More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2062 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2062  phage integrase family site specific recombinase  100 
 
 		 198 aa  404  1.0000000000000001e-112  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.27505  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2569  phage integrase family protein  81.31 
 
 		 198 aa  336  1.9999999999999998e-91  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0769947 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4474  integrase family protein  73.23 
 
 		 198 aa  288  2e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2164  phage integrase family protein  63.13 
 
 		 198 aa  262  2e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0824  phage integrase family protein  63.54 
 
 		 197 aa  254  5e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.917981  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3467  integrase family protein  63.54 
 
 		 197 aa  254  6e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1123  phage integrase family protein  61.62 
 
 		 198 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1181  phage integrase family protein  61.62 
 
 		 198 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.820562  normal  0.553114 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3899  phage integrase family protein  61.62 
 
 		 198 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.97558 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1950  phage integrase family protein  62.05 
 
 		 197 aa  252  3e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.827298  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06813  integrase  60.2 
 
 		 197 aa  249  2e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6236  integrase family protein  56.41 
 
 		 207 aa  240  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1729  phage integrase family protein  56.41 
 
 		 207 aa  240  1e-62  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.425016  normal  0.48456 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0251  phage integrase family protein  59.89 
 
 		 198 aa  237  6.999999999999999e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.705292 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3208  phage integrase family protein  57.65 
 
 		 204 aa  237  6.999999999999999e-62  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0839313  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0811  Phage integrase  55.15 
 
 		 208 aa  236  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3034  integrase family protein  55.67 
 
 		 206 aa  232  3e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.155662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2386  integrase family protein  53.61 
 
 		 208 aa  230  1e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5964  Phage integrase  53.33 
 
 		 208 aa  228  4e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3791  phage integrase family site specific recombinase  53.85 
 
 		 208 aa  222  2e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0452484 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2339  integrase family protein  53.06 
 
 		 210 aa  222  3e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0020288 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3357  integrase family protein  49.74 
 
 		 209 aa  218  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.276444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0119  integrase family protein  49.74 
 
 		 209 aa  218  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4790  integrase family protein  48.21 
 
 		 209 aa  216  2e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0772  integrase family protein  48.72 
 
 		 209 aa  214  5e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0791  integrase family protein  49.23 
 
 		 209 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.334688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0217  phage integrase family protein  53.3 
 
 		 200 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3118  phage integrase  50.26 
 
 		 210 aa  211  5.999999999999999e-54  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2590  hypothetical protein  51.03 
 
 		 210 aa  208  4e-53  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0020859 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2267  phage integrase family protein  47.18 
 
 		 210 aa  202  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.783329  normal  0.401703 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6083  integrase family protein  46.67 
 
 		 210 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6093  integrase family protein  46.67 
 
 		 210 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.61747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3817  integrase family protein  46.39 
 
 		 210 aa  198  3e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.736864  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5291  integrase family protein  46.67 
 
 		 210 aa  198  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0658  phage integrase protein  48.21 
 
 		 210 aa  198  5e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1978  phage integrase family protein  53.76 
 
 		 238 aa  198  5e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00595062 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1287  integrase family protein  44.9 
 
 		 203 aa  176  1e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0153  phage integrase family site specific recombinase  65.91 
 
 		 141 aa  175  3e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.246008  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3446  phage integrase family protein  54.73 
 
 		 163 aa  173  9.999999999999999e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.993422  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0261  putative tyrosine recombinase XerD  50 
 
 		 175 aa  162  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4334  phage integrase family protein  45.45 
 
 		 173 aa  143  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0280  phage integrase family site specific recombinase  86.15 
 
 		 66 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0365  hypothetical protein  60.47 
 
 		 103 aa  112  3e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0790  hypothetical protein  45.05 
 
 		 130 aa  86.3  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.517667  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2576  hypothetical protein  50 
 
 		 89 aa  80.9  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0001  site-specific recombinase  30 
 
 		 190 aa  76.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1167  hypothetical protein  48.53 
 
 		 78 aa  71.6  0.000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.347632 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3459  hypothetical protein  69.09 
 
 		 55 aa  71.6  0.000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1166  hypothetical protein  51.72 
 
 		 76 aa  69.7  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.347632 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1590  phage integrase family site specific recombinase  30.86 
 
 		 182 aa  67.4  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000133866  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1368  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  29.09 
 
 		 180 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.358053 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2815  integrase/recombinase XerD  26.58 
 
 		 311 aa  67  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0652  DNA integration/recombination/invertion protein  27.68 
 
 		 180 aa  67  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6970  hypothetical protein  55.77 
 
 		 88 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4009  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  27.88 
 
 		 180 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1481  phage integrase family protein  26.58 
 
 		 311 aa  65.1  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0281722  normal  0.205606 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3590  integrase family protein  29.05 
 
 		 189 aa  64.7  0.0000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.0592429  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0174  integrase family protein  29.53 
 
 		 186 aa  63.9  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00273109  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2613  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  29.94 
 
 		 180 aa  63.5  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.301879  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0998  phage integrase family protein  28.18 
 
 		 215 aa  63.5  0.000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00570052  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3599  integrase family protein  29.94 
 
 		 180 aa  63.2  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.616601  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2711  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  28.57 
 
 		 180 aa  63.2  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0042219  normal  0.247582 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1531  phage integrase family protein  25 
 
 		 311 aa  62.4  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.504949 
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5345  integrase family protein  28.9 
 
 		 182 aa  62  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3453  integrase family protein  29.73 
 
 		 189 aa  62  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.590005  normal  0.791222 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1428  phage integrase  27.61 
 
 		 317 aa  60.5  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.473602  normal  0.0585003 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A08  integrase  28.29 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000000003137  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0728  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.33 
 
 		 330 aa  60.5  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.442089  n/a   
 
 
-
 
NC_010724  Nther_2955  integrase family protein  28.32 
 
 		 187 aa  58.9  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.819146  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3811  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  28.1 
 
 		 180 aa  58.5  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0141622  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4099  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  28.1 
 
 		 169 aa  58.2  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0377  integrase family protein  28.31 
 
 		 186 aa  57.8  0.00000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000239772 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1720  tyrosine recombinase XerD  28.57 
 
 		 319 aa  57.8  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.514315 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3517  phage integrase family protein  27.71 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0752  phage integrase family site specific recombinase  27.95 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.232674  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1902  phage integrase  26.85 
 
 		 293 aa  56.6  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.162765  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0577  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  25.49 
 
 		 180 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2383  tyrosine recombinase XerD  26.03 
 
 		 295 aa  55.5  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2230  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  28.1 
 
 		 180 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2240  integrase family protein  27.5 
 
 		 197 aa  54.7  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000448435  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2232  integrase family protein  27.5 
 
 		 197 aa  54.7  0.0000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.394376  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3700  integrase family protein  27.37 
 
 		 295 aa  54.7  0.0000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2953  phage integrase family site specific recombinase  27.92 
 
 		 186 aa  53.5  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.603832  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2484  phage integrase  25 
 
 		 304 aa  53.1  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.72317  normal  0.0269236 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1611  tyrosine recombinase  27.74 
 
 		 308 aa  53.5  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1255  integrase family protein  25.82 
 
 		 186 aa  53.1  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0039  tyrosine recombinase XerD  27.52 
 
 		 312 aa  53.9  0.000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1859  prophage LambdaSa2, site-specific recombinase phage integrase family protein  28.77 
 
 		 180 aa  53.1  0.000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00377207  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2348  phage integrase family protein  26.34 
 
 		 301 aa  52.8  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2709  integrase family protein  28.66 
 
 		 210 aa  53.1  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000251547  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1797  phage integrase  27.86 
 
 		 303 aa  53.1  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.742134 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8452  integrase family protein  28.67 
 
 		 286 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.032039  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1694  phage integrase family protein  29.49 
 
 		 212 aa  52  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.470129  normal  0.0225811 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1995  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.83 
 
 		 302 aa  52.4  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0262  integrase family protein  27.08 
 
 		 291 aa  52  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0341  tyrosine recombinase XerC  29.94 
 
 		 317 aa  52  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000100724  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0106  phage integrase family protein  30.59 
 
 		 295 aa  52  0.000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0952  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.78 
 
 		 329 aa  51.6  0.000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1145  tyrosine recombinase, phage integrase family  28.73 
 
 		 301 aa  51.6  0.000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00135559  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3451  integrase family protein  29.22 
 
 		 186 aa  51.6  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0127606  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>