67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0838 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0838  integrase  100 
 
 		 432 aa  902    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.116388 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5872  integrase family protein  28.57 
 
 		 433 aa  149  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0952  integrase family protein  27.36 
 
 		 412 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.571908  normal  0.0199815 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4345  phage integrase family protein  28.4 
 
 		 435 aa  119  9e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1435  integrase  29.74 
 
 		 408 aa  118  1.9999999999999998e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.102507 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2090  integrase family protein  25.58 
 
 		 392 aa  102  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.30003  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3827  integrase family protein  31.5 
 
 		 354 aa  101  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.730502  normal  0.406581 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2366  integrase family protein  23.66 
 
 		 415 aa  100  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5219  integrase family protein  25.71 
 
 		 406 aa  97.8  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.759008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0063  integrase family protein  26.83 
 
 		 409 aa  91.7  3e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4202  integrase family protein  29.86 
 
 		 406 aa  91.3  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0539  integrase family protein  23.74 
 
 		 436 aa  89.7  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.19804 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1013  integrase domain protein SAM domain protein  28.45 
 
 		 404 aa  87.4  4e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.256622  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0890  integrase family protein  23.98 
 
 		 436 aa  87.4  5e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.304857  normal  0.483711 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11843  putative transposase  21.8 
 
 		 416 aa  85.1  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.383494  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0145  integrase family protein  23.39 
 
 		 411 aa  82.8  0.00000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.468231  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0850  integrase family protein  27.87 
 
 		 429 aa  82.8  0.00000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0974  integrase family protein  22.09 
 
 		 430 aa  77.8  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0711773  normal  0.0223597 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1600  phage integrase family protein  24.78 
 
 		 404 aa  70.1  0.00000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0608  phage integrase family protein  28.8 
 
 		 348 aa  68.9  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0819  integrase  23.83 
 
 		 409 aa  66.6  0.0000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1454  integrase  23.83 
 
 		 409 aa  66.6  0.0000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2069  phage integrase family protein  25.33 
 
 		 419 aa  65.1  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0530977  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00445  tyrosine type site-specific recombinase  24.31 
 
 		 405 aa  62.4  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.459489  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1113  integrase  21.65 
 
 		 407 aa  58.2  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1839  phage integrase family protein  26.96 
 
 		 193 aa  55.8  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.637517  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3281  integrase family protein  24.56 
 
 		 372 aa  55.1  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.739809 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2346  tyrosine recombinase XerC  25.5 
 
 		 302 aa  53.9  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_4000  phage integrase family protein  25.57 
 
 		 389 aa  53.9  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3248  integrase family protein  27.55 
 
 		 437 aa  52.4  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5336  integrase family protein  28.29 
 
 		 378 aa  52.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.850487 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4262  integrase family protein  22.83 
 
 		 379 aa  51.6  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1953  integrase family protein  20.76 
 
 		 405 aa  51.2  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.247559  normal  0.500213 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3599  integrase family protein  25.79 
 
 		 180 aa  50.1  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.616601  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1689  phage integrase family protein  23.88 
 
 		 190 aa  49.7  0.00009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1619  phage integrase family protein  23.27 
 
 		 286 aa  49.3  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4009  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  28.14 
 
 		 180 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0995  phage integrase family protein  24.28 
 
 		 324 aa  49.3  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0268254  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0081  integrase family protein  24.12 
 
 		 189 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1368  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  27.54 
 
 		 180 aa  47.8  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.358053 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0652  DNA integration/recombination/invertion protein  27.37 
 
 		 180 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1185  tyrosine recombinase XerD  33.04 
 
 		 315 aa  48.1  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0531401  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0076  integrase family protein  23.56 
 
 		 189 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  22.15 
 
 		 302 aa  47.8  0.0004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0500  integrase family protein  38.78 
 
 		 188 aa  47.4  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2812  integrase family protein  38.78 
 
 		 188 aa  47  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1173  phage integrase family site specific recombinase  25.14 
 
 		 354 aa  46.6  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1205  integrase/recombinase XerD  24.29 
 
 		 274 aa  46.2  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3590  integrase family protein  25.71 
 
 		 189 aa  46.2  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.0592429  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3453  integrase family protein  25.41 
 
 		 189 aa  46.2  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.590005  normal  0.791222 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0537  tyrosine recombinase XerD subunit  23.86 
 
 		 302 aa  45.8  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  23.92 
 
 		 302 aa  46.2  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0173  tyrosine recombinase XerD  20.99 
 
 		 309 aa  45.1  0.002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.861385  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  21.33 
 
 		 297 aa  45.8  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2497  integrase family protein  22.48 
 
 		 308 aa  45.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03935  integrase  23.38 
 
 		 406 aa  45.1  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.439206  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0924  phage integrase family protein  22.81 
 
 		 294 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.852644  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2136  phage integrase family protein  30.98 
 
 		 389 aa  45.1  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0404563  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2613  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  25.26 
 
 		 180 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.301879  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  23.17 
 
 		 294 aa  45.1  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0144  tyrosine recombinase XerD  22.49 
 
 		 305 aa  44.7  0.004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3701  integrase family protein  22.07 
 
 		 392 aa  43.9  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0163  integrase family protein  21.23 
 
 		 189 aa  43.9  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2711  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  27.49 
 
 		 180 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0042219  normal  0.247582 
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0001  site-specific recombinase  25.45 
 
 		 190 aa  43.1  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1503  phage integrase family protein  22.22 
 
 		 372 aa  43.5  0.008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.279125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1936  integrase family protein  22.74 
 
 		 391 aa  43.1  0.009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.642431  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>