More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_1131 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010816  BLD_1131  Integrase  100 
 
 		 223 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.127877  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12664  integrase  45.45 
 
 		 332 aa  148  6e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000304658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0337  Integrase  35.62 
 
 		 311 aa  134  9e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.180562  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1991  metallo-beta-lactamase family protein  27.23 
 
 		 353 aa  80.1  0.00000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  31.11 
 
 		 295 aa  78.6  0.00000000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1481  integrase family protein  34.16 
 
 		 308 aa  78.6  0.00000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.141471  normal  0.0727308 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2090  transport protein  26.79 
 
 		 353 aa  77.4  0.0000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0326537  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0758  phage integrase family protein  27.6 
 
 		 304 aa  77.8  0.0000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000222973  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0105  hydrogenase expression/formation protein  26.79 
 
 		 354 aa  77.4  0.0000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0577  site-specific tyrosine recombinase XerD  32.78 
 
 		 305 aa  76.6  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0855221  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04122  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.29 
 
 		 305 aa  75.5  0.0000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23640  tyrosine recombinase XerC subunit  32.5 
 
 		 310 aa  75.5  0.0000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.154193  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1201  phage integrase  29.5 
 
 		 301 aa  75.1  0.0000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0529826  normal  0.150621 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0712  integrase family protein  31.56 
 
 		 285 aa  74.7  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00227312  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0843  phage integrase family site specific recombinase  29.59 
 
 		 354 aa  74.3  0.000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00824905  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1819  integrase/recombinase XerD  29.49 
 
 		 295 aa  73.6  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.530175  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1191  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.91 
 
 		 313 aa  73.6  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.60628  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0623  site-specific recombinase  33.64 
 
 		 332 aa  73.6  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0795  phage integrase family protein  29.96 
 
 		 283 aa  72.8  0.000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1132  phage integrase family site specific recombinase  27.68 
 
 		 352 aa  72.8  0.000000000004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0602  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.09 
 
 		 324 aa  72.8  0.000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926796 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0285  tyrosine recombinase XerC  30.56 
 
 		 302 aa  72.8  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0722  phage integrase family protein  26.01 
 
 		 306 aa  72.4  0.000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0599364 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  30.4 
 
 		 294 aa  72.4  0.000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2104  tyrosine recombinase XerD  30.99 
 
 		 301 aa  72  0.000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.443082 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2702  site-specific recombinase  27.1 
 
 		 299 aa  71.6  0.000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1205  integrase/recombinase XerD  29.86 
 
 		 274 aa  71.6  0.000000000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  28.99 
 
 		 294 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3738  tyrosine recombinase XerD subunit  30.86 
 
 		 328 aa  70.9  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0519  site-specific tyrosine recombinase XerD  31.22 
 
 		 302 aa  71.2  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0998774  normal  0.238721 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1617  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.54 
 
 		 330 aa  71.2  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000155402  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0775  phage integrase family protein  29.6 
 
 		 286 aa  70.5  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0341069  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  27.15 
 
 		 302 aa  70.5  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3062  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.24 
 
 		 308 aa  70.5  0.00000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1412  integrase family protein  28.7 
 
 		 323 aa  69.7  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.157207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  27.15 
 
 		 302 aa  70.1  0.00000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2860  tyrosine recombinase XerC subunit  27.54 
 
 		 300 aa  69.3  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1703  phage integrase  28.63 
 
 		 285 aa  69.3  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008696  Tpen_1891  phage integrase family protein  31.18 
 
 		 278 aa  69.7  0.00000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  27.15 
 
 		 302 aa  69.3  0.00000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2788  tyrosine recombinase XerC  30.3 
 
 		 343 aa  68.9  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0114244  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  27.9 
 
 		 295 aa  68.9  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0173  tyrosine recombinase XerD  26.21 
 
 		 309 aa  68.9  0.00000000006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.861385  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2695  tyrosine recombinase XerC  30.3 
 
 		 342 aa  68.6  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.400065  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  32.28 
 
 		 300 aa  68.6  0.00000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2881  tyrosine recombinase XerC  30.3 
 
 		 343 aa  68.6  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312354  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0523  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.33 
 
 		 315 aa  68.6  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.221654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3396  site-specific tyrosine recombinase XerD  30.04 
 
 		 298 aa  68.6  0.00000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3304  tyrosine recombinase XerD  28.03 
 
 		 298 aa  68.6  0.00000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0133185  normal  0.394454 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3661  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.7 
 
 		 311 aa  68.6  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2544  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.84 
 
 		 308 aa  68.2  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  27.85 
 
 		 293 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0825  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.64 
 
 		 277 aa  67.8  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0104756  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  27.85 
 
 		 293 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1634  integrase family protein  28.04 
 
 		 354 aa  67  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.280587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11080  phage integrase family protein  27.23 
 
 		 310 aa  67  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0105178  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0735  integrase/recombinase  25.33 
 
 		 355 aa  67.4  0.0000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.000138239  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1025  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.39 
 
 		 298 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.899371  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0401  site-specific tyrosine recombinase XerC  35 
 
 		 324 aa  67.4  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.145415 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3012  tyrosine recombinase XerD subunit  30.84 
 
 		 295 aa  67  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146868  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3115  phage integrase  32.86 
 
 		 298 aa  67  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3403  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.69 
 
 		 313 aa  67  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16040  site-specific tyrosine recombinase XerD  28.27 
 
 		 298 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1906  integrase family protein  29.11 
 
 		 295 aa  66.2  0.0000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.713326  normal  0.217947 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3960  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.23 
 
 		 311 aa  66.6  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.011638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0177  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.48 
 
 		 323 aa  66.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  28.33 
 
 		 305 aa  66.2  0.0000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0903  tyrosine recombinase XerD  28.27 
 
 		 303 aa  66.6  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3474  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.68 
 
 		 296 aa  66.6  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.486058 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0988  tyrosine recombinase XerD  28.27 
 
 		 303 aa  66.6  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.252447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2179  integrase family protein  31 
 
 		 288 aa  65.9  0.0000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.353401  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0950  phage integrase family site specific recombinase  22.84 
 
 		 354 aa  66.2  0.0000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0218535  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1687  tyrosine recombinase XerD subunit  30 
 
 		 314 aa  65.9  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0879  phage integrase family site specific recombinase  22.84 
 
 		 354 aa  66.2  0.0000000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.159654  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10430  site-specific recombinase XerD  25.81 
 
 		 313 aa  65.9  0.0000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00129547  unclonable  0.000000000966981 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1012  phage integrase family site specific recombinase  24.02 
 
 		 354 aa  65.9  0.0000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000959514  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0553  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.23 
 
 		 329 aa  65.9  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.172687  normal  0.167276 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0536  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.86 
 
 		 300 aa  65.9  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.538013  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0492  phage integrase family site specific recombinase  28.21 
 
 		 294 aa  65.5  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0248661  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0942  site-specific tyrosine recombinase XerC  32.64 
 
 		 315 aa  65.5  0.0000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0271  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.41 
 
 		 351 aa  65.5  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28022  normal  0.462537 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0116  Phage integrase, N-terminal SAM- like  24.89 
 
 		 309 aa  65.5  0.0000000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0426  site-specific tyrosine recombinase XerC  33.57 
 
 		 321 aa  65.5  0.0000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0562  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.54 
 
 		 300 aa  65.5  0.0000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2383  tyrosine recombinase XerD  28.05 
 
 		 295 aa  65.5  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0401  integrase family protein  30.29 
 
 		 304 aa  65.5  0.0000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.966282 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0736  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.79 
 
 		 294 aa  65.1  0.0000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1381  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.85 
 
 		 298 aa  65.1  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00360913  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4056  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.75 
 
 		 332 aa  65.1  0.0000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.111498  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4114  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.17 
 
 		 322 aa  64.7  0.0000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2038  tyrosine recombinase XerD  29.55 
 
 		 311 aa  64.7  0.000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.487981  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3189  integrase family protein  34.64 
 
 		 320 aa  64.7  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00303256 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25380  tyrosine recombinase XerD subunit  29.82 
 
 		 311 aa  64.7  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.732719 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1902  phage integrase  29.25 
 
 		 293 aa  64.7  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2436  tyrosine recombinase XerD  27.1 
 
 		 305 aa  64.7  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.578966 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39510  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.81 
 
 		 298 aa  64.7  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3046  integrase family protein  32.09 
 
 		 310 aa  64.7  0.000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0144  tyrosine recombinase XerD  26.17 
 
 		 305 aa  63.5  0.000000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0180  site-specific tyrosine recombinase XerC  31.91 
 
 		 324 aa  63.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0750  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.08 
 
 		 311 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>