77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_0261 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_0261  putative tyrosine recombinase XerD  100 
 
 		 175 aa  363  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1729  phage integrase family protein  66.67 
 
 		 207 aa  231  5e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.425016  normal  0.48456 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3034  integrase family protein  69.81 
 
 		 206 aa  229  2e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.155662  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6236  integrase family protein  68.83 
 
 		 207 aa  221  3e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5964  Phage integrase  62.21 
 
 		 208 aa  220  9e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0811  Phage integrase  65.43 
 
 		 208 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3791  phage integrase family site specific recombinase  66.88 
 
 		 208 aa  218  3e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0452484 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2386  integrase family protein  62.99 
 
 		 208 aa  206  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2339  integrase family protein  59.75 
 
 		 210 aa  200  8e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0020288 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0772  integrase family protein  62.25 
 
 		 209 aa  196  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3208  phage integrase family protein  59.46 
 
 		 204 aa  196  1.0000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0839313  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2267  phage integrase family protein  58.82 
 
 		 210 aa  195  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.783329  normal  0.401703 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2590  hypothetical protein  56.21 
 
 		 210 aa  194  4.0000000000000005e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0020859 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4790  integrase family protein  60.93 
 
 		 209 aa  192  3e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3357  integrase family protein  60.93 
 
 		 209 aa  191  4e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.276444  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3118  phage integrase  53.99 
 
 		 210 aa  191  6e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0119  integrase family protein  60.26 
 
 		 209 aa  190  7e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0791  integrase family protein  58.94 
 
 		 209 aa  187  5.999999999999999e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.334688  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6083  integrase family protein  56.49 
 
 		 210 aa  184  6e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6093  integrase family protein  55.84 
 
 		 210 aa  183  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.61747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5291  integrase family protein  55.19 
 
 		 210 aa  182  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1978  phage integrase family protein  60.54 
 
 		 238 aa  177  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00595062 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0217  phage integrase family protein  56.76 
 
 		 200 aa  176  1e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0658  phage integrase protein  53.64 
 
 		 210 aa  175  3e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4334  phage integrase family protein  54.3 
 
 		 173 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3817  integrase family protein  55.41 
 
 		 210 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.736864  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2062  phage integrase family site specific recombinase  50 
 
 		 198 aa  162  2.0000000000000002e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.27505  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2569  phage integrase family protein  49.02 
 
 		 198 aa  158  3e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0769947 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1287  integrase family protein  50 
 
 		 203 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4474  integrase family protein  49.02 
 
 		 198 aa  148  5e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2164  phage integrase family protein  46.75 
 
 		 198 aa  143  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06813  integrase  44.22 
 
 		 197 aa  142  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1123  phage integrase family protein  45.45 
 
 		 198 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1181  phage integrase family protein  45.45 
 
 		 198 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.820562  normal  0.553114 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3899  phage integrase family protein  45.45 
 
 		 198 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.97558 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1950  phage integrase family protein  43.15 
 
 		 197 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.827298  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0824  phage integrase family protein  42.86 
 
 		 197 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.917981  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3467  integrase family protein  42.86 
 
 		 197 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0251  phage integrase family protein  41.5 
 
 		 198 aa  122  3e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.705292 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0153  phage integrase family site specific recombinase  48.46 
 
 		 141 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.246008  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0790  hypothetical protein  53.68 
 
 		 130 aa  106  2e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.517667  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3446  phage integrase family protein  42 
 
 		 163 aa  90.9  9e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.993422  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1166  hypothetical protein  61.54 
 
 		 76 aa  89.4  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.347632 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2576  hypothetical protein  55.88 
 
 		 89 aa  83.2  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6970  hypothetical protein  64.81 
 
 		 88 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1167  hypothetical protein  55.56 
 
 		 78 aa  65.1  0.0000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.347632 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0174  integrase family protein  28.57 
 
 		 186 aa  63.9  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00273109  n/a   
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0001  site-specific recombinase  36 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1165  integrase family protein  28.99 
 
 		 187 aa  62  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0365  hypothetical protein  77.14 
 
 		 103 aa  61.2  0.000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5345  integrase family protein  35 
 
 		 182 aa  58.2  0.00000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2232  integrase family protein  26.12 
 
 		 197 aa  51.2  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.394376  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2240  integrase family protein  26.12 
 
 		 197 aa  51.2  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000448435  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3590  integrase family protein  26.62 
 
 		 189 aa  50.4  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.0592429  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3453  integrase family protein  27.34 
 
 		 189 aa  49.7  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.590005  normal  0.791222 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4855  site-specific recombinase, phage integrase family  26.32 
 
 		 188 aa  49.7  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0728  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.92 
 
 		 330 aa  49.3  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.442089  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1333  Integrase  30.21 
 
 		 400 aa  48.1  0.00005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.455073  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1804  Integrase  30.21 
 
 		 400 aa  48.1  0.00006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.222465  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0312  Integrase  30.21 
 
 		 400 aa  48.1  0.00006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0150741  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0032  Integrase  30.21 
 
 		 400 aa  48.1  0.00006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.857579  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3451  integrase family protein  23.91 
 
 		 186 aa  48.1  0.00006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0127606  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0382  site-specific recombinase, phage integrase family  25.56 
 
 		 188 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1634  integrase family protein  32.5 
 
 		 354 aa  47.4  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.280587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1007  site-specific recombinase  28.26 
 
 		 183 aa  46.6  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.22552e-63 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2271  phage integrase family protein  29.92 
 
 		 321 aa  46.2  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A08  integrase  26.98 
 
 		 195 aa  45.4  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000000003137  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1428  phage integrase  26.15 
 
 		 317 aa  45.1  0.0006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.473602  normal  0.0585003 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1654  site-specific tyrosine recombinase XerC  22.9 
 
 		 330 aa  44.3  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000234006  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0815  integrase family protein  27.54 
 
 		 183 aa  43.5  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0788  phage integrase family protein  27.34 
 
 		 293 aa  43.1  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1590  phage integrase family site specific recombinase  29.06 
 
 		 182 aa  43.1  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000133866  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1787  hypothetical protein  39.53 
 
 		 79 aa  42.4  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0121442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3459  hypothetical protein  45.65 
 
 		 55 aa  42.4  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2815  integrase/recombinase XerD  26.77 
 
 		 311 aa  42  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1611  tyrosine recombinase  28 
 
 		 308 aa  41.6  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2484  phage integrase  25.6 
 
 		 304 aa  41.2  0.007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.72317  normal  0.0269236 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>