140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3517 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3517  phage integrase family protein  100 
 
 		 188 aa  386  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0377  integrase family protein  98.92 
 
 		 186 aa  377  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000239772 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1254  phage integrase family protein  71.51 
 
 		 186 aa  277  8e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.709211 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1255  integrase family protein  68.82 
 
 		 186 aa  272  2.0000000000000002e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1771  phage integrase family protein  69.84 
 
 		 204 aa  265  4e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.753085 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1448  phage integrase family site specific recombinase  70.21 
 
 		 188 aa  264  5.999999999999999e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1694  phage integrase family protein  69.31 
 
 		 212 aa  264  5.999999999999999e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.470129  normal  0.0225811 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1799  phage integrase family protein  69.31 
 
 		 204 aa  262  2e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.968459  normal  0.396821 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001839  site-specific recombinase phage integrase family  64.52 
 
 		 186 aa  257  8e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2953  phage integrase family site specific recombinase  62.9 
 
 		 186 aa  243  9.999999999999999e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.603832  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2711  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  33.51 
 
 		 180 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0042219  normal  0.247582 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1368  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  33.51 
 
 		 180 aa  103  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.358053 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4009  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  32.45 
 
 		 180 aa  102  4e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3453  integrase family protein  37.76 
 
 		 189 aa  101  7e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.590005  normal  0.791222 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0577  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  32.96 
 
 		 180 aa  100  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3811  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  31.84 
 
 		 180 aa  98.2  6e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0141622  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0652  DNA integration/recombination/invertion protein  32.09 
 
 		 180 aa  98.2  6e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2613  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  32.45 
 
 		 180 aa  98.2  7e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.301879  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4099  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  35.62 
 
 		 169 aa  96.3  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3599  integrase family protein  32.45 
 
 		 180 aa  96.7  2e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.616601  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1859  prophage LambdaSa2, site-specific recombinase phage integrase family protein  31.28 
 
 		 180 aa  94  1e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00377207  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3590  integrase family protein  33.33 
 
 		 189 aa  91.7  5e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.0592429  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0174  integrase family protein  40.48 
 
 		 186 aa  90.5  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00273109  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1590  phage integrase family site specific recombinase  33.7 
 
 		 182 aa  87.4  1e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000133866  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4392  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  32.96 
 
 		 180 aa  85.9  3e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2230  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  31.84 
 
 		 180 aa  85.5  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3451  integrase family protein  37.1 
 
 		 186 aa  84.7  7e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0127606  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5345  integrase family protein  32.52 
 
 		 182 aa  82.8  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010724  Nther_2955  integrase family protein  32.47 
 
 		 187 aa  81.3  0.000000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.819146  n/a   
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0001  site-specific recombinase  32.67 
 
 		 190 aa  81.3  0.000000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0017  prophage integration/recombination/invertion protein  30.81 
 
 		 190 aa  78.6  0.00000000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000444728  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0312  phage integrase  30.29 
 
 		 209 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4855  site-specific recombinase, phage integrase family  29.29 
 
 		 188 aa  75.5  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1165  integrase family protein  29.03 
 
 		 187 aa  73.2  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4494  phage integrase family site specific recombinase  31.91 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3470  integrase family protein  31.37 
 
 		 182 aa  72.8  0.000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0412  integrase  30.6 
 
 		 190 aa  72  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0192917  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0382  site-specific recombinase, phage integrase family  28.28 
 
 		 188 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0815  integrase family protein  29.78 
 
 		 183 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007107  pE33L9_0009  integrase/recombinase  30.6 
 
 		 190 aa  71.2  0.000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4476  phage integrase family site specific recombinase  31.38 
 
 		 188 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4886  phage integrase family site specific recombinase  32.26 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4641  phage integrase family site specific recombinase  29.57 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4995  phage integrase family site specific recombinase  29.57 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4879  site-specific recombinase, phage integrase family  30.32 
 
 		 188 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4574  integrase family protein  29.79 
 
 		 188 aa  69.7  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4865  site-specific recombinase, phage integrase family  29.57 
 
 		 188 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0164  DNA integration/recombination/inversion protein  30.69 
 
 		 190 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0167632  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1729  phage integrase family protein  33.54 
 
 		 207 aa  69.7  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.425016  normal  0.48456 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1007  site-specific recombinase  29.78 
 
 		 183 aa  68.2  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.22552e-63 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A08  integrase  28.26 
 
 		 195 aa  68.2  0.00000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000000003137  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0439  phage integrase, C-terminus  50 
 
 		 73 aa  67  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.264159  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2286  phage integrase  32.43 
 
 		 188 aa  67.4  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000274502  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0119  integrase family protein  33.11 
 
 		 209 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0772  integrase family protein  33.11 
 
 		 209 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3467  integrase family protein  32.03 
 
 		 197 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0824  phage integrase family protein  32.03 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.917981  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3817  integrase family protein  29.24 
 
 		 210 aa  66.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.736864  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1950  phage integrase family protein  30.72 
 
 		 197 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.827298  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0791  integrase family protein  32.68 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.334688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3357  integrase family protein  33.11 
 
 		 209 aa  65.1  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.276444  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6236  integrase family protein  31.14 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06813  integrase  32.68 
 
 		 197 aa  64.3  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2232  integrase family protein  29.89 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.394376  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2240  integrase family protein  29.89 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000448435  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0811  Phage integrase  29.49 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4474  integrase family protein  28.66 
 
 		 198 aa  61.2  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4790  integrase family protein  30.67 
 
 		 209 aa  59.7  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2776  phage integrase  30.66 
 
 		 316 aa  59.3  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0149476  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0251  phage integrase family protein  32.48 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.705292 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0217  phage integrase family protein  30.07 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2386  integrase family protein  29.49 
 
 		 208 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5964  Phage integrase  27.45 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2339  integrase family protein  28.14 
 
 		 210 aa  57.4  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0020288 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2062  phage integrase family site specific recombinase  27.71 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.27505  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2569  phage integrase family protein  28.03 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0769947 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3034  integrase family protein  28.85 
 
 		 206 aa  54.7  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.155662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2590  hypothetical protein  27.54 
 
 		 210 aa  54.7  0.0000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0020859 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3446  phage integrase family protein  30.82 
 
 		 163 aa  53.9  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.993422  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0998  phage integrase family protein  29.41 
 
 		 215 aa  52.8  0.000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00570052  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2102  integrase family protein  28.74 
 
 		 193 aa  53.1  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2164  phage integrase family protein  28.75 
 
 		 198 aa  52.4  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3791  phage integrase family site specific recombinase  48.89 
 
 		 208 aa  52  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0452484 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3208  phage integrase family protein  27.15 
 
 		 204 aa  52  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0839313  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2267  phage integrase family protein  29.03 
 
 		 210 aa  52  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.783329  normal  0.401703 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1978  phage integrase family protein  48.89 
 
 		 238 aa  52  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00595062 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1123  phage integrase family protein  30.25 
 
 		 198 aa  51.6  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1181  phage integrase family protein  30.25 
 
 		 198 aa  51.6  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.820562  normal  0.553114 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3899  phage integrase family protein  30.25 
 
 		 198 aa  51.6  0.000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.97558 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3118  phage integrase  27.74 
 
 		 210 aa  50.8  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0365  hypothetical protein  39.68 
 
 		 103 aa  49.7  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2237  site-specific recombinase XerD-like  27.59 
 
 		 225 aa  50.4  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0311543  normal  0.392069 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0378  integrase family protein  28 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5359  integrase family protein  31.65 
 
 		 204 aa  48.9  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.13733 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2682  integrase family protein  29.63 
 
 		 193 aa  48.5  0.00006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0418  integrase family protein  26.67 
 
 		 328 aa  48.5  0.00006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0307048  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4348  integrase  46.51 
 
 		 51 aa  48.1  0.00008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0257445  hitchhiker  9.10332e-17 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1654  site-specific tyrosine recombinase XerC  30 
 
 		 330 aa  47.4  0.0001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000234006  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6093  integrase family protein  27.22 
 
 		 210 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.61747  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1343  phage integrase family site specific recombinase  24.67 
 
 		 179 aa  46.6  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.311312  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>