45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6970 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6970  hypothetical protein  100 
 
 		 88 aa  180  7e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2386  integrase family protein  87.3 
 
 		 208 aa  118  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0811  Phage integrase  82.76 
 
 		 208 aa  106  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5964  Phage integrase  73.44 
 
 		 208 aa  100  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3208  phage integrase family protein  66.67 
 
 		 204 aa  87.4  6e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0839313  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6236  integrase family protein  68.97 
 
 		 207 aa  87  7e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1729  phage integrase family protein  60 
 
 		 207 aa  84.3  4e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.425016  normal  0.48456 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3034  integrase family protein  64.81 
 
 		 206 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.155662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0772  integrase family protein  53.85 
 
 		 209 aa  82.4  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0791  integrase family protein  60.71 
 
 		 209 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.334688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2590  hypothetical protein  54.41 
 
 		 210 aa  80.5  0.000000000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0020859 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3357  integrase family protein  55.56 
 
 		 209 aa  79.7  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.276444  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4790  integrase family protein  58.93 
 
 		 209 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3817  integrase family protein  55.56 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.736864  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0261  putative tyrosine recombinase XerD  64.81 
 
 		 175 aa  76.3  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0119  integrase family protein  57.14 
 
 		 209 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3118  phage integrase  55.17 
 
 		 210 aa  75.9  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3791  phage integrase family site specific recombinase  55.56 
 
 		 208 aa  75.5  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0452484 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2339  integrase family protein  59.62 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0020288 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2267  phage integrase family protein  51.72 
 
 		 210 aa  71.2  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.783329  normal  0.401703 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2164  phage integrase family protein  60.38 
 
 		 198 aa  70.1  0.000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3899  phage integrase family protein  58.49 
 
 		 198 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.97558 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06813  integrase  60.78 
 
 		 197 aa  68.6  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1123  phage integrase family protein  58.49 
 
 		 198 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1181  phage integrase family protein  58.49 
 
 		 198 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.820562  normal  0.553114 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1950  phage integrase family protein  60.78 
 
 		 197 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.827298  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0217  phage integrase family protein  50 
 
 		 200 aa  67.4  0.00000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1166  hypothetical protein  45.45 
 
 		 76 aa  67.4  0.00000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.347632 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2062  phage integrase family site specific recombinase  55.77 
 
 		 198 aa  66.2  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.27505  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2569  phage integrase family protein  52.83 
 
 		 198 aa  66.2  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0769947 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3467  integrase family protein  58.82 
 
 		 197 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0824  phage integrase family protein  58.82 
 
 		 197 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.917981  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2576  hypothetical protein  47.17 
 
 		 89 aa  61.2  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0658  phage integrase protein  50 
 
 		 210 aa  61.2  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3459  hypothetical protein  52.83 
 
 		 55 aa  58.5  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0251  phage integrase family protein  50 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.705292 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4334  phage integrase family protein  48.21 
 
 		 173 aa  55.8  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0153  phage integrase family site specific recombinase  60 
 
 		 141 aa  55.1  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.246008  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1287  integrase family protein  42.65 
 
 		 203 aa  54.3  0.0000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6093  integrase family protein  46.43 
 
 		 210 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.61747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6083  integrase family protein  46.43 
 
 		 210 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5291  integrase family protein  46.43 
 
 		 210 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4474  integrase family protein  58.33 
 
 		 198 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0790  hypothetical protein  44.9 
 
 		 130 aa  47.4  0.00006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.517667  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1978  phage integrase family protein  60.71 
 
 		 238 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00595062 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>