More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2876 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2876  integrase family protein  100 
 
 		 241 aa  493  9.999999999999999e-139  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2804  integrase family protein  95.85 
 
 		 241 aa  451  1.0000000000000001e-126  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.000180357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0969  integrase family protein  93.36 
 
 		 245 aa  432  1e-120  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0781  integrase family protein  95.12 
 
 		 205 aa  377  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0719  integrase family protein  94.15 
 
 		 205 aa  374  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0829  integrase family protein  69.01 
 
 		 213 aa  306  2.0000000000000002e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0640  integrase family protein  68.54 
 
 		 213 aa  303  1.0000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0590  integrase family protein  68.54 
 
 		 213 aa  301  8.000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1018  integrase family protein  69.86 
 
 		 209 aa  296  2e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2709  integrase family protein  26.9 
 
 		 210 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000251547  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0912  integrase/recombinase  31.77 
 
 		 304 aa  74.3  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0261382  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1914  integrase/recombinase  32.12 
 
 		 304 aa  73.9  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00100079  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3796  phage integrase family protein  31.77 
 
 		 304 aa  74.3  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4502  integrase family protein  34.16 
 
 		 290 aa  73.6  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1390  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.77 
 
 		 328 aa  72.8  0.000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000179914  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0660  integrase family protein  29.53 
 
 		 284 aa  71.2  0.00000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4806  phage integrase  29.03 
 
 		 291 aa  69.7  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.92941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4524  Phage integrase  29.23 
 
 		 310 aa  65.5  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0772  phage integrase  29.5 
 
 		 304 aa  65.5  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.672054 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0952  site-specific tyrosine recombinase XerC  30.46 
 
 		 329 aa  65.1  0.0000000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5964  Phage integrase  30.89 
 
 		 208 aa  65.1  0.0000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1654  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.22 
 
 		 330 aa  65.1  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000234006  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1179  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.38 
 
 		 450 aa  63.9  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.0000000142279  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10100  site-specific recombinase XerD  30.29 
 
 		 332 aa  63.9  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  26.32 
 
 		 298 aa  63.2  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1366  site-specific tyrosine recombinase XerC  29.38 
 
 		 450 aa  62.8  0.000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000415693  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0325  tyrosine recombinase XerC  27.92 
 
 		 297 aa  62.4  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0262  integrase family protein  30.18 
 
 		 291 aa  62  0.000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3453  integrase family protein  28.57 
 
 		 189 aa  62  0.000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.590005  normal  0.791222 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4696  integrase family protein  29.74 
 
 		 306 aa  62  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00307  site-specific tyrosine recombinase XerC  26.78 
 
 		 313 aa  61.6  0.000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  27.81 
 
 		 290 aa  62  0.000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1839  phage integrase family protein  26.46 
 
 		 193 aa  61.2  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.637517  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002113  tyrosine recombinase XerC  26.23 
 
 		 310 aa  60.5  0.00000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02665  site-specific tyrosine recombinase XerD  29.57 
 
 		 336 aa  60.8  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4135  site-specific tyrosine recombinase XerC  28.24 
 
 		 300 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.383086  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0704  integrase family protein  26.42 
 
 		 305 aa  60.1  0.00000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000143659  unclonable  0.0000000274126 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1729  phage integrase family protein  29.94 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.425016  normal  0.48456 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0728  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.5 
 
 		 330 aa  60.1  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.442089  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8452  integrase family protein  31.35 
 
 		 286 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.032039  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1431  phage integrase  27.81 
 
 		 309 aa  59.7  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.145363  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3550  integrase family protein  27.98 
 
 		 324 aa  59.7  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.74971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1028  tyrosine recombinase XerD subunit  27.89 
 
 		 313 aa  59.3  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00856798  unclonable  0.00000000634873 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1639  integrase family protein  28.09 
 
 		 301 aa  59.3  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0514216  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0861  integrase/recombinase XerC  27.18 
 
 		 304 aa  58.9  0.00000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1196  phage integrase  27.6 
 
 		 291 aa  59.3  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0811  Phage integrase  31.07 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3139  phage integrase family protein  27.32 
 
 		 344 aa  59.3  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.424721  normal  0.214127 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  24.35 
 
 		 295 aa  58.5  0.00000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4076  phage integrase  27.07 
 
 		 298 aa  58.5  0.00000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1547  phage integrase family protein  28.82 
 
 		 336 aa  58.9  0.00000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.268843 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1201  site-specific tyrosine recombinase XerD  25.54 
 
 		 321 aa  58.5  0.00000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731595  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2812  integrase family protein  26.42 
 
 		 188 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2207  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.06 
 
 		 319 aa  58.5  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.787262  normal  0.257716 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  25.62 
 
 		 295 aa  58.2  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  25.81 
 
 		 309 aa  58.2  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2339  integrase family protein  28.22 
 
 		 210 aa  58.2  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0020288 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3629  integrase family protein  30.38 
 
 		 290 aa  58.2  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3661  integrase family protein  30.38 
 
 		 290 aa  58.2  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.311976  decreased coverage  0.00000149049 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0394  tyrosine recombinase XerC  26.23 
 
 		 299 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4164  site-specific tyrosine recombinase XerC  25.68 
 
 		 311 aa  57.8  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.154418  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0393  tyrosine recombinase XerC  26.23 
 
 		 299 aa  57.8  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.426652 
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3590  integrase family protein  28.16 
 
 		 189 aa  58.2  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  normal  0.0592429  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  29.67 
 
 		 302 aa  58.5  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1326  integrase family protein  28.73 
 
 		 309 aa  57.4  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.847423  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3631  tyrosine recombinase XerC  26.23 
 
 		 299 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.465228 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0185  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.73 
 
 		 302 aa  57.4  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.182372  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4127  tyrosine recombinase XerC  26.15 
 
 		 301 aa  57  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.442069 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11170  site-specific recombinase XerD  27.91 
 
 		 336 aa  57  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0225756  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.92 
 
 		 296 aa  57  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.92 
 
 		 296 aa  57  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0128  site-specific tyrosine recombinase XerC  25 
 
 		 303 aa  56.6  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.742386  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.92 
 
 		 296 aa  57  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2344  phage integrase  27.75 
 
 		 322 aa  56.6  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0456613  normal  0.219342 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.92 
 
 		 296 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0736  integrase/recombinase  26.34 
 
 		 337 aa  57  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0788  phage integrase family protein  25.5 
 
 		 293 aa  57  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2489  tyrosine recombinase XerD  26.8 
 
 		 318 aa  56.6  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189208  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.37 
 
 		 296 aa  57  0.0000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0159  integrase family protein  28.42 
 
 		 295 aa  57  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.37 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.37 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  26.37 
 
 		 296 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2509  integrase family protein  29.52 
 
 		 380 aa  56.6  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.593152  normal  0.73908 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.73 
 
 		 296 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.73 
 
 		 296 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2471  tyrosine recombinase XerC subunit  29.52 
 
 		 308 aa  56.2  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340389  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0074  site-specific tyrosine recombinase XerC  27.32 
 
 		 307 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1617  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.62 
 
 		 330 aa  56.2  0.0000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000155402  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2210  integrase family protein  30.86 
 
 		 295 aa  55.8  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000241024 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3396  site-specific tyrosine recombinase XerD  24.37 
 
 		 298 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3245  phage integrase family protein  27.68 
 
 		 312 aa  56.2  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.676462  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1619  phage integrase family protein  30.53 
 
 		 286 aa  56.2  0.0000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0184  site-specific tyrosine recombinase XerC  24.02 
 
 		 303 aa  55.8  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.72736  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3243  tyrosine recombinase XerC subunit  27.73 
 
 		 335 aa  55.8  0.0000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0273  tyrosine recombinase XerC  26.11 
 
 		 300 aa  55.5  0.0000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.007038  normal  0.809464 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0198  tyrosine recombinase XerC subunit  22.78 
 
 		 291 aa  55.5  0.0000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0021573 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3012  tyrosine recombinase XerD subunit  25.54 
 
 		 295 aa  55.8  0.0000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146868  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0500  integrase family protein  26.94 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011668  Sbal223_4474  integrase family protein  29.45 
 
 		 198 aa  55.5  0.0000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>