More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_11843 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_11843  putative transposase  100 
 
 		 416 aa  852    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.383494  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0952  integrase family protein  39.37 
 
 		 412 aa  306  6e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.571908  normal  0.0199815 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5219  integrase family protein  38.73 
 
 		 406 aa  303  4.0000000000000003e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.759008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4202  integrase family protein  40.1 
 
 		 406 aa  299  6e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2366  integrase family protein  36.3 
 
 		 415 aa  276  4e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4345  phage integrase family protein  34.56 
 
 		 435 aa  226  9e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0145  integrase family protein  30.94 
 
 		 411 aa  218  2e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.468231  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3248  integrase family protein  31.1 
 
 		 437 aa  202  6e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1435  integrase  34.51 
 
 		 408 aa  188  1e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.102507 
 
 
-
 
NC_002950  PG1113  integrase  29.1 
 
 		 407 aa  187  2e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0539  integrase family protein  29.93 
 
 		 436 aa  176  6e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.19804 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0974  integrase family protein  29.67 
 
 		 430 aa  175  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0711773  normal  0.0223597 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0890  integrase family protein  29.7 
 
 		 436 aa  170  3e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.304857  normal  0.483711 
 
 
-
 
NC_002950  PG0819  integrase  29.27 
 
 		 409 aa  169  6e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1454  integrase  29.27 
 
 		 409 aa  169  6e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0820  integrase  23.8 
 
 		 400 aa  115  1.0000000000000001e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1453  integrase  23.8 
 
 		 400 aa  115  1.0000000000000001e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00445  tyrosine type site-specific recombinase  24.39 
 
 		 405 aa  114  3e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.459489  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5336  integrase family protein  30.16 
 
 		 378 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.850487 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2069  phage integrase family protein  31.17 
 
 		 419 aa  102  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0530977  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3281  integrase family protein  28.93 
 
 		 372 aa  100  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.739809 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4262  integrase family protein  29.34 
 
 		 379 aa  99.8  9e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4000  phage integrase family protein  25.85 
 
 		 389 aa  95.9  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0211  integrase family protein  26.57 
 
 		 384 aa  94  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000967186 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1600  phage integrase family protein  25.47 
 
 		 404 aa  90.5  5e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1729  hypothetical protein  26.03 
 
 		 404 aa  88.2  3e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000763037 
 
 
-
 
NC_002950  PG0838  integrase  21.8 
 
 		 432 aa  85.1  0.000000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.116388 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3592  phage integrase family protein  33.14 
 
 		 419 aa  79  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2633  phage integrase family protein  32.37 
 
 		 419 aa  78.2  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2705  phage integrase family protein  26.02 
 
 		 386 aa  77.4  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248695  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1462  Tn5520-like integrase (transfer factor)  25.48 
 
 		 402 aa  76.6  0.0000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.174557  normal  0.0965208 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2090  integrase family protein  22.77 
 
 		 392 aa  74.7  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.30003  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5173  integrase family protein  23.8 
 
 		 411 aa  74.7  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.54702 
 
 
-
 
NC_002950  PG0874  mobilizable transposon, int protein  26.6 
 
 		 367 aa  73.9  0.000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0746163 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1173  phage integrase family site specific recombinase  32.07 
 
 		 354 aa  73.9  0.000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1953  integrase family protein  23.28 
 
 		 405 aa  72.8  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.247559  normal  0.500213 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6168  integrase family protein  23.99 
 
 		 411 aa  68.9  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03935  integrase  22.61 
 
 		 406 aa  65.1  0.000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.439206  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0063  integrase family protein  22.56 
 
 		 409 aa  65.5  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2810  integrase  27.98 
 
 		 336 aa  64.7  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5531  integrase family protein  22.67 
 
 		 461 aa  63.9  0.000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000725821  normal  0.462507 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  28.46 
 
 		 284 aa  62.8  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3762  phage integrase  26.64 
 
 		 379 aa  62.4  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.288729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  43.42 
 
 		 302 aa  62.8  0.00000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1934  phage integrase family protein  24.64 
 
 		 297 aa  62  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.14 
 
 		 296 aa  61.2  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  30.2 
 
 		 295 aa  60.8  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  35.35 
 
 		 295 aa  60.8  0.00000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.23 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.23 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.23 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.23 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.23 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.23 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.23 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.23 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3715  integrase family protein  30.64 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.23 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1634  integrase family protein  36.11 
 
 		 354 aa  59.7  0.00000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.280587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.23 
 
 		 296 aa  59.3  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0678  tyrosine recombinase XerD  29.68 
 
 		 294 aa  59.7  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0265142 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1347  tyrosine recombinase XerD  27.35 
 
 		 306 aa  58.9  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.816733  normal  0.74121 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1556  integrase family protein  27.8 
 
 		 307 aa  58.5  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.36987  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2567  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.08 
 
 		 313 aa  58.5  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.615759 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  43.66 
 
 		 298 aa  58.5  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2501  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.02 
 
 		 312 aa  58.5  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.504706  normal  0.936606 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1023  tyrosine recombinase XerC subunit  29.36 
 
 		 307 aa  58.2  0.0000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.554982  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1768  hypothetical protein  23.83 
 
 		 433 aa  58.2  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00932927 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  24.51 
 
 		 282 aa  57.8  0.0000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  45.9 
 
 		 295 aa  57  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0144  tyrosine recombinase XerD  40.54 
 
 		 305 aa  57  0.0000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0918  integrase  24 
 
 		 307 aa  57.4  0.0000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0200604 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3407  integrase family protein  29.07 
 
 		 325 aa  57  0.0000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.155435 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1473  tyrosine recombinase XerD  50 
 
 		 296 aa  57  0.0000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202075  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  46.15 
 
 		 299 aa  57  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2172  tyrosine recombinase XerD  37.35 
 
 		 309 aa  56.6  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0616277  normal  0.178894 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2359  integrase family protein  26.39 
 
 		 398 aa  56.2  0.0000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.522134  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1148  phage integrase family site specific recombinase  40.74 
 
 		 328 aa  55.8  0.000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0281308  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1823  integrase family protein  36.36 
 
 		 253 aa  55.8  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.987007  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0393  tyrosine recombinase XerD  32.26 
 
 		 319 aa  56.2  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.543195  normal  0.555297 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0015  Phage integrase  32.43 
 
 		 310 aa  55.8  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.230922  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7575  tyrosine recombinase XerD subunit  42.86 
 
 		 308 aa  56.2  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.440547  normal  0.271837 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0039  tyrosine recombinase XerD  36.19 
 
 		 312 aa  56.2  0.000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2348  phage integrase family protein  46.27 
 
 		 301 aa  55.8  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  46.88 
 
 		 290 aa  55.8  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  38.16 
 
 		 295 aa  55.5  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0687  Phage integrase  31.53 
 
 		 310 aa  55.5  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.004827  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0534  site-specific recombinase IntIA  26.05 
 
 		 327 aa  55.1  0.000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  29.34 
 
 		 332 aa  55.5  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  44.44 
 
 		 295 aa  55.1  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2544  tyrosine recombinase XerC  26.43 
 
 		 318 aa  55.1  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.774585  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  38.16 
 
 		 295 aa  55.5  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3012  tyrosine recombinase XerD subunit  26.01 
 
 		 295 aa  55.5  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146868  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0488  tyrosine recombinase XerD  42.86 
 
 		 319 aa  55.5  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0507  tyrosine recombinase XerD  31.71 
 
 		 339 aa  54.7  0.000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0159  integrase family protein  25 
 
 		 295 aa  54.7  0.000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0602  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.53 
 
 		 324 aa  54.3  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926796 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2692  tyrosine recombinase XerD  35.16 
 
 		 295 aa  54.3  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.457784  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0530  tyrosine recombinase XerD  38.55 
 
 		 320 aa  54.7  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.931339  normal  0.0955198 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2440  tyrosine recombinase XerD  32.28 
 
 		 332 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.691328  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>