More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2207 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_2207  site-specific tyrosine recombinase XerC  100 
 
 		 319 aa  629  1e-179  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.787262  normal  0.257716 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4135  site-specific tyrosine recombinase XerC  87 
 
 		 300 aa  507  9.999999999999999e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.383086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1970  site-specific tyrosine recombinase XerC  84.23 
 
 		 300 aa  499  1e-140  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.397741 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1990  site-specific tyrosine recombinase XerC  84.23 
 
 		 300 aa  498  1e-140  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2036  site-specific tyrosine recombinase XerC  84.23 
 
 		 300 aa  498  1e-140  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0541579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12908  site-specific tyrosine recombinase XerC  81.88 
 
 		 298 aa  449  1e-125  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000436053  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1654  integrase family protein  64.67 
 
 		 298 aa  354  1e-96  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09860  tyrosine recombinase XerC subunit  57.37 
 
 		 329 aa  351  1e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2102  integrase family protein  65.99 
 
 		 304 aa  341  1e-92  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.167189  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5914  integrase family protein  61.13 
 
 		 325 aa  338  8e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000658468  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2471  tyrosine recombinase XerC subunit  57.62 
 
 		 308 aa  326  2.0000000000000001e-88  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0340389  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3245  phage integrase family protein  58.75 
 
 		 312 aa  326  3e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.676462  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2210  integrase family protein  56.76 
 
 		 295 aa  320  1.9999999999999998e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000241024 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0989  integrase family protein  56.86 
 
 		 292 aa  306  2.0000000000000002e-82  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0618431 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3115  integrase family protein  56.47 
 
 		 336 aa  301  1e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0082342  normal  0.151412 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3995  integrase family protein  62.58 
 
 		 311 aa  292  5e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1317  phage integrase family protein  56.07 
 
 		 325 aa  291  1e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0674  site-specific tyrosine recombinase XerC  57.43 
 
 		 303 aa  285  5.999999999999999e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23640  tyrosine recombinase XerC subunit  51.85 
 
 		 310 aa  277  2e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.154193  normal  0.0993098 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2509  integrase family protein  52.98 
 
 		 380 aa  276  3e-73  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.593152  normal  0.73908 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2194  integrase family protein  53.54 
 
 		 317 aa  273  2.0000000000000002e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.103281  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09270  tyrosine recombinase XerC subunit  50.76 
 
 		 346 aa  270  2e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.111586  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0235  integrase family protein  54.88 
 
 		 289 aa  268  7e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1481  integrase family protein  54.08 
 
 		 308 aa  268  7e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.141471  normal  0.0727308 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1547  phage integrase family protein  49.55 
 
 		 336 aa  268  8.999999999999999e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.268843 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11170  site-specific recombinase XerD  48.81 
 
 		 336 aa  263  2e-69  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0225756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1159  integrase family protein  53.97 
 
 		 344 aa  262  6e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.226555 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0251  site-specific tyrosine recombinase XerC  44.13 
 
 		 355 aa  257  2e-67  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00631913  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1178  integrase family protein  55.41 
 
 		 329 aa  247  2e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.801835  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0485  site-specific tyrosine recombinase XerC  44.12 
 
 		 322 aa  245  6e-64  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.853028 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1208  integrase family protein  50.71 
 
 		 363 aa  245  8e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10100  site-specific recombinase XerD  46.77 
 
 		 332 aa  243  3e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4012  tyrosine recombinase XerC  42.72 
 
 		 294 aa  239  4e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00152232  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3583  phage integrase  52.08 
 
 		 385 aa  224  2e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0487  tyrosine recombinase XerC  43.24 
 
 		 293 aa  222  6e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000269064 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0470  tyrosine recombinase XerC  42.91 
 
 		 293 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1001  integrase family protein  40 
 
 		 333 aa  217  2e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1525  integrase family protein  45.81 
 
 		 327 aa  215  8e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.206219  hitchhiker  0.00883097 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  44.55 
 
 		 302 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  35.67 
 
 		 295 aa  211  1e-53  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  36 
 
 		 295 aa  210  2e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2695  tyrosine recombinase XerC  45.85 
 
 		 342 aa  210  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.400065  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0842  hypothetical protein  37.8 
 
 		 290 aa  210  2e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3654  site-specific tyrosine recombinase XerC  36.39 
 
 		 301 aa  209  3e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000489449  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0492  phage integrase family site specific recombinase  43.39 
 
 		 294 aa  209  5e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0248661  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  36.67 
 
 		 298 aa  209  7e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  37.5 
 
 		 307 aa  207  2e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2788  tyrosine recombinase XerC  44.92 
 
 		 343 aa  207  2e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0114244  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_623  site-specific recombinase  37.84 
 
 		 307 aa  207  2e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  37.84 
 
 		 307 aa  207  2e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  36 
 
 		 296 aa  207  2e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1314  site-specific tyrosine recombinase XerC  36.3 
 
 		 299 aa  207  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000019497  unclonable  8.39468e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3873  site-specific tyrosine recombinase XerC  36.3 
 
 		 299 aa  207  3e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00557083  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3590  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.97 
 
 		 299 aa  205  7e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0796955  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3929  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.97 
 
 		 299 aa  205  8e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3878  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.97 
 
 		 299 aa  205  8e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000107327  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3042  tyrosine recombinase XerD subunit  42.62 
 
 		 294 aa  205  9e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000138339  normal  0.959316 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2881  tyrosine recombinase XerC  44.59 
 
 		 343 aa  204  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.312354  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3682  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.97 
 
 		 299 aa  204  1e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.245295  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3572  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.97 
 
 		 299 aa  205  1e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000685052  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3969  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.97 
 
 		 299 aa  204  1e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000391393  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  35.14 
 
 		 296 aa  204  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3843  site-specific tyrosine recombinase XerC  35.97 
 
 		 299 aa  205  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.24 
 
 		 299 aa  203  3e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09590  tyrosine recombinase XerD  41.72 
 
 		 302 aa  203  3e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0503565 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1996  site-specific tyrosine recombinase XerC  38.26 
 
 		 300 aa  202  5e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2689  tyrosine recombinase XerC  43.33 
 
 		 311 aa  202  6e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.147909 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  41.78 
 
 		 294 aa  202  7e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  36.79 
 
 		 295 aa  202  8e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.8 
 
 		 296 aa  202  9e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.8 
 
 		 296 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.8 
 
 		 296 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.8 
 
 		 296 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.8 
 
 		 296 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.8 
 
 		 296 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.8 
 
 		 296 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.8 
 
 		 296 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.8 
 
 		 296 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0602  phage integrase family protein  41.53 
 
 		 317 aa  201  1.9999999999999998e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00243284  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1554  tyrosine recombinase XerD  35.23 
 
 		 295 aa  200  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1585  tyrosine recombinase XerD  35.23 
 
 		 295 aa  200  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  34.46 
 
 		 296 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1202  tyrosine recombinase XerC  43.14 
 
 		 304 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.910177  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2346  tyrosine recombinase XerC  39.2 
 
 		 302 aa  200  3e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.126195  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2105  tyrosine recombinase XerD  43.48 
 
 		 297 aa  200  3e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.179497  hitchhiker  0.00877552 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08760  tyrosine recombinase XerD  41.28 
 
 		 309 aa  199  7e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.940341  unclonable  0.00000000128305 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3714  tyrosine recombinase XerD  38.46 
 
 		 301 aa  199  7e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0967  integrase family protein  37.86 
 
 		 373 aa  199  7e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  34.33 
 
 		 297 aa  198  7.999999999999999e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0341  tyrosine recombinase XerC  42.52 
 
 		 317 aa  198  7.999999999999999e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000100724  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  36.96 
 
 		 302 aa  198  9e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  36.75 
 
 		 302 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2483  site-specific tyrosine recombinase XerC  34.65 
 
 		 299 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000855714  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1827  tyrosine recombinase XerD  38.67 
 
 		 306 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1241  tyrosine recombinase XerD  43.37 
 
 		 311 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.657845  normal  0.578091 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1201  site-specific tyrosine recombinase XerD  43.17 
 
 		 321 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731595  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1225  integrase family protein  37.62 
 
 		 301 aa  197  3e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.103765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  37.09 
 
 		 302 aa  196  3e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  35.57 
 
 		 302 aa  197  3e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1118  tyrosine recombinase XerD  37.92 
 
 		 304 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>