More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_1012 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003912  CJE0950  phage integrase family site specific recombinase  98.59 
 
 		 354 aa  701    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0218535  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1012  phage integrase family site specific recombinase  100 
 
 		 354 aa  709    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000959514  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0879  phage integrase family site specific recombinase  98.59 
 
 		 354 aa  701    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.159654  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0735  integrase/recombinase  84.99 
 
 		 355 aa  605  9.999999999999999e-173  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.000138239  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1991  metallo-beta-lactamase family protein  75.92 
 
 		 353 aa  560  1e-158  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0105  hydrogenase expression/formation protein  74.22 
 
 		 354 aa  560  1e-158  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2090  transport protein  74.22 
 
 		 353 aa  560  1e-158  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0326537  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0843  phage integrase family site specific recombinase  74.29 
 
 		 354 aa  545  1e-154  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00824905  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1132  phage integrase family site specific recombinase  64.87 
 
 		 352 aa  471  1e-132  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1268  integrase family protein  55.01 
 
 		 353 aa  373  1e-102  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2175  tyrosine recombinase XerD  38.38 
 
 		 299 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  31.94 
 
 		 295 aa  109  9.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1383  integrase family protein  33.33 
 
 		 307 aa  108  1e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  33.51 
 
 		 295 aa  108  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0815  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.85 
 
 		 298 aa  107  4e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.624778  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02726  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.85 
 
 		 298 aa  106  7e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.292633  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0798  tyrosine recombinase XerD  28.85 
 
 		 298 aa  106  7e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.966972  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3314  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.85 
 
 		 298 aa  106  7e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4185  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.85 
 
 		 298 aa  106  7e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3220  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.85 
 
 		 298 aa  106  7e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02689  hypothetical protein  28.85 
 
 		 298 aa  106  7e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.364794  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3027  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.85 
 
 		 298 aa  106  7e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3053  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.85 
 
 		 298 aa  105  8e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0918  integrase  30.14 
 
 		 307 aa  105  9e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.0200604 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0235  Integrase  29.07 
 
 		 308 aa  105  1e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.386202  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  32.53 
 
 		 297 aa  105  1e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3715  integrase family protein  35.71 
 
 		 298 aa  105  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1104  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.92 
 
 		 300 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000317379  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1654  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.87 
 
 		 330 aa  103  5e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000234006  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4429  tyrosine recombinase XerD  35.33 
 
 		 301 aa  103  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0676058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2797  tyrosine recombinase XerD  29.82 
 
 		 298 aa  103  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650693  normal  0.205647 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0818  tyrosine recombinase XerC  37.16 
 
 		 296 aa  102  8e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.368613  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1178  tyrosine recombinase XerC subunit  35.26 
 
 		 300 aa  102  8e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  35.56 
 
 		 294 aa  102  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0098  integrase family protein  33.47 
 
 		 298 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0772  phage integrase  30.7 
 
 		 304 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2497  integrase family protein  32.91 
 
 		 308 aa  101  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3380  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.89 
 
 		 298 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3200  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.89 
 
 		 298 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.550002  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  32.31 
 
 		 284 aa  101  2e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2346  tyrosine recombinase XerC  34.54 
 
 		 302 aa  101  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0144  tyrosine recombinase XerD  28.67 
 
 		 305 aa  101  2e-20  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3278  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.89 
 
 		 298 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1390  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.11 
 
 		 328 aa  101  2e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000179914  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  34.78 
 
 		 298 aa  101  2e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  34.07 
 
 		 295 aa  101  2e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3212  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.89 
 
 		 298 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.476349 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3275  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.89 
 
 		 298 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0177  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.6 
 
 		 323 aa  100  3e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1639  integrase family protein  35.08 
 
 		 301 aa  100  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0514216  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5470  tyrosine recombinase XerD  34.22 
 
 		 316 aa  100  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.602612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1241  tyrosine recombinase XerD  25.78 
 
 		 311 aa  100  5e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.657845  normal  0.578091 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1914  integrase/recombinase  34.9 
 
 		 304 aa  99.4  9e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00100079  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1094  phage integrase family site specific recombinase  33.93 
 
 		 223 aa  99  1e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.331299  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0536  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.03 
 
 		 300 aa  99  1e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.538013  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0678  tyrosine recombinase XerD  27.46 
 
 		 294 aa  99  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0265142 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1185  tyrosine recombinase XerD  32.62 
 
 		 310 aa  99  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.497096  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0920  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.99 
 
 		 299 aa  98.2  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.11 
 
 		 299 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0537  tyrosine recombinase XerD subunit  32.29 
 
 		 302 aa  98.6  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0401  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.77 
 
 		 324 aa  98.2  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.145415 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1554  integrase family protein  35.39 
 
 		 339 aa  98.2  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.86595  decreased coverage  0.00111318 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3847  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.99 
 
 		 299 aa  98.2  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.349121 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.11 
 
 		 299 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0553  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.96 
 
 		 329 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.172687  normal  0.167276 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2117  tyrosine recombinase XerD  31.44 
 
 		 298 aa  98.6  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815623  normal  0.0464222 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  36.76 
 
 		 302 aa  97.8  2e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0879  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.99 
 
 		 299 aa  98.2  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.201006  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  27.3 
 
 		 295 aa  97.8  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0271  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.05 
 
 		 351 aa  97.8  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28022  normal  0.462537 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.11 
 
 		 299 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0912  integrase/recombinase  34.38 
 
 		 304 aa  97.1  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0261382  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  30.53 
 
 		 320 aa  97.1  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  32.43 
 
 		 309 aa  96.7  5e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1148  phage integrase family site specific recombinase  32.47 
 
 		 328 aa  96.7  5e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0281308  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1347  tyrosine recombinase XerD  28.57 
 
 		 306 aa  96.7  5e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.816733  normal  0.74121 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3796  phage integrase family protein  34.38 
 
 		 304 aa  97.1  5e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1560  tyrosine recombinase XerD  28.28 
 
 		 331 aa  96.3  7e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.736869  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1906  integrase family protein  30.85 
 
 		 295 aa  96.3  7e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.713326  normal  0.217947 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.98 
 
 		 299 aa  96.3  7e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_0617  phage integrase family site specific recombinase  33.67 
 
 		 329 aa  96.3  7e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.0000798153  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.58 
 
 		 299 aa  96.3  8e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0426  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.49 
 
 		 321 aa  96.3  8e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2210  integrase family protein  33.85 
 
 		 295 aa  96.3  8e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000241024 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.58 
 
 		 299 aa  96.3  8e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1239  hypothetical protein  33.51 
 
 		 299 aa  96.3  8e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.968724 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3892  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.38 
 
 		 299 aa  95.9  9e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.413643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0722  phage integrase family protein  32.6 
 
 		 306 aa  95.9  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0599364 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.58 
 
 		 299 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.51 
 
 		 300 aa  95.1  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  34.78 
 
 		 294 aa  95.9  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000138339  normal  0.959316 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0861  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.28 
 
 		 299 aa  95.5  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  30.11 
 
 		 300 aa  95.5  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2957  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.88 
 
 		 318 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal  0.636956 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3312  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.41 
 
 		 298 aa  95.5  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1202  tyrosine recombinase XerC  29.78 
 
 		 304 aa  95.5  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1674  tyrosine recombinase XerD  34.21 
 
 		 297 aa  95.1  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0517708  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0116  Phage integrase, N-terminal SAM- like  30.74 
 
 		 309 aa  95.1  2e-18  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0840  integrase family protein  34.76 
 
 		 294 aa  94.7  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.774041 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2986  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.88 
 
 		 318 aa  95.1  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0431132 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>