More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_4262 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_4262  integrase family protein  100 
 
 		 379 aa  789    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4000  phage integrase family protein  61.82 
 
 		 389 aa  482  1e-135  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1600  phage integrase family protein  56.88 
 
 		 404 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0211  integrase family protein  46.36 
 
 		 384 aa  319  5e-86  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000967186 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5336  integrase family protein  38.13 
 
 		 378 aa  233  5e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.850487 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3281  integrase family protein  38.36 
 
 		 372 aa  226  5.0000000000000005e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.739809 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2705  phage integrase family protein  33.06 
 
 		 386 aa  202  9e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248695  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2633  phage integrase family protein  36.56 
 
 		 419 aa  197  2.0000000000000003e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3592  phage integrase family protein  36.1 
 
 		 419 aa  192  1e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0874  mobilizable transposon, int protein  35.46 
 
 		 367 aa  187  2e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0746163 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2069  phage integrase family protein  30.8 
 
 		 419 aa  137  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0530977  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1173  phage integrase family site specific recombinase  27.19 
 
 		 354 aa  117  3.9999999999999997e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0616  integrase family protein  26.7 
 
 		 394 aa  102  8e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11843  putative transposase  29.34 
 
 		 416 aa  99.8  8e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.383494  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5219  integrase family protein  27.87 
 
 		 406 aa  93.6  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.759008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0676  integrase family protein  25.34 
 
 		 390 aa  92.4  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1113  integrase  30.41 
 
 		 407 aa  86.7  6e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0145  integrase family protein  25.98 
 
 		 411 aa  86.3  9e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.468231  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6168  integrase family protein  29.32 
 
 		 411 aa  85.5  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0952  integrase family protein  32.96 
 
 		 412 aa  85.1  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.571908  normal  0.0199815 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2366  integrase family protein  24.47 
 
 		 415 aa  80.1  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4202  integrase family protein  26.24 
 
 		 406 aa  77  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1457  tyrosine recombinase XerD  30.03 
 
 		 292 aa  77  0.0000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0432704  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00445  tyrosine type site-specific recombinase  23.77 
 
 		 405 aa  74.7  0.000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.459489  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.96 
 
 		 296 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.96 
 
 		 296 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.96 
 
 		 296 aa  74.7  0.000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0974  integrase family protein  24.07 
 
 		 430 aa  74.3  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0711773  normal  0.0223597 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.96 
 
 		 296 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.96 
 
 		 296 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.96 
 
 		 296 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.96 
 
 		 296 aa  72.8  0.00000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.57 
 
 		 296 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.57 
 
 		 296 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.57 
 
 		 296 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2850  tyrosine recombinase XerD  29.58 
 
 		 302 aa  70.9  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2471  tyrosine recombinase XerD  29.58 
 
 		 302 aa  70.9  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.1 
 
 		 296 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03935  integrase  24.69 
 
 		 406 aa  68.9  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.439206  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2205  DNA integration/recombination/invertion protein  23.92 
 
 		 369 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00883749  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.27 
 
 		 298 aa  66.6  0.0000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  29.06 
 
 		 295 aa  65.9  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  23.32 
 
 		 282 aa  65.5  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0950  integrase/recombinase XerD  24.82 
 
 		 300 aa  65.1  0.000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3730  integrase family protein  25.56 
 
 		 381 aa  65.1  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000165595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2739  integrase/recombinase XerD  28.71 
 
 		 321 aa  65.1  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2255  tyrosine recombinase XerD  28.22 
 
 		 305 aa  64.3  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000204462  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4345  phage integrase family protein  24.21 
 
 		 435 aa  63.9  0.000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  26.43 
 
 		 290 aa  63.5  0.000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  28.4 
 
 		 307 aa  63.5  0.000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  29.32 
 
 		 309 aa  63.5  0.000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  24.5 
 
 		 302 aa  63.5  0.000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2276  tyrosine recombinase XerD  28.37 
 
 		 301 aa  63.2  0.000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.235275  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3643  tyrosine recombinase XerD  25.53 
 
 		 309 aa  63.2  0.000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3524  tyrosine recombinase XerD  25.53 
 
 		 309 aa  62.8  0.000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0435  integrase family protein  44.62 
 
 		 299 aa  62.8  0.000000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  27.09 
 
 		 300 aa  62.8  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0762  phage integrase family protein  27.98 
 
 		 287 aa  62.4  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1073  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.98 
 
 		 298 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.344511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1971  tyrosine recombinase XerD subunit  26.09 
 
 		 309 aa  62.4  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000860406  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2959  phage integrase family protein  29.48 
 
 		 283 aa  62.4  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.164424 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03409  tyrosine recombinase  28.32 
 
 		 308 aa  62.8  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3228  tyrosine recombinase XerD  24.82 
 
 		 300 aa  62.8  0.00000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.302685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  28.4 
 
 		 307 aa  62.4  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1953  integrase family protein  27.8 
 
 		 405 aa  62.8  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.247559  normal  0.500213 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0843  tyrosine recombinase XerD  25.53 
 
 		 309 aa  62  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0626  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.92 
 
 		 315 aa  61.6  0.00000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1787  phage integrase family protein  29.48 
 
 		 283 aa  62  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2695  tyrosine recombinase XerC  26.92 
 
 		 342 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.400065  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3514  phage integrase family protein  26.82 
 
 		 336 aa  62  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.123025  normal  0.0375273 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3449  tyrosine recombinase XerD  25.53 
 
 		 300 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3331  tyrosine recombinase XerD  24.82 
 
 		 300 aa  61.6  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4253  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.51 
 
 		 298 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0279  phage integrase family protein  27.01 
 
 		 282 aa  61.2  0.00000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.033075  hitchhiker  0.000013626 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1468  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.51 
 
 		 298 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.208903 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1381  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.05 
 
 		 298 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00360913  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2881  tyrosine recombinase XerC  26.5 
 
 		 343 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312354  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2069  phage integrase  26.87 
 
 		 359 aa  60.8  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  hitchhiker  0.000737798 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0795  tyrosine recombinase XerD  24.82 
 
 		 300 aa  61.2  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2788  tyrosine recombinase XerC  26.5 
 
 		 343 aa  60.8  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0114244  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  28.4 
 
 		 307 aa  60.8  0.00000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0548  hypothetical protein  24.33 
 
 		 334 aa  60.5  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.271041 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1025  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.4 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.899371  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3204  integron integrase  44.78 
 
 		 322 aa  60.5  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6303  integrase family protein  24.92 
 
 		 416 aa  60.1  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.66477  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1462  Tn5520-like integrase (transfer factor)  25.08 
 
 		 402 aa  60.1  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.174557  normal  0.0965208 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1456  integrase family protein  24.92 
 
 		 337 aa  60.1  0.00000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.699839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03170  site-specific recombinase XerD  29.86 
 
 		 307 aa  60.1  0.00000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000220198 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0805  tyrosine recombinase XerD  26.43 
 
 		 300 aa  59.7  0.00000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0748  tyrosine recombinase XerD  28.72 
 
 		 303 aa  59.7  0.00000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.50433  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3396  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.76 
 
 		 298 aa  59.7  0.00000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0092  integrase family protein  29.45 
 
 		 270 aa  59.7  0.00000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.554655  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48880  putative bacteriophage integrase  28.34 
 
 		 338 aa  59.7  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000942528  hitchhiker  0.000000101575 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  32.94 
 
 		 295 aa  59.7  0.00000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0890  tyrosine recombinase XerD  30.12 
 
 		 300 aa  58.9  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.267893  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0770  tyrosine recombinase XerD  27.86 
 
 		 303 aa  58.9  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0646575 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0772  phage integrase  45.21 
 
 		 304 aa  59.3  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  23.6 
 
 		 302 aa  58.9  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0918  integrase  24.67 
 
 		 307 aa  59.3  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0200604 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4151  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.44 
 
 		 298 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.596099 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>