146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_0217 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0217  phage integrase family protein  100 
 
 		 200 aa  411  1e-114  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6236  integrase family protein  61.73 
 
 		 207 aa  263  1e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3034  integrase family protein  61.73 
 
 		 206 aa  259  3e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.155662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0811  Phage integrase  60.2 
 
 		 208 aa  258  4e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5964  Phage integrase  60.2 
 
 		 208 aa  256  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1729  phage integrase family protein  59.3 
 
 		 207 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.425016  normal  0.48456 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2339  integrase family protein  61.81 
 
 		 210 aa  250  1e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0020288 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3791  phage integrase family site specific recombinase  60.61 
 
 		 208 aa  249  3e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0452484 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2386  integrase family protein  57.65 
 
 		 208 aa  247  7e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0772  integrase family protein  59.9 
 
 		 209 aa  245  3e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3208  phage integrase family protein  59.18 
 
 		 204 aa  243  9.999999999999999e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0839313  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3357  integrase family protein  58.16 
 
 		 209 aa  236  2e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.276444  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0119  integrase family protein  57.65 
 
 		 209 aa  236  2e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0791  integrase family protein  56.63 
 
 		 209 aa  231  5e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.334688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3118  phage integrase  56.92 
 
 		 210 aa  231  6e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1978  phage integrase family protein  58.33 
 
 		 238 aa  231  8.000000000000001e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00595062 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4790  integrase family protein  55.9 
 
 		 209 aa  229  2e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2590  hypothetical protein  55.38 
 
 		 210 aa  228  6e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0020859 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2267  phage integrase family protein  55.84 
 
 		 210 aa  226  2e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.783329  normal  0.401703 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3817  integrase family protein  54.08 
 
 		 210 aa  224  7e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.736864  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2062  phage integrase family site specific recombinase  53.3 
 
 		 198 aa  213  1.9999999999999998e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.27505  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6093  integrase family protein  50.26 
 
 		 210 aa  206  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.61747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6083  integrase family protein  49.74 
 
 		 210 aa  206  3e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0658  phage integrase protein  49.23 
 
 		 210 aa  205  4e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5291  integrase family protein  49.23 
 
 		 210 aa  201  4e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2569  phage integrase family protein  51.79 
 
 		 198 aa  197  7.999999999999999e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0769947 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2164  phage integrase family protein  49.23 
 
 		 198 aa  191  8e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1123  phage integrase family protein  48.72 
 
 		 198 aa  187  8e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1181  phage integrase family protein  48.72 
 
 		 198 aa  187  8e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.820562  normal  0.553114 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3899  phage integrase family protein  48.72 
 
 		 198 aa  187  8e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.97558 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1287  integrase family protein  48.98 
 
 		 203 aa  186  2e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3467  integrase family protein  48.66 
 
 		 197 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0824  phage integrase family protein  48.66 
 
 		 197 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.917981  n/a   
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4474  integrase family protein  51.79 
 
 		 198 aa  180  1e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1950  phage integrase family protein  46.11 
 
 		 197 aa  179  2e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.827298  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06813  integrase  45.31 
 
 		 197 aa  178  4e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0251  phage integrase family protein  48.13 
 
 		 198 aa  178  4.999999999999999e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.705292 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0261  putative tyrosine recombinase XerD  56.76 
 
 		 175 aa  176  1e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4334  phage integrase family protein  47.71 
 
 		 173 aa  153  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2576  hypothetical protein  81.18 
 
 		 89 aa  131  6e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3446  phage integrase family protein  42.47 
 
 		 163 aa  131  6.999999999999999e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.993422  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0365  hypothetical protein  70 
 
 		 103 aa  120  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0790  hypothetical protein  52.22 
 
 		 130 aa  103  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.517667  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0153  phage integrase family site specific recombinase  45.74 
 
 		 141 aa  93.6  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.246008  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0280  phage integrase family site specific recombinase  63.64 
 
 		 66 aa  89.7  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1167  hypothetical protein  52 
 
 		 78 aa  79.7  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.347632 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1166  hypothetical protein  58.62 
 
 		 76 aa  78.2  0.00000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.347632 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2613  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  31.21 
 
 		 180 aa  71.6  0.000000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.301879  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2232  integrase family protein  29.94 
 
 		 197 aa  69.3  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.394376  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2240  integrase family protein  29.94 
 
 		 197 aa  69.3  0.00000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000448435  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1368  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  30.57 
 
 		 180 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.358053 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3599  integrase family protein  28.66 
 
 		 180 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.616601  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4009  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  29.94 
 
 		 180 aa  68.2  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2711  prophage LambdaBa04, site-specific recombinase, phage integrase family  29.75 
 
 		 180 aa  67.8  0.00000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0042219  normal  0.247582 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6970  hypothetical protein  50 
 
 		 88 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0174  integrase family protein  29.45 
 
 		 186 aa  65.9  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00273109  n/a   
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0001  site-specific recombinase  27.66 
 
 		 190 aa  65.5  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.149945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3590  integrase family protein  27.71 
 
 		 189 aa  64.7  0.0000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.0592429  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0652  DNA integration/recombination/invertion protein  27.39 
 
 		 180 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2230  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  29.94 
 
 		 180 aa  63.2  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5345  integrase family protein  31.48 
 
 		 182 aa  62  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0377  integrase family protein  30.72 
 
 		 186 aa  61.6  0.000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000239772 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4392  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  30.07 
 
 		 180 aa  61.2  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1859  prophage LambdaSa2, site-specific recombinase phage integrase family protein  30 
 
 		 180 aa  60.5  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00377207  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3517  phage integrase family protein  30.07 
 
 		 188 aa  59.7  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3453  integrase family protein  29.88 
 
 		 189 aa  58.5  0.00000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.590005  normal  0.791222 
 
 
-
 
NC_010724  Nther_2955  integrase family protein  27.12 
 
 		 187 aa  58.5  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.819146  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1165  integrase family protein  24.68 
 
 		 187 aa  57  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3811  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  27.39 
 
 		 180 aa  55.1  0.0000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0141622  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4099  prophage lambdaba02, site-specific recombinase phage integrase family protein protein  27.39 
 
 		 169 aa  54.7  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0577  prophage LambdaBa02, site-specific recombinase, phage integrase family  26.8 
 
 		 180 aa  54.3  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2286  phage integrase  26.71 
 
 		 188 aa  52.8  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000274502  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1255  integrase family protein  26.67 
 
 		 186 aa  52.4  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1694  phage integrase family protein  28.21 
 
 		 212 aa  52.4  0.000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.470129  normal  0.0225811 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1254  phage integrase family protein  29.49 
 
 		 186 aa  52.4  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.709211 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3451  integrase family protein  27.91 
 
 		 186 aa  52  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0127606  n/a   
 
 
-
 
NC_012790  GWCH70_3470  integrase family protein  30.97 
 
 		 182 aa  52.4  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1590  phage integrase family site specific recombinase  26.49 
 
 		 182 aa  51.2  0.000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000133866  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0998  phage integrase family protein  28.48 
 
 		 215 aa  51.6  0.000009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00570052  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2953  phage integrase family site specific recombinase  24.84 
 
 		 186 aa  49.3  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.603832  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1448  phage integrase family site specific recombinase  26.92 
 
 		 188 aa  49.3  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1771  phage integrase family protein  26.92 
 
 		 204 aa  49.7  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.753085 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1799  phage integrase family protein  26.92 
 
 		 204 aa  49.3  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.968459  normal  0.396821 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0728  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.15 
 
 		 330 aa  49.3  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.442089  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0644  phage integrase family protein  26.49 
 
 		 186 aa  49.3  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0659  phage integrase family protein  26.49 
 
 		 186 aa  49.3  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.271524  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3829  site-specific recombinase, phage integrase family  26.58 
 
 		 176 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000329942 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2876  integrase family protein  27.33 
 
 		 241 aa  48.5  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4494  phage integrase family site specific recombinase  25.29 
 
 		 188 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0017  prophage integration/recombination/invertion protein  29.19 
 
 		 190 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000444728  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3459  hypothetical protein  47.06 
 
 		 55 aa  48.5  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001839  site-specific recombinase phage integrase family  23.66 
 
 		 186 aa  48.1  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A08  integrase  27.5 
 
 		 195 aa  48.1  0.00008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000000003137  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0262  integrase family protein  26.59 
 
 		 291 aa  48.1  0.00009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4806  phage integrase  24.86 
 
 		 291 aa  47.4  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.92941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0822  putative phage integrase  24.87 
 
 		 291 aa  47.8  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.341397 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11080  phage integrase family protein  28.14 
 
 		 310 aa  47.4  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0105178  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0815  integrase family protein  28 
 
 		 183 aa  47.8  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6657  integrase family protein  27.72 
 
 		 291 aa  47.4  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.358251 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1077  integrase family protein  27.72 
 
 		 291 aa  47.4  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>