734  DNA integration/recombination/invertion protein  26.67 
 
 		 369 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.117201  hitchhiker  0.0000120563 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1185  tyrosine recombinase XerD  25.22 
 
 		 310 aa  43.9  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497096  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  23.8 
 
 		 400 aa  43.9  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0092  integrase family protein  25.54 
 
 		 270 aa  43.5  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.554655  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  28.04 
 
 		 295 aa  43.5  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2499  phage integrase family protein  28.14 
 
 		 381 aa  43.9  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.005662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3047  phage integrase  23.32 
 
 		 381 aa  43.9  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.182322  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>