37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1435 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG1435  integrase  100 
 
 		 408 aa  842    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.102507 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2366  integrase family protein  34.66 
 
 		 415 aa  218  2e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5219  integrase family protein  34.28 
 
 		 406 aa  209  6e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.759008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0145  integrase family protein  34.28 
 
 		 411 aa  203  4e-51  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.468231  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4202  integrase family protein  34.66 
 
 		 406 aa  202  8e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1113  integrase  29.97 
 
 		 407 aa  190  2.9999999999999997e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11843  putative transposase  34.51 
 
 		 416 aa  188  1e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.383494  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0952  integrase family protein  32.39 
 
 		 412 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.571908  normal  0.0199815 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4345  phage integrase family protein  35.31 
 
 		 435 aa  181  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0974  integrase family protein  30.19 
 
 		 430 aa  155  9e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0711773  normal  0.0223597 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0539  integrase family protein  30.97 
 
 		 436 aa  155  9e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.19804 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0890  integrase family protein  30.18 
 
 		 436 aa  150  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.304857  normal  0.483711 
 
 
-
 
NC_002950  PG1454  integrase  26.21 
 
 		 409 aa  144  3e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0819  integrase  26.21 
 
 		 409 aa  144  3e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0838  integrase  29.74 
 
 		 432 aa  118  1.9999999999999998e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.116388 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3248  integrase family protein  25.15 
 
 		 437 aa  97.4  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0820  integrase  23.38 
 
 		 400 aa  93.2  7e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1453  integrase  23.38 
 
 		 400 aa  93.2  7e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2090  integrase family protein  24.18 
 
 		 392 aa  71.6  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.30003  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00445  tyrosine type site-specific recombinase  23.85 
 
 		 405 aa  69.3  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.459489  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0063  integrase family protein  24.25 
 
 		 409 aa  67.4  0.0000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1600  phage integrase family protein  25 
 
 		 404 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2069  phage integrase family protein  25.85 
 
 		 419 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0530977  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1462  Tn5520-like integrase (transfer factor)  24.53 
 
 		 402 aa  58.5  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.174557  normal  0.0965208 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5872  integrase family protein  24.85 
 
 		 433 aa  56.2  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1173  phage integrase family site specific recombinase  26.6 
 
 		 354 aa  54.7  0.000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1013  integrase domain protein SAM domain protein  23.22 
 
 		 404 aa  52.4  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.256622  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0608  phage integrase family protein  27.45 
 
 		 348 aa  51.6  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2705  phage integrase family protein  26.83 
 
 		 386 aa  52  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248695  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5173  integrase family protein  24.01 
 
 		 411 aa  51.2  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.54702 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1729  hypothetical protein  22.07 
 
 		 404 aa  50.8  0.00004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000763037 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03935  integrase  22.7 
 
 		 406 aa  50.8  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.439206  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5336  integrase family protein  26.35 
 
 		 378 aa  48.9  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.850487 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3281  integrase family protein  22.59 
 
 		 372 aa  47.8  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.739809 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6168  integrase family protein  21.64 
 
 		 411 aa  47.8  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1953  integrase family protein  21.88 
 
 		 405 aa  44.7  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.247559  normal  0.500213 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3099  integrase family protein  23.12 
 
 		 441 aa  43.5  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.979662 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>