More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0843 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0843  phage integrase family site specific recombinase  100 
 
 		 354 aa  714    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00824905  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2090  transport protein  82.62 
 
 		 353 aa  607  1e-173  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0326537  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0105  hydrogenase expression/formation protein  82.62 
 
 		 354 aa  607  1e-173  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1991  metallo-beta-lactamase family protein  79.32 
 
 		 353 aa  582  1.0000000000000001e-165  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0950  phage integrase family site specific recombinase  74.86 
 
 		 354 aa  539  9.999999999999999e-153  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0218535  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0879  phage integrase family site specific recombinase  74.58 
 
 		 354 aa  537  9.999999999999999e-153  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.159654  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1012  phage integrase family site specific recombinase  74.29 
 
 		 354 aa  534  1e-151  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000959514  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0735  integrase/recombinase  74.5 
 
 		 355 aa  535  1e-151  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.000138239  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1132  phage integrase family site specific recombinase  66.38 
 
 		 352 aa  478  1e-134  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1268  integrase family protein  56.77 
 
 		 353 aa  385  1e-106  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  37.43 
 
 		 284 aa  114  2.0000000000000002e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2175  tyrosine recombinase XerD  36.98 
 
 		 299 aa  112  8.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3715  integrase family protein  36.26 
 
 		 298 aa  112  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  36.98 
 
 		 295 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0536  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.62 
 
 		 300 aa  109  6e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.538013  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  31.45 
 
 		 295 aa  109  7.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0426  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.22 
 
 		 321 aa  108  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0401  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.82 
 
 		 324 aa  107  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.145415 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2797  tyrosine recombinase XerD  29.87 
 
 		 298 aa  107  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal  0.205647 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0381  tyrosine recombinase XerD  29.19 
 
 		 303 aa  107  4e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1094  phage integrase family site specific recombinase  35.71 
 
 		 223 aa  106  6e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.331299  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1185  tyrosine recombinase XerD  30.31 
 
 		 310 aa  105  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497096  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0815  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.34 
 
 		 298 aa  105  1e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.624778  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02726  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.34 
 
 		 298 aa  105  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.292633  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0798  tyrosine recombinase XerD  28.34 
 
 		 298 aa  105  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.966972  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02689  hypothetical protein  28.34 
 
 		 298 aa  105  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.364794  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4185  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.34 
 
 		 298 aa  105  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3053  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.34 
 
 		 298 aa  105  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3314  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.34 
 
 		 298 aa  105  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  34.72 
 
 		 295 aa  104  2e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3220  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.34 
 
 		 298 aa  105  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3027  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.34 
 
 		 298 aa  105  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0537  tyrosine recombinase XerD subunit  34.03 
 
 		 302 aa  104  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1347  tyrosine recombinase XerD  31.53 
 
 		 306 aa  103  4e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.816733  normal  0.74121 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1390  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.64 
 
 		 328 aa  103  5e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000179914  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0918  integrase  30.14 
 
 		 307 aa  103  5e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0200604 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  34.57 
 
 		 297 aa  103  5e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0728  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.86 
 
 		 330 aa  103  6e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.442089  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0177  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.62 
 
 		 323 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2346  tyrosine recombinase XerC  34.57 
 
 		 302 aa  101  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2497  integrase family protein  35.9 
 
 		 308 aa  101  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0722  phage integrase family protein  29.88 
 
 		 306 aa  100  3e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0599364 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2702  site-specific recombinase  35.03 
 
 		 299 aa  100  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1639  integrase family protein  33.51 
 
 		 301 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0514216  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3124  integrase family protein  31.22 
 
 		 323 aa  100  5e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0180  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.02 
 
 		 324 aa  99.8  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1906  integrase family protein  31.75 
 
 		 295 aa  99.4  8e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.713326  normal  0.217947 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  32.31 
 
 		 300 aa  99.4  8e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  33.86 
 
 		 320 aa  99.4  8e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0772  phage integrase  31.36 
 
 		 304 aa  99.4  8e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  35.98 
 
 		 290 aa  99.4  8e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5470  tyrosine recombinase XerD  32.98 
 
 		 316 aa  99.4  9e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.602612  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0817  tyrosine recombinase XerD  36.08 
 
 		 305 aa  99.4  9e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.763193  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1104  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.68 
 
 		 300 aa  99  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000317379  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0142  integrase family protein  33.85 
 
 		 292 aa  99  1e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11988  putative tyrosine recombinase  28.38 
 
 		 298 aa  99.4  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1654  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.38 
 
 		 330 aa  99.4  1e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000234006  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0271  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.97 
 
 		 351 aa  99  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28022  normal  0.462537 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1383  integrase family protein  33.16 
 
 		 307 aa  98.2  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3380  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.53 
 
 		 298 aa  98.2  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3200  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.53 
 
 		 298 aa  98.2  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.550002  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0124  phage integrase family protein  36.22 
 
 		 298 aa  97.8  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.776243  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  36.02 
 
 		 294 aa  98.2  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3212  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.53 
 
 		 298 aa  98.2  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.476349 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0553  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.42 
 
 		 329 aa  98.6  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.172687  normal  0.167276 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2692  tyrosine recombinase XerD  36.7 
 
 		 295 aa  98.6  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.457784  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3278  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.53 
 
 		 298 aa  98.2  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3275  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.53 
 
 		 298 aa  97.4  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2329  tyrosine recombinase XerD  33.68 
 
 		 277 aa  97.4  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00235896  normal  0.0350779 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  33.33 
 
 		 302 aa  97.4  3e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1082  integrase family protein  39.13 
 
 		 290 aa  97.1  4e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47730  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.38 
 
 		 299 aa  96.7  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0435757  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1659  tyrosine recombinase XerD  35.26 
 
 		 254 aa  96.3  7e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4524  Phage integrase  30 
 
 		 310 aa  96.3  8e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1225  integrase family protein  34.63 
 
 		 301 aa  95.9  9e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.103765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0758  phage integrase family protein  34.97 
 
 		 304 aa  95.9  9e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000222973  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0401  integrase family protein  24.83 
 
 		 304 aa  95.9  9e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.966282 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  27.8 
 
 		 295 aa  95.9  1e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  33.19 
 
 		 299 aa  95.5  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0912  integrase/recombinase  36.27 
 
 		 304 aa  95.5  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0261382  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1914  integrase/recombinase  36.27 
 
 		 304 aa  95.9  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00100079  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3312  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.47 
 
 		 298 aa  95.5  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1239  hypothetical protein  32.98 
 
 		 299 aa  95.5  1e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.968724 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0247  integrase family protein  33.54 
 
 		 322 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.121071  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3796  phage integrase family protein  36.27 
 
 		 304 aa  95.5  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1241  tyrosine recombinase XerD  26.48 
 
 		 311 aa  95.5  1e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.657845  normal  0.578091 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0818  tyrosine recombinase XerC  34.55 
 
 		 296 aa  94.7  2e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.368613  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0927  tyrosine recombinase XerD  36.22 
 
 		 304 aa  95.1  2e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2117  tyrosine recombinase XerD  31.41 
 
 		 298 aa  94.7  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815623  normal  0.0464222 
 
 
-
 
NC_002620  TC0255  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.94 
 
 		 301 aa  94.4  3e-18  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0225677  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1266  tyrosine recombinase XerD  31.41 
 
 		 310 aa  94  3e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0159  integrase family protein  36.61 
 
 		 295 aa  94  3e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2383  tyrosine recombinase XerD  36.36 
 
 		 295 aa  94.4  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  26.53 
 
 		 295 aa  94.4  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0235  Integrase  28.72 
 
 		 308 aa  94  3e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.386202  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  34.22 
 
 		 302 aa  94.4  3e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  26.53 
 
 		 295 aa  94.4  3e-18  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0492  phage integrase family site specific recombinase  38.17 
 
 		 294 aa  93.6  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0248661  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  30.64 
 
 		 295 aa  94  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6023  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.68 
 
 		 303 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>