More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1991 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1991  metallo-beta-lactamase family protein  100 
 
 
353 aa  715    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2090  transport protein  84.38 
 
 
353 aa  619  1e-176  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0326537  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0105  hydrogenase expression/formation protein  84.38 
 
 
354 aa  620  1e-176  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0843  phage integrase family site specific recombinase  79.32 
 
 
354 aa  582  1.0000000000000001e-165  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00824905  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1012  phage integrase family site specific recombinase  75.92 
 
 
354 aa  547  1e-155  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000959514  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0950  phage integrase family site specific recombinase  76.2 
 
 
354 aa  550  1e-155  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0218535  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0879  phage integrase family site specific recombinase  75.92 
 
 
354 aa  548  1e-155  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.159654  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0735  integrase/recombinase  74.22 
 
 
355 aa  534  1e-151  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.000138239  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1132  phage integrase family site specific recombinase  66.01 
 
 
352 aa  483  1e-135  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1268  integrase family protein  55.33 
 
 
353 aa  371  1e-102  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2175  tyrosine recombinase XerD  37.76 
 
 
299 aa  118  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3715  integrase family protein  37.36 
 
 
298 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  30.98 
 
 
295 aa  114  4.0000000000000004e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1390  site-specific tyrosine recombinase XerC  37.23 
 
 
328 aa  112  8.000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000179914  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  35.48 
 
 
284 aa  112  8.000000000000001e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2797  tyrosine recombinase XerD  30.54 
 
 
298 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal  0.205647 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2497  integrase family protein  36.32 
 
 
308 aa  109  6e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0918  integrase  31.63 
 
 
307 aa  107  2e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.0200604 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  32.74 
 
 
295 aa  108  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1104  site-specific tyrosine recombinase XerC  36.6 
 
 
300 aa  107  3e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000317379  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0537  tyrosine recombinase XerD subunit  30.61 
 
 
302 aa  106  5e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0536  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.18 
 
 
300 aa  107  5e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.538013  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0426  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.17 
 
 
321 aa  106  6e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1654  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.64 
 
 
330 aa  106  6e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000234006  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2702  site-specific recombinase  31.75 
 
 
299 aa  105  8e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0401  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.77 
 
 
324 aa  105  9e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.145415 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1347  tyrosine recombinase XerD  31.38 
 
 
306 aa  105  1e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.816733  normal  0.74121 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1094  phage integrase family site specific recombinase  34.38 
 
 
223 aa  104  2e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.331299  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2346  tyrosine recombinase XerC  34.87 
 
 
302 aa  105  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1241  tyrosine recombinase XerD  27.48 
 
 
311 aa  104  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.657845  normal  0.578091 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  35.64 
 
 
297 aa  103  4e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2117  tyrosine recombinase XerD  34.04 
 
 
298 aa  103  5e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815623  normal  0.0464222 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0401  integrase family protein  27.92 
 
 
304 aa  103  6e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.966282 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1383  integrase family protein  34.38 
 
 
307 aa  103  6e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03409  tyrosine recombinase  32.91 
 
 
308 aa  102  9e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  36.84 
 
 
302 aa  102  9e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1220  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.78 
 
 
330 aa  102  1e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1239  hypothetical protein  34.04 
 
 
299 aa  101  2e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.968724 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1639  integrase family protein  34.5 
 
 
301 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0514216  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0271  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.04 
 
 
351 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28022  normal  0.462537 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0159  integrase family protein  37.57 
 
 
295 aa  101  2e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1906  integrase family protein  33.33 
 
 
295 aa  101  2e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.713326  normal  0.217947 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  34.92 
 
 
298 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1489  tyrosine recombinase XerD  34.9 
 
 
313 aa  100  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.966498  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1185  tyrosine recombinase XerD  33.86 
 
 
310 aa  100  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497096  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1531  phage integrase family protein  30.99 
 
 
311 aa  100  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.504949 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2695  tyrosine recombinase XerC  34.02 
 
 
342 aa  100  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.400065  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5470  tyrosine recombinase XerD  33.16 
 
 
316 aa  100  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.602612  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0180  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.09 
 
 
324 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  34.18 
 
 
290 aa  100  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0116  Phage integrase, N-terminal SAM- like  31.62 
 
 
309 aa  100  4e-20  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2788  tyrosine recombinase XerC  34.02 
 
 
343 aa  100  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0114244  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  40 
 
 
290 aa  100  4e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0177  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.15 
 
 
323 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1023  tyrosine recombinase XerC subunit  34.55 
 
 
307 aa  99.8  6e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.554982  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0728  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.8 
 
 
330 aa  99.8  6e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.442089  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0818  tyrosine recombinase XerC  35.6 
 
 
296 aa  99.8  7e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.368613  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  34.2 
 
 
295 aa  99.8  7e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11988  putative tyrosine recombinase  29.04 
 
 
298 aa  99.4  8e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0758  phage integrase family protein  32.24 
 
 
304 aa  99.4  9e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000222973  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2881  tyrosine recombinase XerC  33.51 
 
 
343 aa  99  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312354  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19920  tyrosine recombinase XerD  32.46 
 
 
317 aa  99  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210765  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2329  tyrosine recombinase XerD  34.74 
 
 
277 aa  99  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00235896  normal  0.0350779 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0553  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.7 
 
 
329 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.172687  normal  0.167276 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0815  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.18 
 
 
298 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.624778  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  37.02 
 
 
294 aa  99  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02726  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.18 
 
 
298 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.292633  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0798  tyrosine recombinase XerD  28.18 
 
 
298 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.966972  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2169  tyrosine recombinase XerD  35.6 
 
 
298 aa  98.2  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4185  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.18 
 
 
298 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02689  hypothetical protein  28.18 
 
 
298 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.364794  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  37.7 
 
 
332 aa  98.2  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  34.64 
 
 
307 aa  97.8  2e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3053  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.18 
 
 
298 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3314  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.18 
 
 
298 aa  97.8  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2692  tyrosine recombinase XerD  36.36 
 
 
295 aa  97.8  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.457784  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1178  tyrosine recombinase XerC subunit  34.33 
 
 
300 aa  97.8  2e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  32.11 
 
 
320 aa  97.8  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3027  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.18 
 
 
298 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3281  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.59 
 
 
317 aa  98.6  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3124  integrase family protein  32.13 
 
 
323 aa  98.6  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2436  tyrosine recombinase XerD  27.67 
 
 
305 aa  98.2  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.578966 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3220  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.18 
 
 
298 aa  97.8  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  34.64 
 
 
307 aa  97.4  3e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4805  tyrosine recombinase XerC  35.95 
 
 
367 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104736  normal  0.146847 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2942  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.67 
 
 
318 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1003  tyrosine recombinase XerD subunit  33.5 
 
 
302 aa  97.4  3e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.497558  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0235  Integrase  30.77 
 
 
308 aa  97.4  3e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.386202  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1266  tyrosine recombinase XerD  32.98 
 
 
310 aa  97.4  3e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2986  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.67 
 
 
318 aa  97.4  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  33.16 
 
 
302 aa  97.4  3e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3981  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.27 
 
 
300 aa  97.4  3e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.105897  normal  0.285215 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  28.52 
 
 
295 aa  97.1  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2689  tyrosine recombinase XerC  33.67 
 
 
311 aa  97.1  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.147909 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2992  tyrosine recombinase XerD  32.14 
 
 
308 aa  97.1  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1821  integrase family protein  32.13 
 
 
307 aa  97.1  4e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0364742  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0124  phage integrase family protein  30.04 
 
 
298 aa  97.1  4e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.776243  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  28.52 
 
 
295 aa  97.1  4e-19  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2957  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.67 
 
 
318 aa  97.4  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal  0.636956 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47730  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.2 
 
 
299 aa  97.1  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0435757  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>