104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1953 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_1953  integrase family protein  100 
 
 		 405 aa  834    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.247559  normal  0.500213 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6168  integrase family protein  29.51 
 
 		 411 aa  181  2e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1729  hypothetical protein  26.68 
 
 		 404 aa  153  5e-36  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000763037 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00445  tyrosine type site-specific recombinase  26.29 
 
 		 405 aa  146  6e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.459489  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1462  Tn5520-like integrase (transfer factor)  28.99 
 
 		 402 aa  140  3e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.174557  normal  0.0965208 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03935  integrase  26.62 
 
 		 406 aa  114  3e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.439206  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3099  integrase family protein  25.73 
 
 		 441 aa  103  6e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.979662 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5173  integrase family protein  24.7 
 
 		 411 aa  101  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.54702 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0952  integrase family protein  22.46 
 
 		 412 aa  73.2  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.571908  normal  0.0199815 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11843  putative transposase  23.28 
 
 		 416 aa  72.8  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.383494  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1600  phage integrase family protein  27.99 
 
 		 404 aa  70.9  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5219  integrase family protein  21.43 
 
 		 406 aa  70.1  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.759008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2366  integrase family protein  21.5 
 
 		 415 aa  65.1  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4262  integrase family protein  27.8 
 
 		 379 aa  62.8  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2090  integrase family protein  23.54 
 
 		 392 aa  62.8  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.30003  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6957  integrase family protein  27.35 
 
 		 292 aa  62  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3248  integrase family protein  23.06 
 
 		 437 aa  62  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1173  phage integrase family site specific recombinase  24.81 
 
 		 354 aa  60.8  0.00000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4000  phage integrase family protein  28.95 
 
 		 389 aa  60.8  0.00000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2705  phage integrase family protein  27 
 
 		 386 aa  60.1  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248695  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  26.51 
 
 		 282 aa  60.1  0.00000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6605  integrase family protein  26.34 
 
 		 292 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7462  integrase family protein  26.34 
 
 		 292 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7619  integrase family protein  26.34 
 
 		 292 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.192826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5531  integrase family protein  25.2 
 
 		 461 aa  59.3  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000725821  normal  0.462507 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1768  hypothetical protein  21.95 
 
 		 433 aa  59.7  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00932927 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4345  phage integrase family protein  22.33 
 
 		 435 aa  57.8  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2124  phage integrase family protein  25.95 
 
 		 301 aa  57  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.308322  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0858  phage integrase  25.87 
 
 		 289 aa  56.2  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3109  phage integrase family protein  27.44 
 
 		 290 aa  55.8  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0819  integrase  21.16 
 
 		 409 aa  54.7  0.000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1454  integrase  21.16 
 
 		 409 aa  54.7  0.000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  26.97 
 
 		 295 aa  53.9  0.000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  24.75 
 
 		 290 aa  54.3  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4202  integrase family protein  21.91 
 
 		 406 aa  54.3  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3366  integron integrase  23.35 
 
 		 332 aa  53.9  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.341619 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2714  integron integrase  23.35 
 
 		 332 aa  53.9  0.000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0381  tyrosine recombinase XerD  26.34 
 
 		 303 aa  53.5  0.000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3291  integrase family protein  24.39 
 
 		 450 aa  53.9  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.671392  normal  0.608056 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0466  Fis family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 362 aa  52.8  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1185  tyrosine recombinase XerD  24.75 
 
 		 315 aa  51.6  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0531401  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0838  integrase  20.76 
 
 		 432 aa  51.2  0.00003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.116388 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3700  integrase family protein  22.14 
 
 		 295 aa  51.2  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5548  integrase family protein  30.87 
 
 		 289 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5336  integrase family protein  22.55 
 
 		 378 aa  51.2  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.850487 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0092  integrase family protein  26.32 
 
 		 270 aa  51.2  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.554655  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  24.45 
 
 		 302 aa  50.1  0.00007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0163  integrase family protein  25.79 
 
 		 342 aa  50.1  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.70922  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1906  integrase family protein  21.57 
 
 		 295 aa  50.1  0.00008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.713326  normal  0.217947 
 
 
-
 
NC_002950  PG1732  integrase/recombinase XerD  21.91 
 
 		 308 aa  48.9  0.0001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4806  phage integrase  26.34 
 
 		 291 aa  49.7  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.92941  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2809  phage integrase family protein  23.4 
 
 		 311 aa  49.3  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3470  phage integrase family protein  29.25 
 
 		 302 aa  49.3  0.0001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.229271  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2953  phage integrase family site specific recombinase  26.67 
 
 		 186 aa  48.5  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.603832  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3592  phage integrase family protein  19.95 
 
 		 419 aa  48.5  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04122  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.37 
 
 		 305 aa  48.9  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1023  tyrosine recombinase XerC subunit  24.75 
 
 		 307 aa  48.1  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.554982  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1787  phage integrase family protein  28.88 
 
 		 283 aa  48.1  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2959  phage integrase family protein  28.88 
 
 		 283 aa  47.8  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.164424 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2348  phage integrase family protein  26.85 
 
 		 301 aa  47.8  0.0004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1196  phage integrase  26.84 
 
 		 291 aa  47.4  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  27.97 
 
 		 302 aa  47  0.0005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4851  integrase family protein  23.64 
 
 		 294 aa  47.4  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  24 
 
 		 302 aa  47  0.0006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2702  site-specific recombinase  27.27 
 
 		 299 aa  47  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.54 
 
 		 299 aa  46.6  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.07 
 
 		 298 aa  46.6  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4502  integrase family protein  25.27 
 
 		 290 aa  46.6  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2499  phage integrase family protein  26.84 
 
 		 381 aa  45.8  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.005662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3433  phage integrase family protein  22.37 
 
 		 345 aa  45.8  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0574  integrase family protein  24.54 
 
 		 295 aa  45.8  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2703  integron integrase  26.45 
 
 		 323 aa  45.8  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1297  phage integrase family protein  24.55 
 
 		 295 aa  45.1  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5342  integrase/recombinase  24.17 
 
 		 337 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3102  integrase family protein  23.96 
 
 		 301 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000184896  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0063  integrase family protein  21.01 
 
 		 409 aa  45.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1435  integrase  21.88 
 
 		 408 aa  44.7  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.102507 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  26.37 
 
 		 295 aa  44.3  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2803  integron integrase  23 
 
 		 449 aa  44.7  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000270824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0271  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.33 
 
 		 351 aa  44.7  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28022  normal  0.462537 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0257  integron integrase  24.92 
 
 		 338 aa  45.1  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0364142  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2069  phage integrase family protein  25.27 
 
 		 419 aa  44.7  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0530977  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1179  phage integrase family protein  26.22 
 
 		 398 aa  44.7  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0294292  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2869  integron integrase  26.09 
 
 		 452 aa  45.1  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000684574  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2616  integron integrase  28.33 
 
 		 468 aa  44.3  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3629  integrase family protein  24.85 
 
 		 290 aa  44.3  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3661  integrase family protein  24.85 
 
 		 290 aa  44.3  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.311976  decreased coverage  0.00000149049 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0145  integrase family protein  19.95 
 
 		 411 aa  44.3  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.468231  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1457  integrase family protein  22.78 
 
 		 326 aa  43.9  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3561  Phage integrase  23.6 
 
 		 275 aa  43.5  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1633  Phage integrase  21.19 
 
 		 368 aa  43.5  0.007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.576304  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2783  phage integrase family protein  23.67 
 
 		 367 aa  43.5  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00148084  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2633  phage integrase family protein  21.72 
 
 		 419 aa  43.5  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1821  integrase family protein  39.39 
 
 		 307 aa  43.5  0.007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0364742  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  23.56 
 
 		 302 aa  43.5  0.007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0144  tyrosine recombinase XerD  29.14 
 
 		 305 aa  43.1  0.008  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  23.56 
 
 		 302 aa  43.1  0.009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.18 
 
 		 299 aa  43.1  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  23.18 
 
 		 299 aa  43.1  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1823  integrase family protein  22.75 
 
 		 253 aa  43.1  0.009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.987007  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>