51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0790 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0790  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  267  5e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.517667  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0658  phage integrase protein  76.64 
 
 		 210 aa  165  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4334  phage integrase family protein  74.77 
 
 		 173 aa  160  8.000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6083  integrase family protein  61.68 
 
 		 210 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6093  integrase family protein  61.11 
 
 		 210 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.61747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5291  integrase family protein  58.88 
 
 		 210 aa  134  4e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6236  integrase family protein  58.24 
 
 		 207 aa  107  8.000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0261  putative tyrosine recombinase XerD  53.68 
 
 		 175 aa  106  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2590  hypothetical protein  53.85 
 
 		 210 aa  104  5e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0020859 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0217  phage integrase family protein  52.22 
 
 		 200 aa  103  8e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3034  integrase family protein  54.84 
 
 		 206 aa  103  9e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.155662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1729  phage integrase family protein  54.84 
 
 		 207 aa  102  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.425016  normal  0.48456 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2339  integrase family protein  46.49 
 
 		 210 aa  102  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0020288 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0811  Phage integrase  51.58 
 
 		 208 aa  102  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1287  integrase family protein  63.04 
 
 		 203 aa  102  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0772  integrase family protein  50.53 
 
 		 209 aa  101  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0119  integrase family protein  52.13 
 
 		 209 aa  101  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4790  integrase family protein  52.13 
 
 		 209 aa  100  5e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0791  integrase family protein  50.53 
 
 		 209 aa  99.8  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.334688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3357  integrase family protein  53.26 
 
 		 209 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.276444  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3791  phage integrase family site specific recombinase  53.68 
 
 		 208 aa  98.6  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0452484 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3118  phage integrase  52.17 
 
 		 210 aa  98.2  3e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3208  phage integrase family protein  50.53 
 
 		 204 aa  97.8  5e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0839313  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5964  Phage integrase  46.32 
 
 		 208 aa  96.7  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2386  integrase family protein  47.31 
 
 		 208 aa  94  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3817  integrase family protein  53.19 
 
 		 210 aa  93.2  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.736864  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2267  phage integrase family protein  47.83 
 
 		 210 aa  90.9  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.783329  normal  0.401703 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2062  phage integrase family site specific recombinase  45.05 
 
 		 198 aa  86.3  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.27505  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0824  phage integrase family protein  46.07 
 
 		 197 aa  85.1  3e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.917981  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3467  integrase family protein  46.07 
 
 		 197 aa  85.1  3e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1978  phage integrase family protein  52.5 
 
 		 238 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00595062 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06813  integrase  44.94 
 
 		 197 aa  83.2  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1950  phage integrase family protein  41.44 
 
 		 197 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.827298  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2164  phage integrase family protein  44.94 
 
 		 198 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1123  phage integrase family protein  44.94 
 
 		 198 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3899  phage integrase family protein  44.94 
 
 		 198 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.97558 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1181  phage integrase family protein  44.94 
 
 		 198 aa  80.9  0.000000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.820562  normal  0.553114 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2569  phage integrase family protein  41.24 
 
 		 198 aa  80.5  0.000000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0769947 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0251  phage integrase family protein  41.76 
 
 		 198 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.705292 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0153  phage integrase family site specific recombinase  43.96 
 
 		 141 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.246008  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4474  integrase family protein  43.96 
 
 		 198 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1787  hypothetical protein  66 
 
 		 79 aa  67.8  0.00000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0121442  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2576  hypothetical protein  45.33 
 
 		 89 aa  67.4  0.00000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1166  hypothetical protein  56.36 
 
 		 76 aa  67  0.00000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.347632 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6970  hypothetical protein  44.9 
 
 		 88 aa  47.4  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0652  DNA integration/recombination/invertion protein  36.14 
 
 		 180 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2613  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  34.57 
 
 		 180 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.301879  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2711  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  35.21 
 
 		 180 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0042219  normal  0.247582 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3459  hypothetical protein  50 
 
 		 55 aa  41.6  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4009  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  33.8 
 
 		 180 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0438  phage integrase, N-terminus  31.33 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0989457  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>