131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1255 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_1255  integrase family protein  100 
 
 		 186 aa  380  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1254  phage integrase family protein  71.51 
 
 		 186 aa  276  1e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.709211 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0377  integrase family protein  69.35 
 
 		 186 aa  276  1e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000239772 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3517  phage integrase family protein  68.82 
 
 		 188 aa  272  2.0000000000000002e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001839  site-specific recombinase phage integrase family  68.28 
 
 		 186 aa  261  4.999999999999999e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1448  phage integrase family site specific recombinase  67.55 
 
 		 188 aa  255  2e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1694  phage integrase family protein  67.02 
 
 		 212 aa  256  2e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.470129  normal  0.0225811 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1771  phage integrase family protein  67.55 
 
 		 204 aa  256  2e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.753085 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1799  phage integrase family protein  67.02 
 
 		 204 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.968459  normal  0.396821 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2953  phage integrase family site specific recombinase  65.05 
 
 		 186 aa  251  4.0000000000000004e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.603832  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2711  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  36.36 
 
 		 180 aa  105  3e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0042219  normal  0.247582 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3599  integrase family protein  33.16 
 
 		 180 aa  103  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.616601  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1368  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  35.71 
 
 		 180 aa  101  8e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.358053 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2613  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  32.09 
 
 		 180 aa  97.1  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.301879  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0652  DNA integration/recombination/invertion protein  33.16 
 
 		 180 aa  96.7  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0577  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  36.76 
 
 		 180 aa  95.9  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4009  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  33.77 
 
 		 180 aa  95.9  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010724  Nther_2955  integrase family protein  36 
 
 		 187 aa  95.5  4e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.819146  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1859  prophage LambdaSa2, site-specific recombinase phage integrase family protein  33.12 
 
 		 180 aa  94  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00377207  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3811  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  36.91 
 
 		 180 aa  90.5  1e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0141622  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4099  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  36.91 
 
 		 169 aa  90.5  1e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3453  integrase family protein  34.1 
 
 		 189 aa  87.8  8e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.590005  normal  0.791222 
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5345  integrase family protein  33.16 
 
 		 182 aa  86.3  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1590  phage integrase family site specific recombinase  31.11 
 
 		 182 aa  84.3  8e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000133866  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1165  integrase family protein  33.68 
 
 		 187 aa  84.3  8e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0174  integrase family protein  39.13 
 
 		 186 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00273109  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0815  integrase family protein  33.33 
 
 		 183 aa  83.6  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3590  integrase family protein  32.49 
 
 		 189 aa  82.4  0.000000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.0592429  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3451  integrase family protein  36.79 
 
 		 186 aa  81.3  0.000000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0127606  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1007  site-specific recombinase  32.78 
 
 		 183 aa  81.3  0.000000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.22552e-63 
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3470  integrase family protein  28.72 
 
 		 182 aa  77.8  0.00000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2230  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  37.58 
 
 		 180 aa  77.8  0.00000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0017  prophage integration/recombination/invertion protein  32.11 
 
 		 190 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000444728  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4392  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  35.14 
 
 		 180 aa  77.4  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4855  site-specific recombinase, phage integrase family  28.79 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0001  site-specific recombinase  31.58 
 
 		 190 aa  72.4  0.000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149945  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4494  phage integrase family site specific recombinase  30.65 
 
 		 188 aa  70.9  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A08  integrase  29.63 
 
 		 195 aa  70.1  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000000003137  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06813  integrase  28.65 
 
 		 197 aa  70.1  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0382  site-specific recombinase, phage integrase family  28.79 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2232  integrase family protein  31.89 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.394376  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2240  integrase family protein  31.89 
 
 		 197 aa  68.9  0.00000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000448435  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4574  integrase family protein  29.89 
 
 		 188 aa  68.2  0.00000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4641  phage integrase family site specific recombinase  29.57 
 
 		 188 aa  67.8  0.00000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4995  phage integrase family site specific recombinase  29.57 
 
 		 188 aa  67.8  0.00000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4865  site-specific recombinase, phage integrase family  29.57 
 
 		 188 aa  67.8  0.00000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0009  integrase/recombinase  30.48 
 
 		 190 aa  67  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0824  phage integrase family protein  28.18 
 
 		 197 aa  67  0.0000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.917981  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4886  phage integrase family site specific recombinase  30.11 
 
 		 188 aa  66.2  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4476  phage integrase family site specific recombinase  30.11 
 
 		 188 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0412  integrase  27.42 
 
 		 190 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0192917  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3467  integrase family protein  28.18 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4879  site-specific recombinase, phage integrase family  29.03 
 
 		 188 aa  65.9  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2776  phage integrase  32.86 
 
 		 316 aa  65.9  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0149476  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1950  phage integrase family protein  28.72 
 
 		 197 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.827298  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0164  DNA integration/recombination/inversion protein  27.46 
 
 		 190 aa  64.7  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0167632  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0439  phage integrase, C-terminus  48.21 
 
 		 73 aa  64.7  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.264159  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0312  phage integrase  27.05 
 
 		 209 aa  64.3  0.0000000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2286  phage integrase  34.39 
 
 		 188 aa  62.8  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000274502  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0998  phage integrase family protein  31.37 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00570052  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2102  integrase family protein  29.09 
 
 		 193 aa  60.5  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2339  integrase family protein  28.65 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0020288 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2267  phage integrase family protein  27.12 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.783329  normal  0.401703 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0644  phage integrase family protein  28.14 
 
 		 186 aa  57  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0659  phage integrase family protein  28.14 
 
 		 186 aa  57  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.271524  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6236  integrase family protein  31.52 
 
 		 207 aa  56.2  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3817  integrase family protein  27.65 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.736864  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2590  hypothetical protein  28.57 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0020859 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2569  phage integrase family protein  27.78 
 
 		 198 aa  54.3  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0769947 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2062  phage integrase family site specific recombinase  25.82 
 
 		 198 aa  53.1  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.27505  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3118  phage integrase  27.59 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1729  phage integrase family protein  27.5 
 
 		 207 aa  53.1  0.000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.425016  normal  0.48456 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2164  phage integrase family protein  26.55 
 
 		 198 aa  52.8  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0217  phage integrase family protein  26.67 
 
 		 200 aa  52.4  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4474  integrase family protein  26.92 
 
 		 198 aa  52.4  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1123  phage integrase family protein  26.55 
 
 		 198 aa  52  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1181  phage integrase family protein  26.55 
 
 		 198 aa  52  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.820562  normal  0.553114 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3899  phage integrase family protein  26.55 
 
 		 198 aa  52  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.97558 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3446  phage integrase family protein  34.25 
 
 		 163 aa  52  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.993422  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1370  phage integrase family site specific recombinase  29.28 
 
 		 179 aa  51.6  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1481  phage integrase family site specific recombinase  29.28 
 
 		 176 aa  51.6  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0127  hypothetical protein, putative phage gene  35.42 
 
 		 273 aa  51.6  0.000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1586  phage integrase family site specific recombinase  29.83 
 
 		 176 aa  51.2  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.645051  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1343  phage integrase family site specific recombinase  29.83 
 
 		 179 aa  51.2  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.311312  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1342  phage integrase family site specific recombinase  29.83 
 
 		 179 aa  51.2  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1516  site-specific recombinase, phage integrase family  29.83 
 
 		 176 aa  51.2  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1553  site-specific recombinase, phage integrase family  29.83 
 
 		 176 aa  51.2  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000100783 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1622  site-specific recombinase, phage integrase family  29.83 
 
 		 176 aa  51.2  0.000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0251  phage integrase family protein  26.26 
 
 		 198 aa  50.8  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.705292 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1384  integrase family protein  29.83 
 
 		 176 aa  50.8  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.334457  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3829  site-specific recombinase, phage integrase family  29.83 
 
 		 176 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000329942 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4348  integrase  45.45 
 
 		 51 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0257445  hitchhiker  9.10332e-17 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5964  Phage integrase  25.28 
 
 		 208 aa  49.3  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3208  phage integrase family protein  25 
 
 		 204 aa  48.9  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0839313  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1451  phage integrase family protein  26.62 
 
 		 182 aa  48.9  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0649583 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0772  integrase family protein  24.72 
 
 		 209 aa  48.5  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0811  Phage integrase  26.16 
 
 		 208 aa  48.1  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1185  phage integrase family protein  29.45 
 
 		 176 aa  48.1  0.00007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00690161  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04790  integrase  40.85 
 
 		 274 aa  48.1  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2717  hypothetical protein  26.9 
 
 		 169 aa  47.8  0.00009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>