More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_0659 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_0659  phage integrase family protein  100 
 
 		 186 aa  379  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.271524  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0644  phage integrase family protein  100 
 
 		 186 aa  379  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4494  phage integrase family site specific recombinase  38.46 
 
 		 188 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4476  phage integrase family site specific recombinase  36.92 
 
 		 188 aa  119  3e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4879  site-specific recombinase, phage integrase family  36.92 
 
 		 188 aa  118  6e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4886  phage integrase family site specific recombinase  36.41 
 
 		 188 aa  117  7e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4641  phage integrase family site specific recombinase  36.92 
 
 		 188 aa  117  7e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4865  site-specific recombinase, phage integrase family  36.92 
 
 		 188 aa  117  7e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4995  phage integrase family site specific recombinase  36.92 
 
 		 188 aa  117  7e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4574  integrase family protein  36.92 
 
 		 188 aa  115  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4855  site-specific recombinase, phage integrase family  35.38 
 
 		 188 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0382  site-specific recombinase, phage integrase family  35.9 
 
 		 188 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1165  integrase family protein  35.9 
 
 		 187 aa  103  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010724  Nther_2955  integrase family protein  36.7 
 
 		 187 aa  103  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.819146  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5345  integrase family protein  33.85 
 
 		 182 aa  101  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3453  integrase family protein  32.11 
 
 		 189 aa  95.9  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.590005  normal  0.791222 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1007  site-specific recombinase  34.66 
 
 		 183 aa  95.5  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.22552e-63 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3590  integrase family protein  33.51 
 
 		 189 aa  93.6  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.0592429  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0815  integrase family protein  35.75 
 
 		 183 aa  92.8  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0652  DNA integration/recombination/invertion protein  31.82 
 
 		 180 aa  91.3  8e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4009  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  31.67 
 
 		 180 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2230  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  30.68 
 
 		 180 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3470  integrase family protein  32.26 
 
 		 182 aa  89.4  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3599  integrase family protein  31.25 
 
 		 180 aa  89  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.616601  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3811  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  29.55 
 
 		 180 aa  88.2  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0141622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4392  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  30.11 
 
 		 180 aa  88.2  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0577  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  30.51 
 
 		 180 aa  87.8  9e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1859  prophage LambdaSa2, site-specific recombinase phage integrase family protein  32.75 
 
 		 180 aa  87.4  1e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00377207  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2711  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  31.67 
 
 		 180 aa  87  1e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0042219  normal  0.247582 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2613  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  30.51 
 
 		 180 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.301879  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1368  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  31.11 
 
 		 180 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.358053 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1370  phage integrase family site specific recombinase  32.9 
 
 		 179 aa  85.9  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1481  phage integrase family site specific recombinase  32.9 
 
 		 176 aa  85.9  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1185  phage integrase family protein  32.68 
 
 		 176 aa  84.7  7e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00690161  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1553  site-specific recombinase, phage integrase family  33.55 
 
 		 176 aa  84.3  9e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000100783 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1516  site-specific recombinase, phage integrase family  33.55 
 
 		 176 aa  84.3  9e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1586  phage integrase family site specific recombinase  33.55 
 
 		 176 aa  84.3  9e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.645051  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1590  phage integrase family site specific recombinase  33.33 
 
 		 182 aa  84.3  9e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000133866  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1622  site-specific recombinase, phage integrase family  33.55 
 
 		 176 aa  84.3  9e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1384  integrase family protein  33.55 
 
 		 176 aa  84.3  9e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.334457  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1343  phage integrase family site specific recombinase  33.55 
 
 		 179 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.311312  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1342  phage integrase family site specific recombinase  33.55 
 
 		 179 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4099  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  29.27 
 
 		 169 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3829  site-specific recombinase, phage integrase family  33.55 
 
 		 176 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000329942 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0174  integrase family protein  30.32 
 
 		 186 aa  81.3  0.000000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00273109  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2286  phage integrase  30.85 
 
 		 188 aa  79.7  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000274502  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0017  prophage integration/recombination/invertion protein  30.94 
 
 		 190 aa  79.3  0.00000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000444728  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0412  integrase  32.62 
 
 		 190 aa  78.6  0.00000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0192917  n/a   
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0009  integrase/recombinase  33.7 
 
 		 190 aa  78.2  0.00000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0001  site-specific recombinase  27.67 
 
 		 190 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0164  DNA integration/recombination/inversion protein  31.49 
 
 		 190 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0167632  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3451  integrase family protein  28.88 
 
 		 186 aa  66.2  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0127606  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1628  phage integrase family protein  30.26 
 
 		 182 aa  66.2  0.0000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.170969  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5819  tyrosine recombinase  31.97 
 
 		 198 aa  62.8  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.97237 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1451  phage integrase family protein  28.29 
 
 		 182 aa  62  0.000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0649583 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1183  phage integrase family protein  28.97 
 
 		 182 aa  62  0.000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.172302  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04182  tyrosine recombinase/inversion of on/off regulator of fimA  32.21 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3684  integrase family protein  32.21 
 
 		 183 aa  61.6  0.000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0312945  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4539  tyrosine recombinase  32.21 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00145575  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4839  tyrosine recombinase  32.21 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04144  hypothetical protein  32.21 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5548  integrase family protein  28.93 
 
 		 289 aa  61.6  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0457  integrase family protein  28.29 
 
 		 182 aa  61.2  0.000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.093942  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1478  integrase/recombinase XerD  31.29 
 
 		 298 aa  58.2  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0755097  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0811  Phage integrase  27.81 
 
 		 208 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1286  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.29 
 
 		 298 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0511461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1255  integrase family protein  28.14 
 
 		 186 aa  57  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  27.43 
 
 		 284 aa  57  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2512  type 1 fimbriae regulatory protein  29.8 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.570306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4151  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.17 
 
 		 298 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.596099 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1073  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.62 
 
 		 298 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.344511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1560  tyrosine recombinase XerD  41.67 
 
 		 331 aa  55.5  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.736869  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0478  integrase family protein  28.1 
 
 		 312 aa  55.1  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1344  integrase family protein  24.7 
 
 		 292 aa  54.7  0.0000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000678444  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2375  tyrosine recombinase XerD  27.22 
 
 		 324 aa  54.3  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.973456  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3396  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.41 
 
 		 298 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1468  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.91 
 
 		 298 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.208903 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1025  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.57 
 
 		 298 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.899371  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4253  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.91 
 
 		 298 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1694  phage integrase family protein  29.15 
 
 		 212 aa  53.1  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.470129  normal  0.0225811 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1619  phage integrase family protein  27.45 
 
 		 286 aa  53.5  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1448  phage integrase family site specific recombinase  29.15 
 
 		 188 aa  52.8  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1201  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.12 
 
 		 321 aa  52.4  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731595  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1839  integrase family protein  30.14 
 
 		 310 aa  52.8  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1771  phage integrase family protein  29.15 
 
 		 204 aa  52.4  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.753085 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2063  tyrosine recombinase XerD  28.67 
 
 		 290 aa  52.4  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09590  tyrosine recombinase XerD  28.48 
 
 		 302 aa  52.4  0.000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0503565 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1799  phage integrase family protein  29.15 
 
 		 204 aa  52  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.968459  normal  0.396821 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0967  integrase family protein  31.43 
 
 		 373 aa  51.6  0.000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2452  tyrosine recombinase XerD  28.32 
 
 		 306 aa  51.6  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.728507 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0879  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.82 
 
 		 299 aa  51.2  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.201006  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3847  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.82 
 
 		 299 aa  51.2  0.000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.349121 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0920  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.82 
 
 		 299 aa  51.2  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0439  phage integrase, C-terminus  37.1 
 
 		 73 aa  50.4  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.264159  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0382  integrase family protein  26.09 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00636105 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1777  tyrosine recombinase XerD  27.97 
 
 		 290 aa  50.8  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0663  tyrosine recombinase XerD  31.91 
 
 		 305 aa  50.8  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16040  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.17 
 
 		 298 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0817  tyrosine recombinase XerD  30.41 
 
 		 305 aa  50.1  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.763193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3892  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.82 
 
 		 299 aa  50.1  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.413643  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>