103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VSAL_II0127 on replicon NC_011313
Organism: Aliivibrio salmonicida LFI1238



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011313  VSAL_II0127  hypothetical protein, putative phage gene  100 
 
 		 273 aa  559  1e-158  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04790  integrase  48.31 
 
 		 274 aa  249  3e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1533  hypothetical protein  66.25 
 
 		 104 aa  118  9.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.65333  n/a   
 
 
-
 
NC_010724  Nther_2955  integrase family protein  30.83 
 
 		 187 aa  62  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.819146  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2711  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  48.28 
 
 		 180 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0042219  normal  0.247582 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3599  integrase family protein  43.75 
 
 		 180 aa  60.1  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.616601  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4009  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  39.47 
 
 		 180 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1368  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  41.18 
 
 		 180 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.358053 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0439  phage integrase, C-terminus  41.18 
 
 		 73 aa  59.3  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.264159  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3590  integrase family protein  30.95 
 
 		 189 aa  57.8  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.0592429  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0652  DNA integration/recombination/invertion protein  44.64 
 
 		 180 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2613  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  44.64 
 
 		 180 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.301879  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1165  integrase family protein  27.97 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3453  integrase family protein  30 
 
 		 189 aa  55.8  0.0000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.590005  normal  0.791222 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1448  phage integrase family site specific recombinase  35.35 
 
 		 188 aa  54.7  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1370  phage integrase family site specific recombinase  32.26 
 
 		 179 aa  54.7  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1481  phage integrase family site specific recombinase  32.26 
 
 		 176 aa  54.7  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1771  phage integrase family protein  35.35 
 
 		 204 aa  54.3  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.753085 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1799  phage integrase family protein  35.35 
 
 		 204 aa  54.3  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.968459  normal  0.396821 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1586  phage integrase family site specific recombinase  32.26 
 
 		 176 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.645051  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1343  phage integrase family site specific recombinase  32.26 
 
 		 179 aa  53.5  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.311312  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1342  phage integrase family site specific recombinase  32.26 
 
 		 179 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1694  phage integrase family protein  34.34 
 
 		 212 aa  53.1  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.470129  normal  0.0225811 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1384  integrase family protein  32.26 
 
 		 176 aa  53.5  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.334457  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1622  site-specific recombinase, phage integrase family  32.26 
 
 		 176 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1516  site-specific recombinase, phage integrase family  32.26 
 
 		 176 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1553  site-specific recombinase, phage integrase family  32.26 
 
 		 176 aa  53.5  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000100783 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3829  site-specific recombinase, phage integrase family  32.26 
 
 		 176 aa  52.4  0.000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000329942 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1255  integrase family protein  35.42 
 
 		 186 aa  51.6  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1254  phage integrase family protein  31.43 
 
 		 186 aa  50.1  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.709211 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001839  site-specific recombinase phage integrase family  36.49 
 
 		 186 aa  50.1  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1185  phage integrase family protein  30.11 
 
 		 176 aa  50.1  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00690161  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2230  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  30.59 
 
 		 180 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2452  tyrosine recombinase XerD  38.46 
 
 		 306 aa  48.9  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.728507 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2953  phage integrase family site specific recombinase  31.91 
 
 		 186 aa  48.5  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.603832  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1859  prophage LambdaSa2, site-specific recombinase phage integrase family protein  29.13 
 
 		 180 aa  47.4  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00377207  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A08  integrase  35.44 
 
 		 195 aa  47  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000000003137  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2954  integrase family protein  30.3 
 
 		 409 aa  47.4  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4855  site-specific recombinase, phage integrase family  36.99 
 
 		 188 aa  47  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0382  site-specific recombinase, phage integrase family  36.99 
 
 		 188 aa  47  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0577  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  27.27 
 
 		 180 aa  47.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0174  integrase family protein  39.58 
 
 		 186 aa  47.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00273109  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4886  phage integrase family site specific recombinase  32.61 
 
 		 188 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0017  prophage integration/recombination/invertion protein  40.82 
 
 		 190 aa  47  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000444728  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3451  integrase family protein  39.58 
 
 		 186 aa  46.6  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0127606  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4392  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  28.44 
 
 		 180 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0009  integrase/recombinase  38.78 
 
 		 190 aa  46.6  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3517  phage integrase family protein  32.63 
 
 		 188 aa  46.2  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1473  tyrosine recombinase XerD  39.06 
 
 		 296 aa  46.2  0.0006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202075  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.91 
 
 		 298 aa  45.8  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0164  DNA integration/recombination/inversion protein  36.73 
 
 		 190 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0167632  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0412  integrase  36.73 
 
 		 190 aa  45.8  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0192917  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2329  tyrosine recombinase XerD  30.09 
 
 		 277 aa  45.8  0.0008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00235896  normal  0.0350779 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3811  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  28.24 
 
 		 180 aa  45.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0141622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4476  phage integrase family site specific recombinase  31.52 
 
 		 188 aa  45.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1659  tyrosine recombinase XerD  37.84 
 
 		 254 aa  45.4  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  36.62 
 
 		 302 aa  45.1  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5345  integrase family protein  23.13 
 
 		 182 aa  45.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0815  integrase family protein  35.06 
 
 		 183 aa  45.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0377  integrase family protein  31.13 
 
 		 186 aa  45.4  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000239772 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4641  phage integrase family site specific recombinase  34.72 
 
 		 188 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4099  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  28.24 
 
 		 169 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4995  phage integrase family site specific recombinase  34.72 
 
 		 188 aa  44.7  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  29.82 
 
 		 297 aa  44.3  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2286  phage integrase  34.55 
 
 		 188 aa  44.7  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000274502  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0644  phage integrase family protein  34.34 
 
 		 186 aa  44.3  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0659  phage integrase family protein  34.34 
 
 		 186 aa  44.3  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.271524  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2932  integrase family protein  33.33 
 
 		 318 aa  44.3  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.426085 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  35.71 
 
 		 295 aa  44.3  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0001  site-specific recombinase  32.5 
 
 		 190 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1007  site-specific recombinase  35.06 
 
 		 183 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.22552e-63 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4865  site-specific recombinase, phage integrase family  34.72 
 
 		 188 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5431  tyrosine recombinase XerD  38.89 
 
 		 299 aa  44.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.060431  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  30.56 
 
 		 294 aa  44.3  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2821  tyrosine recombinase XerD  37.5 
 
 		 313 aa  44.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.346068  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5872  integrase family protein  46.81 
 
 		 433 aa  44.3  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4494  phage integrase family site specific recombinase  33.33 
 
 		 188 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2815  integrase/recombinase XerD  44.12 
 
 		 311 aa  43.9  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1481  phage integrase family protein  44.12 
 
 		 311 aa  43.9  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0281722  normal  0.205606 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4574  integrase family protein  33.33 
 
 		 188 aa  43.9  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.71 
 
 		 299 aa  43.9  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15230  site-specific tyrosine recombinase XerD  28 
 
 		 316 aa  43.9  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0614301  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  35.21 
 
 		 302 aa  43.5  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  34.29 
 
 		 302 aa  43.1  0.004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1555  tyrosine recombinase XerD  32.89 
 
 		 290 aa  43.5  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0971  integrase family protein  43.08 
 
 		 328 aa  43.5  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0337  Integrase  40.91 
 
 		 311 aa  43.5  0.004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.180562  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4879  site-specific recombinase, phage integrase family  33.33 
 
 		 188 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  35.21 
 
 		 302 aa  43.1  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1590  phage integrase family site specific recombinase  41.51 
 
 		 182 aa  43.1  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000133866  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1531  phage integrase family protein  44.12 
 
 		 311 aa  43.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.504949 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0938  site-specific recombinase IntI4  21.01 
 
 		 320 aa  43.1  0.005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000827497  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3507  phage integrase family protein  32 
 
 		 345 aa  43.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000014558 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14190  tyrosine recombinase XerD  32.88 
 
 		 321 aa  43.1  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.127512  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25380  tyrosine recombinase XerD subunit  37.5 
 
 		 311 aa  43.1  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.732719 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2104  tyrosine recombinase XerD  35.14 
 
 		 301 aa  43.1  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.443082 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2692  tyrosine recombinase XerD  34.52 
 
 		 295 aa  42.7  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.457784  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0519  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.83 
 
 		 302 aa  42.4  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0998774  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4429  tyrosine recombinase XerD  34.72 
 
 		 301 aa  42.4  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0676058  normal  1 
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3470  integrase family protein  35.29 
 
 		 182 aa  42.4  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>