288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1950 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1950  phage integrase family protein  100 
 
 		 197 aa  407  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.827298  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0824  phage integrase family protein  90.36 
 
 		 197 aa  371  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.917981  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3467  integrase family protein  89.85 
 
 		 197 aa  369  1e-101  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06813  integrase  83.67 
 
 		 197 aa  341  4e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2164  phage integrase family protein  66.84 
 
 		 198 aa  268  5.9999999999999995e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1123  phage integrase family protein  66.84 
 
 		 198 aa  266  1e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1181  phage integrase family protein  66.84 
 
 		 198 aa  266  1e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.820562  normal  0.553114 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3899  phage integrase family protein  66.84 
 
 		 198 aa  266  1e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.97558 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2062  phage integrase family site specific recombinase  62.05 
 
 		 198 aa  252  3e-66  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.27505  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0251  phage integrase family protein  62.83 
 
 		 198 aa  251  5.000000000000001e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.705292 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2569  phage integrase family protein  60.94 
 
 		 198 aa  248  6e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0769947 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4474  integrase family protein  60.94 
 
 		 198 aa  241  3e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2386  integrase family protein  53.37 
 
 		 208 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0811  Phage integrase  52.85 
 
 		 208 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3208  phage integrase family protein  53.89 
 
 		 204 aa  217  8.999999999999998e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0839313  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1729  phage integrase family protein  52.85 
 
 		 207 aa  215  2.9999999999999998e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.425016  normal  0.48456 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5964  Phage integrase  52.33 
 
 		 208 aa  214  7e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3034  integrase family protein  50.78 
 
 		 206 aa  209  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.155662  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6236  integrase family protein  50 
 
 		 207 aa  203  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3791  phage integrase family site specific recombinase  49.74 
 
 		 208 aa  202  3e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0452484 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3118  phage integrase  49.22 
 
 		 210 aa  197  9e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2339  integrase family protein  50.78 
 
 		 210 aa  195  3e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0020288 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2267  phage integrase family protein  47.67 
 
 		 210 aa  190  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.783329  normal  0.401703 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3817  integrase family protein  44.56 
 
 		 210 aa  190  1e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.736864  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0772  integrase family protein  45.6 
 
 		 209 aa  189  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0791  integrase family protein  46.11 
 
 		 209 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.334688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2590  hypothetical protein  47.42 
 
 		 210 aa  186  2e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0020859 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3357  integrase family protein  45.6 
 
 		 209 aa  185  4e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.276444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0119  integrase family protein  45.6 
 
 		 209 aa  184  6e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4790  integrase family protein  44.56 
 
 		 209 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0217  phage integrase family protein  46.11 
 
 		 200 aa  179  2e-44  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3446  phage integrase family protein  58.11 
 
 		 163 aa  176  1e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.993422  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1978  phage integrase family protein  47.98 
 
 		 238 aa  171  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00595062 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0658  phage integrase protein  44.27 
 
 		 210 aa  171  5e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5291  integrase family protein  42.71 
 
 		 210 aa  164  8e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6093  integrase family protein  42.71 
 
 		 210 aa  164  8e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.61747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6083  integrase family protein  41.67 
 
 		 210 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0153  phage integrase family site specific recombinase  53.54 
 
 		 141 aa  140  9e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.246008  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1287  integrase family protein  38.02 
 
 		 203 aa  139  3e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0261  putative tyrosine recombinase XerD  43.15 
 
 		 175 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4334  phage integrase family protein  41.33 
 
 		 173 aa  118  6e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0365  hypothetical protein  56.32 
 
 		 103 aa  105  4e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0280  phage integrase family site specific recombinase  70.31 
 
 		 66 aa  96.7  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0001  site-specific recombinase  29.08 
 
 		 190 aa  86.7  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0790  hypothetical protein  41.44 
 
 		 130 aa  82.4  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.517667  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3459  hypothetical protein  69.23 
 
 		 55 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1167  hypothetical protein  44.74 
 
 		 78 aa  68.6  0.00000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.347632 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6970  hypothetical protein  60.78 
 
 		 88 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1165  integrase family protein  27.61 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3811  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  27.33 
 
 		 180 aa  65.9  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0141622  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3517  phage integrase family protein  30.72 
 
 		 188 aa  65.5  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4099  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  27.33 
 
 		 169 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0377  integrase family protein  30.72 
 
 		 186 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000239772 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1255  integrase family protein  28.72 
 
 		 186 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2576  hypothetical protein  42.03 
 
 		 89 aa  65.1  0.0000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0652  DNA integration/recombination/invertion protein  27.17 
 
 		 180 aa  65.1  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0577  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  25.49 
 
 		 180 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010724  Nther_2955  integrase family protein  27.6 
 
 		 187 aa  63.5  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.819146  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4009  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  26.8 
 
 		 180 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1368  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  26.8 
 
 		 180 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.358053 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2711  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  27.74 
 
 		 180 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0042219  normal  0.247582 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2613  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  27.17 
 
 		 180 aa  61.6  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.301879  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3599  integrase family protein  27.17 
 
 		 180 aa  62  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.616601  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1166  hypothetical protein  47.27 
 
 		 76 aa  60.1  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.347632 
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5345  integrase family protein  26.97 
 
 		 182 aa  58.9  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0728  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.52 
 
 		 330 aa  58.5  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.442089  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4392  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  26.14 
 
 		 180 aa  58.2  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1590  phage integrase family site specific recombinase  27.08 
 
 		 182 aa  57.8  0.00000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000133866  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2953  phage integrase family site specific recombinase  25.77 
 
 		 186 aa  57.8  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.603832  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2230  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  25.47 
 
 		 180 aa  57  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1654  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.33 
 
 		 330 aa  56.6  0.0000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000234006  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001839  site-specific recombinase phage integrase family  27.6 
 
 		 186 aa  55.5  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0017  prophage integration/recombination/invertion protein  28.39 
 
 		 190 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000444728  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2232  integrase family protein  26.71 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.394376  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2240  integrase family protein  26.71 
 
 		 197 aa  55.1  0.0000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000448435  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3590  integrase family protein  25.31 
 
 		 189 aa  54.3  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.0592429  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0341  tyrosine recombinase XerC  27.75 
 
 		 317 aa  53.9  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000100724  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0144  tyrosine recombinase XerD  28.05 
 
 		 305 aa  53.1  0.000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3453  integrase family protein  26.49 
 
 		 189 aa  53.5  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.590005  normal  0.791222 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2709  integrase family protein  26.09 
 
 		 210 aa  53.5  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000251547  n/a   
 
 
-
 
NC_008696  Tpen_1891  phage integrase family protein  35.42 
 
 		 278 aa  53.5  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1859  prophage LambdaSa2, site-specific recombinase phage integrase family protein  27.33 
 
 		 180 aa  52.8  0.000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00377207  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0174  integrase family protein  24.39 
 
 		 186 aa  52.4  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00273109  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A08  integrase  28.67 
 
 		 195 aa  52.4  0.000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000000003137  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3451  integrase family protein  27.27 
 
 		 186 aa  52  0.000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0127606  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3458  tyrosine recombinase XerD  31.93 
 
 		 303 aa  52  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.664548  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0401  integrase family protein  27.33 
 
 		 304 aa  51.6  0.000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.966282 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0196  integrase family protein  29.49 
 
 		 328 aa  50.4  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000565414 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0519  phage integrase family protein  26.97 
 
 		 300 aa  50.4  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.24612  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0164  DNA integration/recombination/inversion protein  27.14 
 
 		 190 aa  50.1  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0167632  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1189  integrase family protein  26.07 
 
 		 297 aa  50.1  0.00002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000203109  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3147  Tn554-related, transposase A  38.16 
 
 		 372 aa  49.3  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.85236  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0242  Tn554-related, transposase A  38.16 
 
 		 519 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1468  phage integrase family protein  35.37 
 
 		 304 aa  49.7  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3450  tyrosine recombinase XerD  26 
 
 		 322 aa  49.3  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4855  site-specific recombinase, phage integrase family  23.78 
 
 		 188 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0815  integrase family protein  23.76 
 
 		 183 aa  48.9  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3474  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.78 
 
 		 296 aa  48.9  0.00005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.486058 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0602  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.03 
 
 		 324 aa  48.9  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926796 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0412  integrase  26.63 
 
 		 190 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0192917  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>