20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2413 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2413  phage integrase  100 
 
 		 400 aa  820    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.786857  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3869  integrase family protein  35.92 
 
 		 381 aa  215  9e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3311  phage integrase  37.23 
 
 		 404 aa  215  9.999999999999999e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3365  phage integrase  35.31 
 
 		 412 aa  209  8e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3803  integrase family protein  32.84 
 
 		 368 aa  190  4e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4124  integrase family protein  33.9 
 
 		 385 aa  176  6e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0203  phage integrase family protein  30.59 
 
 		 353 aa  151  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.205321  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5804  integrase family protein  30.59 
 
 		 417 aa  145  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.991993  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2257  phage integrase family protein  30.79 
 
 		 363 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.0034941  normal  0.642714 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1905  integrase family protein  24.72 
 
 		 440 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.583274 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0473  integrase family protein  30.47 
 
 		 377 aa  56.6  0.0000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0477  hypothetical protein  29.2 
 
 		 241 aa  48.5  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.15798 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2501  integrase family protein  21.59 
 
 		 348 aa  47.8  0.0004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.137002  normal  0.0538174 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1721  phage integrase family protein  30.36 
 
 		 332 aa  46.6  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.108351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3805  integrase  29.76 
 
 		 332 aa  45.8  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.239705  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00310  site-specific recombinase, phage integrase family protein  32.98 
 
 		 429 aa  45.4  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3866  phage integrase family site specific recombinase  33.33 
 
 		 368 aa  45.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3198  phage integrase family protein  40 
 
 		 481 aa  44.7  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00055916  hitchhiker  0.0000000690762 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1893  phage-related integrase  23.85 
 
 		 179 aa  43.9  0.006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3541  phage integrase family protein  30.23 
 
 		 452 aa  43.1  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>