More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3592 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_2633  phage integrase family protein  87.29 
 
 		 419 aa  761    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3592  phage integrase family protein  100 
 
 		 419 aa  865    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3281  integrase family protein  43.58 
 
 		 372 aa  246  6e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.739809 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2705  phage integrase family protein  40.95 
 
 		 386 aa  231  3e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248695  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5336  integrase family protein  43.57 
 
 		 378 aa  220  3e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.850487 
 
 
-
 
NC_002950  PG0874  mobilizable transposon, int protein  42.27 
 
 		 367 aa  219  7e-56  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0746163 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0211  integrase family protein  40.54 
 
 		 384 aa  193  4e-48  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000967186 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4262  integrase family protein  36.1 
 
 		 379 aa  192  1e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2069  phage integrase family protein  35.76 
 
 		 419 aa  188  2e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0530977  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1600  phage integrase family protein  34.56 
 
 		 404 aa  180  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4000  phage integrase family protein  36.62 
 
 		 389 aa  171  2e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1173  phage integrase family site specific recombinase  35.56 
 
 		 354 aa  109  8.000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0676  integrase family protein  29.51 
 
 		 390 aa  107  4e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0616  integrase family protein  26.69 
 
 		 394 aa  102  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0952  integrase family protein  30.92 
 
 		 412 aa  101  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.571908  normal  0.0199815 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5219  integrase family protein  33.33 
 
 		 406 aa  97.4  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.759008  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1113  integrase  29.92 
 
 		 407 aa  93.6  6e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2366  integrase family protein  28.52 
 
 		 415 aa  93.2  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0819  integrase  27.91 
 
 		 409 aa  82  0.00000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1454  integrase  27.91 
 
 		 409 aa  82  0.00000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  29.39 
 
 		 295 aa  80.9  0.00000000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11843  putative transposase  33.14 
 
 		 416 aa  79  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.383494  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0145  integrase family protein  28.94 
 
 		 411 aa  77.8  0.0000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.468231  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4202  integrase family protein  28.68 
 
 		 406 aa  76.6  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  27.5 
 
 		 332 aa  76.3  0.0000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  27.83 
 
 		 300 aa  76.3  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1092  phage integrase  28.38 
 
 		 276 aa  75.5  0.000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00970061  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  29.96 
 
 		 402 aa  75.9  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0358  integrase family protein  28.71 
 
 		 287 aa  75.1  0.000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  26.74 
 
 		 282 aa  75.5  0.000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1556  site-specific recombinase, phage integrase family  26.22 
 
 		 331 aa  74.7  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1271  integrase family protein  26.22 
 
 		 331 aa  74.7  0.000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.828065  normal  0.193617 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2383  tyrosine recombinase XerD  31.22 
 
 		 295 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3204  integron integrase  42.86 
 
 		 322 aa  72  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3122  phage integrase family protein  31.4 
 
 		 393 aa  72  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1844  DNA integrase  50.77 
 
 		 335 aa  71.2  0.00000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1823  integrase family protein  32.19 
 
 		 253 aa  71.2  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.987007  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2954  integrase family protein  29.03 
 
 		 409 aa  70.9  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3585  phage integrase  29.65 
 
 		 411 aa  70.5  0.00000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.597607 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1639  integrase family protein  27.27 
 
 		 301 aa  70.5  0.00000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0514216  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1355  phage integrase family site specific recombinase  44.05 
 
 		 318 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.73063 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  29.61 
 
 		 397 aa  70.1  0.00000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  26.35 
 
 		 307 aa  68.9  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1037  Phage integrase  26.48 
 
 		 338 aa  68.9  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  25.21 
 
 		 290 aa  69.3  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  26.85 
 
 		 307 aa  69.3  0.0000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2329  tyrosine recombinase XerD  25.24 
 
 		 277 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00235896  normal  0.0350779 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2535  phage integrase  31.46 
 
 		 463 aa  68.6  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4583  tyrosine recombinase XerD  31.46 
 
 		 317 aa  68.9  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.422443 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0688  integrase family protein  31.74 
 
 		 336 aa  67.8  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  29.25 
 
 		 294 aa  68.2  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000138339  normal  0.959316 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  25.42 
 
 		 320 aa  67.8  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0322  phage integrase family protein  26.6 
 
 		 379 aa  68.2  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00211784  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0820  integrase  27.56 
 
 		 400 aa  67.4  0.0000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1453  integrase  27.56 
 
 		 400 aa  67.4  0.0000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1780  phage integrase family protein  30.82 
 
 		 256 aa  67.4  0.0000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000232909  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003169  integron integrase IntI4  50.77 
 
 		 320 aa  67  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2378  tyrosine recombinase XerD  27.05 
 
 		 296 aa  67.4  0.0000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1029  integrase family protein  27.31 
 
 		 400 aa  67.4  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0092  integrase family protein  29.05 
 
 		 270 aa  67  0.0000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.554655  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0419  integrase family protein  27.82 
 
 		 414 aa  67.4  0.0000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000230336  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02003  integrase  52.38 
 
 		 318 aa  67  0.0000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  26.01 
 
 		 307 aa  67  0.0000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3398  phage integrase family site specific recombinase  26.09 
 
 		 407 aa  67  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00445  tyrosine type site-specific recombinase  26.27 
 
 		 405 aa  67  0.0000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.459489  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2175  tyrosine recombinase XerD  26.94 
 
 		 299 aa  67  0.0000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1622  tyrosine recombinase XerD  27.43 
 
 		 310 aa  67  0.0000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2127  tyrosine recombinase XerD  30.12 
 
 		 308 aa  66.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1337  integrase family protein  26.07 
 
 		 392 aa  66.2  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0155558  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3500  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.76 
 
 		 314 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.385537  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0687  Phage integrase  27.16 
 
 		 310 aa  66.2  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.004827  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  49.15 
 
 		 295 aa  65.9  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4643  integron integrase  47.62 
 
 		 319 aa  66.2  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3248  integrase family protein  23.66 
 
 		 437 aa  65.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  23.84 
 
 		 295 aa  65.9  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1131  integron integrase  47.62 
 
 		 319 aa  66.2  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4114  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.09 
 
 		 322 aa  66.2  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1878  tyrosine recombinase XerD  30.39 
 
 		 292 aa  66.2  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1349  integrase family protein  31.91 
 
 		 291 aa  65.5  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2705  integrase family protein  27.35 
 
 		 304 aa  65.1  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.800791  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.58 
 
 		 299 aa  65.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.58 
 
 		 299 aa  65.5  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2332  tyrosine recombinase XerD  30.17 
 
 		 292 aa  65.1  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0534  site-specific recombinase IntIA  35.4 
 
 		 327 aa  65.1  0.000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.58 
 
 		 299 aa  65.5  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3213  integrase family protein  29.67 
 
 		 388 aa  65.1  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  28.17 
 
 		 295 aa  65.1  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0401  integrase family protein  22.9 
 
 		 310 aa  65.1  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3091  phage integrase family protein  28.88 
 
 		 384 aa  65.1  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.58 
 
 		 299 aa  65.5  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2249  putative transcriptional regulator, TetR family  44.62 
 
 		 325 aa  65.5  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0410  integron integrase  47.69 
 
 		 334 aa  65.5  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.761535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0927  tyrosine recombinase XerD  50.91 
 
 		 304 aa  65.1  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.05 
 
 		 299 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  29.71 
 
 		 297 aa  65.5  0.000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0938  site-specific recombinase IntI4  60 
 
 		 320 aa  65.5  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000827497  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3450  tyrosine recombinase XerD  49.09 
 
 		 322 aa  64.3  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.05 
 
 		 299 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0678  tyrosine recombinase XerD  28.33 
 
 		 294 aa  64.7  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0265142 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  25 
 
 		 367 aa  64.7  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>