More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_2569 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_2569  phage integrase family protein  100 
 
 		 198 aa  402  1e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0769947 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2062  phage integrase family site specific recombinase  81.31 
 
 		 198 aa  336  1.9999999999999998e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.27505  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4474  integrase family protein  74.24 
 
 		 198 aa  289  2e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2164  phage integrase family protein  62.12 
 
 		 198 aa  260  8e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0824  phage integrase family protein  64.06 
 
 		 197 aa  254  8e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.917981  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3467  integrase family protein  64.06 
 
 		 197 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1123  phage integrase family protein  60.61 
 
 		 198 aa  251  4.0000000000000004e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1181  phage integrase family protein  60.61 
 
 		 198 aa  251  4.0000000000000004e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.820562  normal  0.553114 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3899  phage integrase family protein  60.61 
 
 		 198 aa  251  4.0000000000000004e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.97558 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06813  integrase  62.18 
 
 		 197 aa  249  2e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1950  phage integrase family protein  60.94 
 
 		 197 aa  248  6e-65  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.827298  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1729  phage integrase family protein  57.14 
 
 		 207 aa  244  4.9999999999999997e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.425016  normal  0.48456 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0251  phage integrase family protein  56.06 
 
 		 198 aa  233  1.0000000000000001e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.705292 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3034  integrase family protein  55.61 
 
 		 206 aa  230  1e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.155662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2386  integrase family protein  54.12 
 
 		 208 aa  228  3e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0811  Phage integrase  54.64 
 
 		 208 aa  228  6e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3208  phage integrase family protein  55.67 
 
 		 204 aa  226  2e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0839313  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6236  integrase family protein  53.33 
 
 		 207 aa  225  3e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5964  Phage integrase  54.12 
 
 		 208 aa  224  7e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3791  phage integrase family site specific recombinase  54.36 
 
 		 208 aa  220  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0452484 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2339  integrase family protein  51.55 
 
 		 210 aa  213  9.999999999999999e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0020288 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3118  phage integrase  51.28 
 
 		 210 aa  212  2.9999999999999995e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2590  hypothetical protein  51.3 
 
 		 210 aa  211  7.999999999999999e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0020859 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0791  integrase family protein  50 
 
 		 209 aa  208  5e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.334688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0772  integrase family protein  48.45 
 
 		 209 aa  207  6e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4790  integrase family protein  48.21 
 
 		 209 aa  205  4e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0119  integrase family protein  48.97 
 
 		 209 aa  204  5e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6093  integrase family protein  48.72 
 
 		 210 aa  203  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.61747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5291  integrase family protein  48.72 
 
 		 210 aa  202  2e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3357  integrase family protein  48.97 
 
 		 209 aa  202  3e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.276444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6083  integrase family protein  47.69 
 
 		 210 aa  201  8e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0217  phage integrase family protein  51.79 
 
 		 200 aa  197  7.999999999999999e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2267  phage integrase family protein  45.88 
 
 		 210 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.783329  normal  0.401703 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0658  phage integrase protein  47.69 
 
 		 210 aa  193  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1978  phage integrase family protein  52.6 
 
 		 238 aa  191  6e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00595062 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3817  integrase family protein  43.81 
 
 		 210 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.736864  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0153  phage integrase family site specific recombinase  66.67 
 
 		 141 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.246008  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1287  integrase family protein  42.64 
 
 		 203 aa  170  1e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3446  phage integrase family protein  54.73 
 
 		 163 aa  167  9e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.993422  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0261  putative tyrosine recombinase XerD  49.02 
 
 		 175 aa  158  4e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4334  phage integrase family protein  44.16 
 
 		 173 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0280  phage integrase family site specific recombinase  88.71 
 
 		 66 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0365  hypothetical protein  60.47 
 
 		 103 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0790  hypothetical protein  41.24 
 
 		 130 aa  80.5  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.517667  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1167  hypothetical protein  44.87 
 
 		 78 aa  71.2  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.347632 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2576  hypothetical protein  47.06 
 
 		 89 aa  70.9  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0001  site-specific recombinase  26.23 
 
 		 190 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0174  integrase family protein  30.67 
 
 		 186 aa  70.1  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00273109  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6970  hypothetical protein  52.83 
 
 		 88 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3590  integrase family protein  29.3 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.0592429  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1166  hypothetical protein  46.67 
 
 		 76 aa  65.9  0.0000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.347632 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3599  integrase family protein  31.21 
 
 		 180 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.616601  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1368  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  29.88 
 
 		 180 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.358053 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4009  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  28.12 
 
 		 180 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3453  integrase family protein  29.22 
 
 		 189 aa  64.7  0.0000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.590005  normal  0.791222 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0652  DNA integration/recombination/invertion protein  26.25 
 
 		 180 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2815  integrase/recombinase XerD  25.32 
 
 		 311 aa  62.8  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3459  hypothetical protein  60.78 
 
 		 55 aa  63.2  0.000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2711  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  27.44 
 
 		 180 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0042219  normal  0.247582 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1531  phage integrase family protein  25.17 
 
 		 311 aa  62.4  0.000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.504949 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2613  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  27.5 
 
 		 180 aa  62  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.301879  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1481  phage integrase family protein  25.95 
 
 		 311 aa  61.6  0.000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0281722  normal  0.205606 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A08  integrase  29.8 
 
 		 195 aa  61.2  0.000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000000003137  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0998  phage integrase family protein  30.46 
 
 		 215 aa  60.8  0.00000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00570052  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1590  phage integrase family site specific recombinase  29.33 
 
 		 182 aa  59.7  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000133866  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2348  phage integrase family protein  26.44 
 
 		 301 aa  58.9  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5345  integrase family protein  30.41 
 
 		 182 aa  58.9  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010724  Nther_2955  integrase family protein  26.99 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.819146  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3811  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  26.09 
 
 		 180 aa  58.5  0.00000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0141622  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4099  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  26.09 
 
 		 169 aa  58.5  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1428  phage integrase  26.58 
 
 		 317 aa  58.2  0.00000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.473602  normal  0.0585003 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0728  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.65 
 
 		 330 aa  58.2  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.442089  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1720  tyrosine recombinase XerD  27.14 
 
 		 319 aa  56.6  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.514315 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0377  integrase family protein  29.94 
 
 		 186 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000239772 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2709  integrase family protein  26.09 
 
 		 210 aa  57  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000251547  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0577  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  24.22 
 
 		 180 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2230  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  26.71 
 
 		 180 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2953  phage integrase family site specific recombinase  25.88 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.603832  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3517  phage integrase family protein  28.03 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1145  tyrosine recombinase, phage integrase family  28.57 
 
 		 301 aa  55.8  0.0000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00135559  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1611  tyrosine recombinase  25.32 
 
 		 308 aa  55.5  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3451  integrase family protein  30.32 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0127606  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0967  integrase family protein  28.57 
 
 		 373 aa  55.1  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6957  integrase family protein  28.76 
 
 		 292 aa  54.3  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2232  integrase family protein  27.67 
 
 		 197 aa  54.3  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.394376  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3629  integrase family protein  28.22 
 
 		 290 aa  53.9  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3661  integrase family protein  28.22 
 
 		 290 aa  53.9  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.311976  decreased coverage  0.00000149049 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2240  integrase family protein  27.67 
 
 		 197 aa  54.3  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000448435  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1255  integrase family protein  27.78 
 
 		 186 aa  54.3  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  28.99 
 
 		 295 aa  54.3  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7462  integrase family protein  28.76 
 
 		 292 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.105755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0015  Phage integrase  29.22 
 
 		 310 aa  53.1  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.230922  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7619  integrase family protein  28.76 
 
 		 292 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.192826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0822  putative phage integrase  27.98 
 
 		 291 aa  53.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.341397 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6605  integrase family protein  28.76 
 
 		 292 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3062  site-specific tyrosine recombinase XerD  27.14 
 
 		 308 aa  53.9  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0602  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.97 
 
 		 324 aa  52.8  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00926796 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4806  phage integrase  28.3 
 
 		 291 aa  52.8  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.92941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0687  Phage integrase  29.87 
 
 		 310 aa  52.8  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.004827  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1902  phage integrase  25 
 
 		 293 aa  52.8  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>