More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0337 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_0337  Integrase  100 
 
 		 311 aa  650    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.180562  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1131  Integrase  35.62 
 
 		 223 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.127877  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12664  integrase  30.45 
 
 		 332 aa  112  5e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000304658  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  27.74 
 
 		 295 aa  75.5  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2544  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.49 
 
 		 308 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2788  tyrosine recombinase XerC  32.75 
 
 		 343 aa  73.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0114244  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2881  tyrosine recombinase XerC  32.72 
 
 		 343 aa  73.2  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312354  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0116  Phage integrase, N-terminal SAM- like  24.33 
 
 		 309 aa  73.2  0.000000000006  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0169  phage integrase family protein  24.91 
 
 		 282 aa  72.8  0.000000000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0558238  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0728  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.62 
 
 		 330 aa  72  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.442089  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  25.09 
 
 		 302 aa  71.6  0.00000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2689  tyrosine recombinase XerC  31.56 
 
 		 311 aa  71.6  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.147909 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3012  tyrosine recombinase XerD subunit  32.11 
 
 		 295 aa  70.9  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146868  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3407  integrase family protein  25.75 
 
 		 325 aa  70.1  0.00000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.155435 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0401  integrase family protein  28.67 
 
 		 304 aa  70.1  0.00000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.966282 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1473  tyrosine recombinase XerD  26.48 
 
 		 296 aa  69.3  0.00000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202075  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2695  tyrosine recombinase XerC  32.73 
 
 		 342 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.400065  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2860  tyrosine recombinase XerC subunit  27.24 
 
 		 300 aa  67.8  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  24.25 
 
 		 320 aa  67  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3598  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.66 
 
 		 317 aa  66.6  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2276  tyrosine recombinase XerD  24 
 
 		 301 aa  66.2  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.235275  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0712  integrase family protein  25.82 
 
 		 285 aa  66.6  0.0000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00227312  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0358  integrase family protein  24.55 
 
 		 287 aa  66.2  0.0000000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2105  tyrosine recombinase XerD  27.78 
 
 		 297 aa  65.1  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.179497  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  24.22 
 
 		 290 aa  65.1  0.000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3738  prophage LambdaBa03, site-specific recombinase, phage integrase family  24.32 
 
 		 304 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000543556  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1191  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.7 
 
 		 313 aa  65.1  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.60628  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3848  integrase family protein  29.28 
 
 		 327 aa  64.7  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.250043  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0144  tyrosine recombinase XerD  25.57 
 
 		 305 aa  65.1  0.000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0537  tyrosine recombinase XerD subunit  26.91 
 
 		 302 aa  63.9  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2175  tyrosine recombinase XerD  25.1 
 
 		 299 aa  64.3  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1344  integrase family protein  25.17 
 
 		 292 aa  64.3  0.000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000678444  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1654  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.84 
 
 		 330 aa  64.3  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000234006  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3247  integrase/recombinase XerC  32.71 
 
 		 296 aa  63.9  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0194  tyrosine recombinase XerC subunit  29.52 
 
 		 295 aa  63.2  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3891  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.84 
 
 		 317 aa  62.8  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.125291  decreased coverage  0.00274094 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0577  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.91 
 
 		 305 aa  62.8  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0855221  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2654  tyrosine recombinase XerD  26.26 
 
 		 306 aa  62.8  0.000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  28.4 
 
 		 295 aa  62.4  0.000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1847  integrase family protein  24.33 
 
 		 314 aa  62.4  0.000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  25.4 
 
 		 295 aa  62  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0173  tyrosine recombinase XerD  23.93 
 
 		 309 aa  61.6  0.00000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.861385  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3062  site-specific tyrosine recombinase XerD  25 
 
 		 308 aa  62  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1174  tyrosine recombinase XerD  24.58 
 
 		 300 aa  62  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.784052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0476  tyrosine recombinase XerD  25.58 
 
 		 302 aa  61.2  0.00000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2622  integrase family protein  28.86 
 
 		 335 aa  61.6  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.647869  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7575  tyrosine recombinase XerD subunit  25.68 
 
 		 308 aa  61.2  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.440547  normal  0.271837 
 
 
-
 
NC_011733  PCC7424_5613  hypothetical protein  27.1 
 
 		 273 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2255  tyrosine recombinase XerD  26.16 
 
 		 305 aa  61.6  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000204462  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  27.05 
 
 		 307 aa  60.8  0.00000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008696  Tpen_1891  phage integrase family protein  26.41 
 
 		 278 aa  61.2  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2567  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.73 
 
 		 313 aa  60.8  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.615759 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11988  putative tyrosine recombinase  28.7 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2378  tyrosine recombinase XerD  28.11 
 
 		 296 aa  60.8  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4348  site-specific recombinase, phage integrase family  33.03 
 
 		 326 aa  60.8  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.175546  hitchhiker  0.00000000567763 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0319  tyrosine recombinase XerD  26.03 
 
 		 307 aa  60.8  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.944891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0748  tyrosine recombinase XerD  23.45 
 
 		 303 aa  60.8  0.00000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.50433  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1201  phage integrase  24.79 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0529826  normal  0.150621 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0292  tyrosine recombinase XerD  27.27 
 
 		 305 aa  60.5  0.00000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08760  tyrosine recombinase XerD  27.52 
 
 		 309 aa  60.8  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.940341  unclonable  0.00000000128305 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1023  tyrosine recombinase XerC subunit  26.03 
 
 		 307 aa  60.8  0.00000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.554982  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4851  integrase family protein  24.5 
 
 		 294 aa  60.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1381  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.15 
 
 		 298 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00360913  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2512  tyrosine recombinase XerD  26.34 
 
 		 328 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.234856 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  26.47 
 
 		 296 aa  60.1  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1819  integrase/recombinase XerD  26.12 
 
 		 295 aa  60.1  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.530175  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1732  integrase/recombinase XerD  24.29 
 
 		 308 aa  59.7  0.00000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.27 
 
 		 299 aa  60.1  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0027  integrase/recombinase  32.96 
 
 		 325 aa  60.1  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000824478  normal  0.490771 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1617  site-specific tyrosine recombinase XerC  21.82 
 
 		 330 aa  60.1  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000155402  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2329  tyrosine recombinase XerD  24.88 
 
 		 277 aa  59.7  0.00000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00235896  normal  0.0350779 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3152  integrase family protein  35.24 
 
 		 352 aa  59.7  0.00000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1622  tyrosine recombinase XerD  25.78 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0907  site-specific tyrosine recombinase XerD  23.75 
 
 		 307 aa  59.7  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2735  tyrosine recombinase XerD  25.89 
 
 		 328 aa  59.7  0.00000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.206607 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3714  tyrosine recombinase XerD  23.59 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0159  integrase family protein  27.1 
 
 		 295 aa  59.7  0.00000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0788  phage integrase family protein  34.25 
 
 		 293 aa  59.7  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1008  phage integrase  33.33 
 
 		 347 aa  59.7  0.00000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2415  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.92 
 
 		 298 aa  59.7  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6957  integrase family protein  25.78 
 
 		 292 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3433  phage integrase family protein  27.56 
 
 		 345 aa  59.3  0.00000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0519  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.31 
 
 		 302 aa  59.3  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0998774  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2271  phage integrase family protein  24.5 
 
 		 321 aa  59.3  0.00000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0180  phage integrase  32.93 
 
 		 336 aa  58.9  0.00000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0996549 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2996  tyrosine recombinase XerC  26.97 
 
 		 323 aa  58.9  0.00000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0687  Phage integrase  24.89 
 
 		 310 aa  59.3  0.00000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.004827  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  26.07 
 
 		 294 aa  59.3  0.00000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0350  phage integrase family protein  26.86 
 
 		 341 aa  59.3  0.00000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000105216  hitchhiker  0.0000498769 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0602  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.21 
 
 		 324 aa  58.9  0.00000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926796 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1468  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.78 
 
 		 298 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.208903 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4253  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.78 
 
 		 298 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2172  tyrosine recombinase XerD  26.91 
 
 		 309 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0616277  normal  0.178894 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1286  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.16 
 
 		 298 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0511461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0052  phage integrase  26.32 
 
 		 312 aa  58.5  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  27.19 
 
 		 300 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  25.54 
 
 		 295 aa  58.9  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0924  phage integrase family protein  25.69 
 
 		 294 aa  58.5  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.852644  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4056  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.37 
 
 		 332 aa  58.9  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.111498  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0057  tyrosine recombinase XerD  24.81 
 
 		 312 aa  58.9  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.502069 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>