More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_0676 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_0676  integrase family protein  100 
 
 		 390 aa  814    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0616  integrase family protein  63.66 
 
 		 394 aa  522  1e-147  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2069  phage integrase family protein  29.33 
 
 		 419 aa  145  9e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0530977  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3281  integrase family protein  27.98 
 
 		 372 aa  124  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.739809 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3592  phage integrase family protein  29.51 
 
 		 419 aa  107  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1173  phage integrase family site specific recombinase  26.26 
 
 		 354 aa  107  5e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5336  integrase family protein  24.63 
 
 		 378 aa  106  7e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.850487 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0211  integrase family protein  26.03 
 
 		 384 aa  105  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000967186 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2633  phage integrase family protein  27.21 
 
 		 419 aa  97.4  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4000  phage integrase family protein  27.56 
 
 		 389 aa  96.7  7e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1600  phage integrase family protein  27.12 
 
 		 404 aa  93.6  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4262  integrase family protein  25.34 
 
 		 379 aa  92.4  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2705  phage integrase family protein  26.37 
 
 		 386 aa  88.2  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248695  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0874  mobilizable transposon, int protein  22.65 
 
 		 367 aa  78.6  0.0000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0746163 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4572  integrase family protein  28.04 
 
 		 373 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0974  integrase family protein  23.9 
 
 		 430 aa  69.7  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0711773  normal  0.0223597 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5219  integrase family protein  23.4 
 
 		 406 aa  63.5  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.759008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0952  integrase family protein  24.05 
 
 		 412 aa  62  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.571908  normal  0.0199815 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  25.59 
 
 		 295 aa  60.8  0.00000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4550  integrase family protein  26.14 
 
 		 362 aa  59.7  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  0.798479 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7620  integrase family protein  27.33 
 
 		 343 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.998258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0539  integrase family protein  29.37 
 
 		 436 aa  58.9  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.19804 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5541  integrase family protein  31.82 
 
 		 329 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0614894 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0145  integrase family protein  25.21 
 
 		 411 aa  57.4  0.0000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.468231  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6955  integrase family protein  26.69 
 
 		 343 aa  57.4  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  24.92 
 
 		 412 aa  56.6  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2307  integrase family protein  24.45 
 
 		 335 aa  56.2  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.109793  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1249  integrase family protein  22.34 
 
 		 388 aa  55.8  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.447999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1008  phage integrase  23.87 
 
 		 347 aa  55.8  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  26.44 
 
 		 295 aa  55.8  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  26.44 
 
 		 295 aa  55.8  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0890  integrase family protein  27.49 
 
 		 436 aa  56.2  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.304857  normal  0.483711 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  25.84 
 
 		 294 aa  55.5  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000138339  normal  0.959316 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1283  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.78 
 
 		 297 aa  55.5  0.000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2090  integrase family protein  23.78 
 
 		 392 aa  55.5  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.30003  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2649  integrase family protein  24.39 
 
 		 333 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.413706  hitchhiker  0.000000656425 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0063  integrase family protein  24.55 
 
 		 409 aa  54.7  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0967  phage integrase family protein  40.28 
 
 		 324 aa  54.3  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  23.37 
 
 		 429 aa  53.9  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2705  integrase family protein  23.64 
 
 		 304 aa  54.3  0.000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.800791  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0452  tyrosine recombinase XerC subunit  26.07 
 
 		 335 aa  53.9  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.577676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0067  phage integrase family protein  48.28 
 
 		 328 aa  53.5  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  24.89 
 
 		 295 aa  53.5  0.000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  28.79 
 
 		 294 aa  53.5  0.000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0819  integrase  20.72 
 
 		 409 aa  53.5  0.000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1454  integrase  20.72 
 
 		 409 aa  53.5  0.000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1624  phage/XerD family site-specific recombinase  30.67 
 
 		 341 aa  53.1  0.000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.389199 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  26.04 
 
 		 290 aa  53.5  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1137  phage integrase  25.64 
 
 		 296 aa  53.1  0.000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2366  integrase family protein  20 
 
 		 415 aa  53.1  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4644  phage integrase family protein  37.66 
 
 		 637 aa  53.1  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0492  phage integrase family site specific recombinase  26.69 
 
 		 294 aa  52.8  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0248661  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  24.05 
 
 		 294 aa  52.8  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.29 
 
 		 299 aa  52.8  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5364  integrase  25.81 
 
 		 332 aa  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.301624  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0927  tyrosine recombinase XerD  29.23 
 
 		 304 aa  52  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4345  phage integrase family protein  23.02 
 
 		 435 aa  51.2  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  26 
 
 		 298 aa  51.2  0.00003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1381  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.38 
 
 		 298 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00360913  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2241  integrase family protein  23.48 
 
 		 296 aa  51.2  0.00003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000667129 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1189  integrase family protein  40.32 
 
 		 297 aa  51.6  0.00003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000203109  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1695  phage integrase family protein  24.34 
 
 		 296 aa  51.6  0.00003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.363626  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0633  phage integrase family protein  45.45 
 
 		 333 aa  51.2  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.191689  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0818  tyrosine recombinase XerC  48.98 
 
 		 296 aa  50.8  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.368613  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1465  Tn554-related, transposase B  25.09 
 
 		 675 aa  50.8  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00000329851  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0727  tyrosine recombinase XerD  26.92 
 
 		 304 aa  50.8  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.689003 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1312  tyrosine recombinase XerC  48.98 
 
 		 298 aa  50.8  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.199373  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0590  tyrosine recombinase XerD  27.2 
 
 		 306 aa  50.8  0.00004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1337  tyrosine recombinase XerC  48.98 
 
 		 298 aa  50.8  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0149085  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  26.1 
 
 		 302 aa  50.8  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23640  tyrosine recombinase XerC subunit  36.99 
 
 		 310 aa  50.4  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.154193  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  26.69 
 
 		 296 aa  50.4  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0863  phage integrase family protein  21.21 
 
 		 313 aa  50.4  0.00006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4624  integrase family protein  43.08 
 
 		 353 aa  50.1  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0157087  hitchhiker  0.00236939 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1762  phage/XerD family site-specific recombinase  48.08 
 
 		 338 aa  50.1  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  34.67 
 
 		 307 aa  50.1  0.00007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1786  tyrosine recombinase XerD  50 
 
 		 291 aa  50.1  0.00007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0596225  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1769  tyrosine recombinase XerD  27.12 
 
 		 304 aa  49.7  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.151783  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1113  integrase  25.64 
 
 		 407 aa  49.7  0.00009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0626  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.81 
 
 		 315 aa  49.3  0.0001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  36.62 
 
 		 307 aa  48.9  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  50 
 
 		 332 aa  49.3  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11843  putative transposase  21.04 
 
 		 416 aa  49.3  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.383494  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0485  site-specific tyrosine recombinase XerC  51.16 
 
 		 322 aa  49.3  0.0001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.853028 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1126  phage integrase family protein  24.39 
 
 		 367 aa  49.3  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.665365  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0456  phage integrase family protein  46.94 
 
 		 647 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3588  phage integrase family protein  46.94 
 
 		 647 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00892563 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5498  phage integrase family protein  46.94 
 
 		 647 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0714023 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  29.55 
 
 		 296 aa  48.9  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  47.83 
 
 		 293 aa  48.5  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  52.27 
 
 		 296 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  52.27 
 
 		 296 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  52.27 
 
 		 296 aa  48.1  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  52.27 
 
 		 296 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0688  integrase family protein  27.33 
 
 		 336 aa  48.5  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  52.27 
 
 		 296 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4202  integrase family protein  22.98 
 
 		 406 aa  48.5  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3714  tyrosine recombinase XerD  45.45 
 
 		 301 aa  48.5  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1524  integrase family protein  47.17 
 
 		 300 aa  48.5  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.681425  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  51.11 
 
 		 296 aa  48.5  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>