59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0280 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0280  phage integrase family site specific recombinase  100 
 
 		 66 aa  132  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4474  integrase family protein  98.46 
 
 		 198 aa  130  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2062  phage integrase family site specific recombinase  86.15 
 
 		 198 aa  113  6.9999999999999995e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.27505  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2569  phage integrase family protein  88.71 
 
 		 198 aa  110  6e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0769947 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06813  integrase  70.77 
 
 		 197 aa  102  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1729  phage integrase family protein  69.84 
 
 		 207 aa  101  4e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.425016  normal  0.48456 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5964  Phage integrase  67.69 
 
 		 208 aa  100  8e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0811  Phage integrase  70.97 
 
 		 208 aa  99.8  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6236  integrase family protein  70.31 
 
 		 207 aa  98.6  2e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2386  integrase family protein  66.15 
 
 		 208 aa  99  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3791  phage integrase family site specific recombinase  69.35 
 
 		 208 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0452484 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3208  phage integrase family protein  67.69 
 
 		 204 aa  97.8  4e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0839313  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3034  integrase family protein  69.35 
 
 		 206 aa  97.4  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.155662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1978  phage integrase family protein  69.35 
 
 		 238 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00595062 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3446  phage integrase family protein  65.62 
 
 		 163 aa  96.7  9e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.993422  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2339  integrase family protein  66.15 
 
 		 210 aa  96.3  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0020288 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3467  integrase family protein  70.31 
 
 		 197 aa  96.7  1e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0824  phage integrase family protein  70.31 
 
 		 197 aa  96.7  1e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.917981  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1950  phage integrase family protein  70.31 
 
 		 197 aa  96.7  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.827298  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0251  phage integrase family protein  66.13 
 
 		 198 aa  94.4  5e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.705292 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0365  hypothetical protein  70.97 
 
 		 103 aa  94  6e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2164  phage integrase family protein  69.84 
 
 		 198 aa  94  6e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1123  phage integrase family protein  69.84 
 
 		 198 aa  93.6  7e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1181  phage integrase family protein  69.84 
 
 		 198 aa  93.6  7e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.820562  normal  0.553114 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3899  phage integrase family protein  69.84 
 
 		 198 aa  93.6  7e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.97558 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6083  integrase family protein  66.15 
 
 		 210 aa  93.6  9e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3118  phage integrase  64.62 
 
 		 210 aa  92.8  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6093  integrase family protein  67.74 
 
 		 210 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.61747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5291  integrase family protein  67.74 
 
 		 210 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2590  hypothetical protein  66.15 
 
 		 210 aa  90.5  8e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0020859 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3817  integrase family protein  61.54 
 
 		 210 aa  89.4  1e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.736864  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0217  phage integrase family protein  63.64 
 
 		 200 aa  89.7  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3357  integrase family protein  64.52 
 
 		 209 aa  89  2e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.276444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0658  phage integrase protein  63.08 
 
 		 210 aa  89  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0772  integrase family protein  66.13 
 
 		 209 aa  88.6  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0119  integrase family protein  64.52 
 
 		 209 aa  87.4  6e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0791  integrase family protein  64.52 
 
 		 209 aa  87  9e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.334688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1287  integrase family protein  60 
 
 		 203 aa  86.3  1e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2267  phage integrase family protein  59.68 
 
 		 210 aa  85.1  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.783329  normal  0.401703 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4790  integrase family protein  59.68 
 
 		 209 aa  83.2  0.000000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1167  hypothetical protein  53.7 
 
 		 78 aa  63.5  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.347632 
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0001  site-specific recombinase  36.21 
 
 		 190 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3517  phage integrase family protein  38.78 
 
 		 188 aa  45.4  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0377  integrase family protein  38.78 
 
 		 186 aa  45.4  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000239772 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1554  integrase family protein  33.33 
 
 		 339 aa  44.7  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.86595  decreased coverage  0.00111318 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0271  site-specific tyrosine recombinase XerC  42 
 
 		 351 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.28022  normal  0.462537 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0177  site-specific tyrosine recombinase XerC  42 
 
 		 323 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0553  site-specific tyrosine recombinase XerC  42 
 
 		 329 aa  42  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.172687  normal  0.167276 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0401  site-specific tyrosine recombinase XerC  42 
 
 		 324 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.145415 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1255  integrase family protein  38 
 
 		 186 aa  41.6  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1654  site-specific tyrosine recombinase XerC  42.55 
 
 		 330 aa  41.2  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000234006  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11080  phage integrase family protein  47.62 
 
 		 310 aa  41.2  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0105178  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0401  integrase family protein  38.71 
 
 		 304 aa  40.8  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.966282 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0536  site-specific tyrosine recombinase XerC  40 
 
 		 300 aa  40.8  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.538013  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0758  phage integrase family protein  36.73 
 
 		 304 aa  40.8  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.000222973  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3077  integrase family protein  37.25 
 
 		 242 aa  40.4  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.486947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0426  site-specific tyrosine recombinase XerC  42.55 
 
 		 321 aa  40.8  0.007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0728  site-specific tyrosine recombinase XerC  42 
 
 		 330 aa  40.4  0.008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.442089  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0337  Integrase  36.54 
 
 		 311 aa  40  0.01  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.180562  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>