40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3459 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3459  hypothetical protein  100 
 
 		 55 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0251  phage integrase family protein  88.1 
 
 		 198 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.705292 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06813  integrase  69.23 
 
 		 197 aa  72  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1950  phage integrase family protein  69.23 
 
 		 197 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.827298  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2062  phage integrase family site specific recombinase  69.09 
 
 		 198 aa  71.6  0.000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.27505  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3467  integrase family protein  69.23 
 
 		 197 aa  72  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0824  phage integrase family protein  69.23 
 
 		 197 aa  72  0.000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.917981  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2164  phage integrase family protein  68 
 
 		 198 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3899  phage integrase family protein  66 
 
 		 198 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.97558 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1123  phage integrase family protein  66 
 
 		 198 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1181  phage integrase family protein  66 
 
 		 198 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.820562  normal  0.553114 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2569  phage integrase family protein  60.78 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0769947 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6970  hypothetical protein  52.83 
 
 		 88 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5964  Phage integrase  54 
 
 		 208 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6236  integrase family protein  58.7 
 
 		 207 aa  54.3  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0811  Phage integrase  55.1 
 
 		 208 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2386  integrase family protein  55.1 
 
 		 208 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2590  hypothetical protein  54.35 
 
 		 210 aa  51.6  0.000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0020859 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3208  phage integrase family protein  50 
 
 		 204 aa  52  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0839313  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1729  phage integrase family protein  50 
 
 		 207 aa  50.8  0.000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.425016  normal  0.48456 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0153  phage integrase family site specific recombinase  65.38 
 
 		 141 aa  50.1  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.246008  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3034  integrase family protein  56.52 
 
 		 206 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.155662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0217  phage integrase family protein  47.06 
 
 		 200 aa  48.5  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3357  integrase family protein  46.94 
 
 		 209 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.276444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2339  integrase family protein  52.17 
 
 		 210 aa  47.4  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0020288 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0119  integrase family protein  46.94 
 
 		 209 aa  47.4  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0791  integrase family protein  46.94 
 
 		 209 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.334688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3118  phage integrase  45.1 
 
 		 210 aa  46.6  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3791  phage integrase family site specific recombinase  53.33 
 
 		 208 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0452484 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1166  hypothetical protein  51.11 
 
 		 76 aa  46.2  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.347632 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4790  integrase family protein  44.9 
 
 		 209 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4474  integrase family protein  60 
 
 		 198 aa  45.1  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0772  integrase family protein  45.65 
 
 		 209 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2267  phage integrase family protein  45.65 
 
 		 210 aa  42.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.783329  normal  0.401703 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0658  phage integrase protein  45.65 
 
 		 210 aa  43.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0261  putative tyrosine recombinase XerD  45.65 
 
 		 175 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4334  phage integrase family protein  45.65 
 
 		 173 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2576  hypothetical protein  41.18 
 
 		 89 aa  42.7  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3817  integrase family protein  47.37 
 
 		 210 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.736864  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0790  hypothetical protein  50 
 
 		 130 aa  41.6  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.517667  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>