99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BAS0439 on replicon NC_005945
Organism: Bacillus anthracis str. Sterne



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010184  BcerKBAB4_3599  integrase family protein  100 
 
 
180 aa  154  6e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.616601  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1368  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  100 
 
 
180 aa  153  7e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.358053 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0439  phage integrase, C-terminus  100 
 
 
73 aa  151  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.264159  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4009  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  98.63 
 
 
180 aa  150  7e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2711  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  97.26 
 
 
180 aa  147  4e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0042219  normal  0.247582 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2613  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  91.78 
 
 
180 aa  142  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.301879  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0652  DNA integration/recombination/invertion protein  93.15 
 
 
180 aa  143  1e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2230  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  57.53 
 
 
180 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0577  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  56.16 
 
 
180 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3811  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  56.16 
 
 
180 aa  92.4  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0141622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4392  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  56.16 
 
 
180 aa  92  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4099  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  56.16 
 
 
169 aa  92.4  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1859  prophage LambdaSa2, site-specific recombinase phage integrase family protein  52.78 
 
 
180 aa  84.3  5e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00377207  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0017  prophage integration/recombination/invertion protein  50 
 
 
190 aa  83.6  8e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000444728  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1590  phage integrase family site specific recombinase  52.78 
 
 
182 aa  81.3  0.000000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000133866  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5345  integrase family protein  53.85 
 
 
182 aa  80.5  0.000000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2286  phage integrase  54.55 
 
 
188 aa  80.1  0.000000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000274502  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3451  integrase family protein  56.06 
 
 
186 aa  79.7  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0127606  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0174  integrase family protein  53.03 
 
 
186 aa  79  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00273109  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0412  integrase  47.22 
 
 
190 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0192917  n/a   
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0009  integrase/recombinase  48.61 
 
 
190 aa  79  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1007  site-specific recombinase  58.62 
 
 
183 aa  78.2  0.00000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.22552e-63 
 
 
-
 
NC_010724  Nther_2955  integrase family protein  52.31 
 
 
187 aa  77.4  0.00000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.819146  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0164  DNA integration/recombination/inversion protein  45.83 
 
 
190 aa  77  0.00000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0167632  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0815  integrase family protein  58.62 
 
 
183 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3453  integrase family protein  45.21 
 
 
189 aa  71.2  0.000000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.590005  normal  0.791222 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3590  integrase family protein  50 
 
 
189 aa  70.1  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.0592429  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3517  phage integrase family protein  50 
 
 
188 aa  67  0.00000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0377  integrase family protein  50 
 
 
186 aa  67  0.00000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000239772 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001839  site-specific recombinase phage integrase family  57.14 
 
 
186 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1771  phage integrase family protein  48.21 
 
 
204 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.753085 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1448  phage integrase family site specific recombinase  48.21 
 
 
188 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1799  phage integrase family protein  48.21 
 
 
204 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.968459  normal  0.396821 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1254  phage integrase family protein  48.21 
 
 
186 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.709211 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1255  integrase family protein  48.21 
 
 
186 aa  64.7  0.0000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1694  phage integrase family protein  46.43 
 
 
212 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.470129  normal  0.0225811 
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0001  site-specific recombinase  41.33 
 
 
190 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149945  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1165  integrase family protein  45.07 
 
 
187 aa  63.9  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2953  phage integrase family site specific recombinase  46.43 
 
 
186 aa  63.2  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.603832  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1370  phage integrase family site specific recombinase  48.28 
 
 
179 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1481  phage integrase family site specific recombinase  48.28 
 
 
176 aa  62.8  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1622  site-specific recombinase, phage integrase family  50 
 
 
176 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1553  site-specific recombinase, phage integrase family  50 
 
 
176 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000100783 
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3470  integrase family protein  42.42 
 
 
182 aa  61.6  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1384  integrase family protein  50 
 
 
176 aa  62  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.334457  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1586  phage integrase family site specific recombinase  50 
 
 
176 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.645051  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1516  site-specific recombinase, phage integrase family  50 
 
 
176 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1342  phage integrase family site specific recombinase  50 
 
 
179 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1185  phage integrase family protein  50 
 
 
176 aa  62  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00690161  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1343  phage integrase family site specific recombinase  50 
 
 
179 aa  62  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.311312  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0998  phage integrase family protein  42.86 
 
 
215 aa  61.2  0.000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00570052  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3829  site-specific recombinase, phage integrase family  50 
 
 
176 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000329942 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A08  integrase  46.67 
 
 
195 aa  60.8  0.000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000000003137  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4348  integrase  47.06 
 
 
51 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0257445  hitchhiker  9.10332e-17 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0127  hypothetical protein, putative phage gene  41.18 
 
 
273 aa  59.3  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4494  phage integrase family site specific recombinase  41.94 
 
 
188 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4574  integrase family protein  40.32 
 
 
188 aa  55.1  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4879  site-specific recombinase, phage integrase family  40.32 
 
 
188 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4476  phage integrase family site specific recombinase  40.32 
 
 
188 aa  54.7  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4995  phage integrase family site specific recombinase  40.32 
 
 
188 aa  55.1  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4641  phage integrase family site specific recombinase  40.32 
 
 
188 aa  55.1  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4865  site-specific recombinase, phage integrase family  40.32 
 
 
188 aa  55.1  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4886  phage integrase family site specific recombinase  40.32 
 
 
188 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0382  site-specific recombinase, phage integrase family  40.32 
 
 
188 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4855  site-specific recombinase, phage integrase family  40.32 
 
 
188 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0659  phage integrase family protein  37.1 
 
 
186 aa  50.4  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.271524  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0644  phage integrase family protein  37.1 
 
 
186 aa  50.4  0.000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6236  integrase family protein  35.82 
 
 
207 aa  48.5  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2169  integrase  34.55 
 
 
117 aa  46.2  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04790  integrase  34.29 
 
 
274 aa  45.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1729  phage integrase family protein  37.7 
 
 
207 aa  45.8  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.425016  normal  0.48456 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0251  phage integrase family protein  39.68 
 
 
198 aa  44.3  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.705292 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1646  integrase family protein  35.09 
 
 
330 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0378  integrase family protein  36.84 
 
 
190 aa  43.9  0.0008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2386  integrase family protein  34.43 
 
 
208 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2110  phage integrase family protein  37.25 
 
 
335 aa  43.1  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.717737  hitchhiker  0.00928356 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2232  integrase family protein  50 
 
 
197 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.394376  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2622  integrase family protein  38 
 
 
335 aa  43.5  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.647869  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2240  integrase family protein  50 
 
 
197 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000448435  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4231  integrase/recombinase  29.41 
 
 
322 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000145909  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1560  tyrosine recombinase XerD  28.57 
 
 
331 aa  42.4  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.736869  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0811  Phage integrase  37.04 
 
 
208 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2307  integrase family protein  40 
 
 
335 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.109793  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3034  integrase family protein  32.79 
 
 
206 aa  42  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.155662  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2062  phage integrase family site specific recombinase  34.92 
 
 
198 aa  41.2  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.27505  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1978  phage integrase family protein  32.84 
 
 
238 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00595062 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06813  integrase  35.94 
 
 
197 aa  40.8  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3791  phage integrase family site specific recombinase  36.54 
 
 
208 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0452484 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1344  integrase family protein  30.65 
 
 
292 aa  40.8  0.006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000678444  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_48880  putative bacteriophage integrase  38.78 
 
 
338 aa  40.8  0.007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000942528  hitchhiker  0.000000101575 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5964  Phage integrase  32.84 
 
 
208 aa  40.4  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2717  hypothetical protein  30.36 
 
 
169 aa  40.8  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4696  integrase family protein  34.48 
 
 
306 aa  40.8  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2339  integrase family protein  31.15 
 
 
210 aa  40.4  0.008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0020288 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0824  phage integrase family protein  34.38 
 
 
197 aa  40.4  0.009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.917981  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3467  integrase family protein  34.38 
 
 
197 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2649  integrase family protein  45.95 
 
 
333 aa  40  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.413706  hitchhiker  0.000000656425 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3066  phage integrase  35.29 
 
 
341 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2882  phage integrase  35.29 
 
 
341 aa  40  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.948794  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>