More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12664 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12664  integrase  100 
 
 		 332 aa  670    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000304658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1131  Integrase  45.81 
 
 		 223 aa  152  8e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.127877  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0337  Integrase  30.15 
 
 		 311 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.180562  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1185  tyrosine recombinase XerD  33.33 
 
 		 310 aa  92.8  6e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497096  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1201  phage integrase  32.24 
 
 		 301 aa  90.1  4e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0529826  normal  0.150621 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  30.08 
 
 		 302 aa  88.6  1e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  27.24 
 
 		 295 aa  86.7  5e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0758  phage integrase family protein  31.78 
 
 		 304 aa  85.5  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000222973  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1191  site-specific tyrosine recombinase XerC  36.47 
 
 		 313 aa  84.7  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.60628  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  32.64 
 
 		 294 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  30.29 
 
 		 305 aa  84  0.000000000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  40 
 
 		 295 aa  84  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  30.47 
 
 		 297 aa  83.2  0.000000000000006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_5002  hypothtical protein  31.06 
 
 		 308 aa  82.8  0.000000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0748381  hitchhiker  0.0000000255834 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1220  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.95 
 
 		 330 aa  82.8  0.000000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1971  tyrosine recombinase XerD subunit  31.93 
 
 		 309 aa  82.4  0.000000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000860406  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  39.13 
 
 		 293 aa  82  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1991  metallo-beta-lactamase family protein  29.41 
 
 		 353 aa  81.6  0.00000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0492  phage integrase family site specific recombinase  35.59 
 
 		 294 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0248661  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0359  tyrosine recombinase XerD  35.85 
 
 		 290 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00723526 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0105  hydrogenase expression/formation protein  27.97 
 
 		 354 aa  80.9  0.00000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2090  transport protein  27.97 
 
 		 353 aa  80.9  0.00000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0326537  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0772  phage integrase  31.92 
 
 		 304 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  32.85 
 
 		 302 aa  80.1  0.00000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2489  tyrosine recombinase XerD  35.5 
 
 		 318 aa  80.1  0.00000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189208  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0010  tyrosine recombinase XerC  31.25 
 
 		 299 aa  80.1  0.00000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  38.41 
 
 		 293 aa  79.7  0.00000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14190  tyrosine recombinase XerD  38.89 
 
 		 321 aa  79.3  0.00000000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.127512  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0602  site-specific tyrosine recombinase XerC  41.29 
 
 		 324 aa  79.3  0.00000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926796 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1457  integrase family protein  33.49 
 
 		 326 aa  78.6  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1622  tyrosine recombinase XerD  26.33 
 
 		 310 aa  79  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0843  phage integrase family site specific recombinase  33.54 
 
 		 354 aa  78.6  0.0000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00824905  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1432  tyrosine recombinase XerD  33.01 
 
 		 321 aa  79  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0895087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1030  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.48 
 
 		 307 aa  78.2  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  29.77 
 
 		 302 aa  78.2  0.0000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  39.13 
 
 		 294 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000138339  normal  0.959316 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1247  Phage integrase  29.33 
 
 		 278 aa  77.8  0.0000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0722  phage integrase family protein  28.02 
 
 		 306 aa  77.4  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0599364 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0684  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.64 
 
 		 324 aa  77.4  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.631001  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0787  formylmethanofuran dehydrogenase subunit E-like protein  30.04 
 
 		 320 aa  77  0.0000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.00453269  unclonable  0.000000000000100471 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1531  phage integrase family protein  31.91 
 
 		 311 aa  77  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.504949 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  32.46 
 
 		 302 aa  76.3  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2484  phage integrase  37.11 
 
 		 304 aa  76.3  0.0000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.72317  normal  0.0269236 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04122  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.66 
 
 		 305 aa  76.3  0.0000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1241  tyrosine recombinase XerD  35.53 
 
 		 311 aa  75.9  0.0000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.657845  normal  0.578091 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4076  phage integrase  30.17 
 
 		 298 aa  75.5  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0347  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.86 
 
 		 307 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.693124 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2709  integrase family protein  32.18 
 
 		 210 aa  74.7  0.000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000251547  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0238  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.04 
 
 		 306 aa  74.7  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0625179  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  29.96 
 
 		 295 aa  75.1  0.000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0426  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.97 
 
 		 321 aa  74.7  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0177  site-specific tyrosine recombinase XerC  37.41 
 
 		 323 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2064  phage integrase  33.18 
 
 		 297 aa  74.7  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10430  site-specific recombinase XerD  25.42 
 
 		 313 aa  74.7  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00129547  unclonable  0.000000000966981 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0536  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.66 
 
 		 300 aa  74.7  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.538013  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1347  tyrosine recombinase XerD  31.75 
 
 		 306 aa  73.9  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.816733  normal  0.74121 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1585  site-specific recombinase XerD-like  30.16 
 
 		 332 aa  74.3  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.264485  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0452  tyrosine recombinase XerC subunit  29.48 
 
 		 335 aa  73.9  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.577676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  31.41 
 
 		 302 aa  73.9  0.000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008696  Tpen_1891  phage integrase family protein  29.91 
 
 		 278 aa  74.3  0.000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0139  tyrosine recombinase XerD  24.3 
 
 		 312 aa  73.9  0.000000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3960  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.92 
 
 		 311 aa  73.9  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.011638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1118  tyrosine recombinase XerD  33.33 
 
 		 304 aa  73.9  0.000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1222  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.88 
 
 		 306 aa  73.9  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.120622 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1520  tyrosine recombinase XerD  27.02 
 
 		 362 aa  73.6  0.000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000383292 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1524  integrase family protein  25.82 
 
 		 300 aa  73.6  0.000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.681425  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0011  phage integrase family protein  32.68 
 
 		 301 aa  73.6  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  32.31 
 
 		 332 aa  73.2  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  27.05 
 
 		 295 aa  73.6  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4375  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.03 
 
 		 307 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1481  phage integrase family protein  40.16 
 
 		 311 aa  73.6  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0281722  normal  0.205606 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2809  phage integrase family protein  32.34 
 
 		 311 aa  73.2  0.000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  29.69 
 
 		 296 aa  73.2  0.000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0341  tyrosine recombinase XerC  31.47 
 
 		 317 aa  73.2  0.000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000100724  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0159  integrase family protein  30.34 
 
 		 295 aa  73.2  0.000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2815  integrase/recombinase XerD  40.16 
 
 		 311 aa  73.2  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2797  tyrosine recombinase XerD  27.69 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal  0.205647 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11988  putative tyrosine recombinase  28.57 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  31.89 
 
 		 302 aa  72.8  0.000000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0927  tyrosine recombinase XerD  26.61 
 
 		 304 aa  72.8  0.000000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  31.35 
 
 		 302 aa  72.4  0.000000000009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0772  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.8 
 
 		 324 aa  72.8  0.000000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2702  site-specific recombinase  29.22 
 
 		 299 aa  72.4  0.000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0401  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.44 
 
 		 324 aa  72.4  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.145415 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1924  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.03 
 
 		 325 aa  72.4  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.239497 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  34.39 
 
 		 295 aa  72  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0271  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.44 
 
 		 351 aa  72.4  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28022  normal  0.462537 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0724  integrase family protein  35.4 
 
 		 308 aa  72  0.00000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.971464 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2105  tyrosine recombinase XerD  31.96 
 
 		 297 aa  72.4  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.179497  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2994  tyrosine recombinase XerD  29.69 
 
 		 315 aa  72  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0677  integrase family protein  28.81 
 
 		 291 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.92563 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  35.33 
 
 		 296 aa  72  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2172  tyrosine recombinase XerD  27.92 
 
 		 309 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0616277  normal  0.178894 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3661  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.16 
 
 		 311 aa  72  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2383  tyrosine recombinase XerD  28.57 
 
 		 295 aa  72  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2452  tyrosine recombinase XerD  29.55 
 
 		 306 aa  71.2  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.728507 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1159  integrase family protein  31.36 
 
 		 344 aa  71.2  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.226555 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1012  phage integrase family site specific recombinase  26.47 
 
 		 354 aa  71.2  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000959514  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  27.95 
 
 		 295 aa  71.6  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  27.95 
 
 		 295 aa  71.6  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>