More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_2090 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_2090  transport protein  100 
 
 		 353 aa  715    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0326537  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0105  hydrogenase expression/formation protein  100 
 
 		 354 aa  714    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1991  metallo-beta-lactamase family protein  84.38 
 
 		 353 aa  619  1e-176  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0843  phage integrase family site specific recombinase  82.62 
 
 		 354 aa  607  1e-173  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00824905  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1012  phage integrase family site specific recombinase  74.22 
 
 		 354 aa  548  1e-155  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000959514  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0950  phage integrase family site specific recombinase  74.22 
 
 		 354 aa  546  1e-154  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0218535  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0879  phage integrase family site specific recombinase  73.94 
 
 		 354 aa  545  1e-154  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.159654  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0735  integrase/recombinase  74.07 
 
 		 355 aa  536  1e-151  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.000138239  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1132  phage integrase family site specific recombinase  66.76 
 
 		 352 aa  497  1e-139  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1268  integrase family protein  54.76 
 
 		 353 aa  376  1e-103  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2175  tyrosine recombinase XerD  37.31 
 
 		 299 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3715  integrase family protein  36.26 
 
 		 298 aa  116  6.9999999999999995e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  37.43 
 
 		 284 aa  115  1.0000000000000001e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0536  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.72 
 
 		 300 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.538013  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0918  integrase  31.29 
 
 		 307 aa  110  4.0000000000000004e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0200604 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0426  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.09 
 
 		 321 aa  108  2e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1390  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.64 
 
 		 328 aa  107  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000179914  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  36.65 
 
 		 295 aa  106  6e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0401  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.95 
 
 		 324 aa  105  9e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.145415 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1383  integrase family protein  34.18 
 
 		 307 aa  105  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2702  site-specific recombinase  31.3 
 
 		 299 aa  105  1e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2346  tyrosine recombinase XerC  35.11 
 
 		 302 aa  105  2e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2797  tyrosine recombinase XerD  29.9 
 
 		 298 aa  105  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal  0.205647 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3124  integrase family protein  32.13 
 
 		 323 aa  103  4e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0817  tyrosine recombinase XerD  31.29 
 
 		 305 aa  103  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.763193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1241  tyrosine recombinase XerD  26.48 
 
 		 311 aa  103  4e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.657845  normal  0.578091 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0401  integrase family protein  28.46 
 
 		 304 aa  103  4e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.966282 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2497  integrase family protein  33.48 
 
 		 308 aa  103  5e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  34.55 
 
 		 295 aa  103  5e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  37.16 
 
 		 294 aa  103  6e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0180  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.02 
 
 		 324 aa  102  8e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  32.99 
 
 		 297 aa  102  8e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1654  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.56 
 
 		 330 aa  102  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000234006  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1104  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.9 
 
 		 300 aa  102  1e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000317379  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0537  tyrosine recombinase XerD subunit  34.03 
 
 		 302 aa  102  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0159  integrase family protein  36.67 
 
 		 295 aa  102  1e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2689  tyrosine recombinase XerC  35.53 
 
 		 311 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.147909 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0815  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.33 
 
 		 298 aa  102  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.624778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0177  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.27 
 
 		 323 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02726  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.33 
 
 		 298 aa  101  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.292633  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0798  tyrosine recombinase XerD  27.33 
 
 		 298 aa  101  2e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.966972  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11988  putative tyrosine recombinase  30.14 
 
 		 298 aa  101  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0818  tyrosine recombinase XerC  36.13 
 
 		 296 aa  101  2e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.368613  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02689  hypothetical protein  27.33 
 
 		 298 aa  101  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.364794  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1094  phage integrase family site specific recombinase  33.48 
 
 		 223 aa  101  2e-20  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.331299  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4185  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.33 
 
 		 298 aa  101  2e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3220  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.33 
 
 		 298 aa  101  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0235  Integrase  32.65 
 
 		 308 aa  101  2e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.386202  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0124  phage integrase family protein  35.42 
 
 		 298 aa  101  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.776243  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1639  integrase family protein  35.11 
 
 		 301 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0514216  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3053  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.33 
 
 		 298 aa  101  2e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3314  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.33 
 
 		 298 aa  101  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3027  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.33 
 
 		 298 aa  101  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47730  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.38 
 
 		 299 aa  100  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0435757  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1347  tyrosine recombinase XerD  29.54 
 
 		 306 aa  100  3e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.816733  normal  0.74121 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0728  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.75 
 
 		 330 aa  100  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.442089  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  34.67 
 
 		 298 aa  100  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6023  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.08 
 
 		 303 aa  100  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0381  tyrosine recombinase XerD  30.29 
 
 		 303 aa  100  4e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5470  tyrosine recombinase XerD  32.14 
 
 		 316 aa  100  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.602612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0553  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.19 
 
 		 329 aa  99.8  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.172687  normal  0.167276 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2695  tyrosine recombinase XerC  32.31 
 
 		 342 aa  99.8  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.400065  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0271  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.22 
 
 		 351 aa  99.8  7e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28022  normal  0.462537 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69710  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.55 
 
 		 303 aa  99.8  7e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.737312  normal  0.478185 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  30.21 
 
 		 296 aa  99.4  8e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2788  tyrosine recombinase XerC  32.31 
 
 		 343 aa  99.4  8e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0114244  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2881  tyrosine recombinase XerC  32.31 
 
 		 343 aa  99.4  9e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312354  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1489  tyrosine recombinase XerD  33.33 
 
 		 313 aa  99.4  9e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.966498  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1827  tyrosine recombinase XerD  36.36 
 
 		 306 aa  98.6  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  31.91 
 
 		 320 aa  98.6  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4429  tyrosine recombinase XerD  33.88 
 
 		 301 aa  98.6  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0676058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1185  tyrosine recombinase XerD  30.98 
 
 		 310 aa  98.6  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497096  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0927  tyrosine recombinase XerD  36.02 
 
 		 304 aa  98.6  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0722  phage integrase family protein  35.75 
 
 		 306 aa  99  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0599364 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0185  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.42 
 
 		 299 aa  98.2  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  31.72 
 
 		 302 aa  97.8  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0912  integrase/recombinase  33.2 
 
 		 304 aa  98.2  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0261382  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1239  hypothetical protein  32.98 
 
 		 299 aa  98.2  2e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.968724 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2117  tyrosine recombinase XerD  32.11 
 
 		 298 aa  98.2  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815623  normal  0.0464222 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03409  tyrosine recombinase  30.8 
 
 		 308 aa  97.4  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0222  integrase/recombinase XerC  28.77 
 
 		 299 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1531  phage integrase family protein  30.99 
 
 		 311 aa  97.8  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.504949 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1914  integrase/recombinase  36.9 
 
 		 304 aa  97.8  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00100079  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4805  tyrosine recombinase XerC  35.95 
 
 		 367 aa  97.8  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.104736  normal  0.146847 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3796  phage integrase family protein  36.9 
 
 		 304 aa  97.4  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1432  tyrosine recombinase XerD  28.17 
 
 		 321 aa  97.4  3e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0895087  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1932  tyrosine recombinase XerD  30.85 
 
 		 310 aa  97.4  4e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1220  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.34 
 
 		 330 aa  97.1  4e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2436  tyrosine recombinase XerD  27.18 
 
 		 305 aa  97.1  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.578966 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0564  tyrosine recombinase XerC subunit  28.88 
 
 		 328 aa  97.1  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  33.16 
 
 		 295 aa  97.1  4e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1225  integrase family protein  33.99 
 
 		 301 aa  96.7  5e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.103765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0247  integrase family protein  34.64 
 
 		 322 aa  96.7  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.121071  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0067  phage integrase family protein  27.82 
 
 		 328 aa  96.3  7e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.183253 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1266  tyrosine recombinase XerD  31.75 
 
 		 310 aa  96.3  8e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0758  phage integrase family protein  31.3 
 
 		 304 aa  95.9  8e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000222973  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19920  tyrosine recombinase XerD  30.37 
 
 		 317 aa  96.3  8e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4524  Phage integrase  27.12 
 
 		 310 aa  95.9  8e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1023  tyrosine recombinase XerC subunit  35.05 
 
 		 307 aa  96.3  8e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.554982  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  35.83 
 
 		 302 aa  96.3  8e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>