More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_3590 on replicon NC_013412
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013412  GYMC61_3590  integrase family protein  100 
 
 		 189 aa  381  1e-105  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.0592429  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3453  integrase family protein  86.77 
 
 		 189 aa  335  1.9999999999999998e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.590005  normal  0.791222 
 
 
-
 
NC_010724  Nther_2955  integrase family protein  51.58 
 
 		 187 aa  172  1.9999999999999998e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.819146  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1185  phage integrase family protein  47.09 
 
 		 176 aa  160  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00690161  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1370  phage integrase family site specific recombinase  45.93 
 
 		 179 aa  159  3e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1481  phage integrase family site specific recombinase  45.93 
 
 		 176 aa  159  3e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1586  phage integrase family site specific recombinase  46.51 
 
 		 176 aa  157  9e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.645051  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1384  integrase family protein  46.51 
 
 		 176 aa  157  9e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.334457  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1553  site-specific recombinase, phage integrase family  46.51 
 
 		 176 aa  157  9e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000100783 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1622  site-specific recombinase, phage integrase family  46.51 
 
 		 176 aa  157  9e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1516  site-specific recombinase, phage integrase family  46.51 
 
 		 176 aa  157  9e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3829  site-specific recombinase, phage integrase family  46.51 
 
 		 176 aa  157  1e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000329942 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1343  phage integrase family site specific recombinase  46.51 
 
 		 179 aa  157  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.311312  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1342  phage integrase family site specific recombinase  46.51 
 
 		 179 aa  157  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1165  integrase family protein  43.92 
 
 		 187 aa  153  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2711  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  43.72 
 
 		 180 aa  144  6e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0042219  normal  0.247582 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4879  site-specific recombinase, phage integrase family  40.53 
 
 		 188 aa  144  9e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4494  phage integrase family site specific recombinase  40.53 
 
 		 188 aa  143  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0382  site-specific recombinase, phage integrase family  40 
 
 		 188 aa  143  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4855  site-specific recombinase, phage integrase family  40 
 
 		 188 aa  144  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4476  phage integrase family site specific recombinase  40 
 
 		 188 aa  143  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4574  integrase family protein  40.53 
 
 		 188 aa  142  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5345  integrase family protein  44.74 
 
 		 182 aa  142  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4886  phage integrase family site specific recombinase  39.47 
 
 		 188 aa  141  4e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4641  phage integrase family site specific recombinase  40 
 
 		 188 aa  142  4e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4865  site-specific recombinase, phage integrase family  40 
 
 		 188 aa  142  4e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4995  phage integrase family site specific recombinase  40 
 
 		 188 aa  142  4e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4009  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  43.72 
 
 		 180 aa  141  7e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1368  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  43.17 
 
 		 180 aa  141  7e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.358053 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3811  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  44.81 
 
 		 180 aa  140  8e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0141622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0577  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  43.72 
 
 		 180 aa  139  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2230  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  48.63 
 
 		 180 aa  139  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0652  DNA integration/recombination/invertion protein  43.72 
 
 		 180 aa  137  7e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3599  integrase family protein  41.53 
 
 		 180 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.616601  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4392  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  46.45 
 
 		 180 aa  133  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1590  phage integrase family site specific recombinase  39.47 
 
 		 182 aa  132  3e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000133866  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2613  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  40.98 
 
 		 180 aa  131  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.301879  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0174  integrase family protein  40.44 
 
 		 186 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00273109  n/a   
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0001  site-specific recombinase  43.82 
 
 		 190 aa  129  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149945  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1859  prophage LambdaSa2, site-specific recombinase phage integrase family protein  36.32 
 
 		 180 aa  127  1.0000000000000001e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00377207  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0017  prophage integration/recombination/invertion protein  43.41 
 
 		 190 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000444728  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4099  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  43.86 
 
 		 169 aa  125  5e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0815  integrase family protein  41.67 
 
 		 183 aa  124  7e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3451  integrase family protein  41.08 
 
 		 186 aa  123  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0127606  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2286  phage integrase  41.71 
 
 		 188 aa  123  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000274502  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1007  site-specific recombinase  40 
 
 		 183 aa  122  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.22552e-63 
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0009  integrase/recombinase  43.41 
 
 		 190 aa  121  7e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0164  DNA integration/recombination/inversion protein  43.41 
 
 		 190 aa  120  9e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0167632  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0412  integrase  42.86 
 
 		 190 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0192917  n/a   
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3470  integrase family protein  39.44 
 
 		 182 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2240  integrase family protein  37.91 
 
 		 197 aa  112  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000448435  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2232  integrase family protein  37.91 
 
 		 197 aa  112  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.394376  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1771  phage integrase family protein  36.82 
 
 		 204 aa  102  4e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.753085 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1799  phage integrase family protein  37.19 
 
 		 204 aa  102  4e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.968459  normal  0.396821 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1448  phage integrase family site specific recombinase  37.63 
 
 		 188 aa  101  5e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1694  phage integrase family protein  36.68 
 
 		 212 aa  100  9e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.470129  normal  0.0225811 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1254  phage integrase family protein  35.57 
 
 		 186 aa  99  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.709211 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0644  phage integrase family protein  33.51 
 
 		 186 aa  93.6  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0659  phage integrase family protein  33.51 
 
 		 186 aa  93.6  1e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.271524  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3517  phage integrase family protein  33.33 
 
 		 188 aa  91.7  5e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0998  phage integrase family protein  35.71 
 
 		 215 aa  91.7  6e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00570052  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2953  phage integrase family site specific recombinase  34.36 
 
 		 186 aa  90.9  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.603832  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0377  integrase family protein  32.47 
 
 		 186 aa  89.4  3e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000239772 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001839  site-specific recombinase phage integrase family  33 
 
 		 186 aa  88.2  6e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2452  tyrosine recombinase XerD  30.65 
 
 		 306 aa  83.2  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.728507 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1255  integrase family protein  32.49 
 
 		 186 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A08  integrase  30.77 
 
 		 195 aa  80.5  0.00000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000000003137  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1659  tyrosine recombinase XerD  32.93 
 
 		 254 aa  80.1  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3066  integrase family protein  32.2 
 
 		 390 aa  78.6  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0221886  normal  0.652565 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3139  phage integrase family protein  32.94 
 
 		 344 aa  78.2  0.00000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.424721  normal  0.214127 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2489  tyrosine recombinase XerD  31.02 
 
 		 318 aa  77.4  0.0000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189208  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  28.4 
 
 		 295 aa  76.6  0.0000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25380  tyrosine recombinase XerD subunit  32.74 
 
 		 311 aa  76.6  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.732719 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5431  tyrosine recombinase XerD  32.73 
 
 		 299 aa  76.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.060431  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  30.11 
 
 		 309 aa  75.9  0.0000000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2942  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.14 
 
 		 318 aa  75.9  0.0000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5548  integrase family protein  33.95 
 
 		 289 aa  75.5  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2986  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.14 
 
 		 318 aa  75.9  0.0000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1201  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.75 
 
 		 321 aa  75.5  0.0000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731595  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2127  tyrosine recombinase XerD  31.29 
 
 		 308 aa  75.5  0.0000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.518947  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2957  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.14 
 
 		 318 aa  75.1  0.0000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal  0.636956 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1520  tyrosine recombinase XerD  33.33 
 
 		 362 aa  75.1  0.0000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000383292 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0238  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.69 
 
 		 306 aa  74.7  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0625179  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0438  phage integrase, N-terminus  41.76 
 
 		 97 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0989457  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2375  tyrosine recombinase XerD  33.33 
 
 		 324 aa  73.6  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.973456  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1521  tyrosine recombinase XerD  30.35 
 
 		 346 aa  73.9  0.000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.531713  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3281  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.14 
 
 		 317 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2386  integrase family protein  29.55 
 
 		 208 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2994  tyrosine recombinase XerD  31.11 
 
 		 315 aa  73.2  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011760  Mchl_5760  integrase family protein  32.58 
 
 		 291 aa  73.6  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3500  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.54 
 
 		 314 aa  73.6  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.385537  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0119  integrase family protein  28.9 
 
 		 209 aa  72.4  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1489  tyrosine recombinase XerD  32.14 
 
 		 313 aa  72  0.000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.966498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.57 
 
 		 298 aa  72  0.000000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3034  integrase family protein  31.21 
 
 		 206 aa  71.6  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.155662  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3458  tyrosine recombinase XerD  29.88 
 
 		 303 aa  71.2  0.000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0536  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.33 
 
 		 300 aa  70.9  0.000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.538013  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11716  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.94 
 
 		 311 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.162629 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  30.63 
 
 		 294 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  31.48 
 
 		 295 aa  70.5  0.00000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>